Systematické hodnocení systémového inženýrství modelu lidských explantátů (SEEDLING)

Personalizovaná terapie je stále jedním z velkých cílů onkologie. S ohledem na úspěšnost terapií inhibitory kontrolních bodů u vybraných solidních nádorů zůstává otázkou, proč ostatní nádorová onemocnění nereagují na terapii stejně. To se však neomezuje pouze na imunoterapie. V zásadě bylo pochopení dynamických změn v pacientově tkáni dosud velmi omezené, a to jak pro predikci úspěchu terapie, tak s ohledem na mechanické pochopení toho, jak terapie funguje. Modelové systémy nemocí jsou často zvířecí modely, které reprodukují složitost multiorgánového systému, ale vykazují významné rozdíly vůči lidem na úrovni tkání, a proto mají jen malou vypovídací hodnotu. Experimenty na buněčných kulturách mají naopak jen malou vypovídací hodnotu o celkovém chování tkáně nebo dokonce orgánu nebo o chorobné situaci. "Naturalistická" kokultura v Petriho misce (jako například s organoidními systémy) neumožňuje žádné rozumné přenositelné poznatky, i když jsou použity komplexní buněčné kompozice fibroblastů, endotelu nebo imunitních buněk. Naproti tomu u modelů nádorů in vivo existuje další problém: buď chybí flexibilita s ohledem na strukturální kontext, nebo druhově specifické vlastnosti systému neumožňují vyvozovat žádné závěry o situaci u lidí. To je masivní omezení, zejména pro translatologická studia. Námi vyvinutý systém tumorových explantátů umožňuje zachovat strukturální integritu tkáňového kontextu v kontextu získání biopsie nebo odstranění resekce. Takto získaný vzorek tkáně je udržován v rovnováze prostřednictvím bioreaktoru a může být tak použit pro testy nebo je konzervován v kontextu tkáně. Je také možné ve smyslu personalizované diagnostiky a terapie zohlednit individuální šířku pásma složení nádorového mikroprostředí. Tento přístup byl již ověřen v prospektivní studii a byla prokázána přenositelnost výsledků z explantačních modelů na člověka. V této situaci systematická konstrukce explantačních modelů pro jiné nádorové entity a využití těchto modelů pro vývoj terapie a pro lepší pochopení patoregulace ve tkáních. Kromě vzorků tkáně darovaných účastníky studie lze pro testování tkáně použít také krevní buňky pochopit základní vzorce reakcí tkáně na terapie.