- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk forsøg NCT02540941
Protokolludvikling for enkeltcelle-genomik og deres implementering for molekylær mangfoldighed mellem celler
Efterforskerne vil udtrække enkeltceller og analysere den molekylære sammensætning af enkeltceller såvel som bulks ved hjælp af de nyeste protokoller for enkeltcelle- og bulk genomiske analyser, herunder genetiske, epigenetiske, transkriptomiske og proteomiske analyser ved hjælp af de seneste tilgængelige protokoller. En bred liste over sådanne eksempelprotokoller er anført nedenfor.
Prøverne og deres molekylære karakterisering (inklusive sekventering og molekylære niveauer) vil tjene som grundlag for udvikling af metoder til enkeltcelleanalyse. De udviklede metoder er rettet mod genomisk transkriptomisk, epigenetisk eller proteomisk analyse af enkeltceller og deler den samme struktur: det målte træk vil blive oversat til et DNA-bibliotek, som vil repræsentere træk ved et dedikeret assay.
Dette bibliotek sammen med korrekt matematisk analyse af sekventeringsresultaterne vil blive udført for at afslutte den ønskede funktion. Den generelle struktur af sådanne protokoller er beskrevet i vores gennemgangspapir (Enkeltcelle-sekventeringsbaserede teknologier vil revolutionere helorganismevidenskab, E. Shapiro, T. Biezuner & S.Linnarsson, Nature Reviews Genetics 14, 618-630, 2013) som er vedhæftet vores forslag.
Derudover vil forskerne bruge sekventeringsbaserede metoder (eksisterende og fremtidigt udviklede) til at sammenligne enkelte celler og bulks fra forskellige væv og/eller forskellige tidspunkter fra den samme donor for at måle genetisk, epigenetisk, transkriptomisk og proteomisk diversitet .
Studieoversigt
Undersøgelsestype
Tilmelding (Forventet)
Kontakter og lokationer
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Køn, der er berettiget til at studere
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
Voksne
Ekskluderingskriterier:
- Ikke
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
Måling af enkeltcellevariabilitet ved hjælp af enkeltcellet genomik
Tidsramme: 5 år
|
Individuelle celleprøver fra flere væv, muligvis på flere tidspunkter, vil blive karakteriseret ved hjælp af avancerede enkeltcellede genomiske protokoller.
De genomiske, transkriptomiske og epigenomiske signaturer af cellerne vil blive målt.
Genomiske signaturer vil blive brugt til at etablere slægtsrelationer mellem celler.
Transkriptomiske og epigenomiske signaturer vil blive brugt til at karakterisere celletype og funktionel tilstand.
Statistisk analyse vil blive udført for at karakterisere celletype og tilstandsvariabilitet og dens korrelation med afstamningsrelationer, oprindelsesvæv og donoralder.
Bulkprøver vil blive analyseret som kontroller, såvel som for at sammenligne informationen indsamlet fra enkeltcelleanalyse med den, der udelukkende opnås ved bulkanalyse.
|
5 år
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart
Primær færdiggørelse (Forventet)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Skøn)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Skøn)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Andre undersøgelses-id-numre
- 123456- HMO-CTIL
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med ikke
-
The First Affiliated Hospital of Guangzhou Medical...UkendtKOL | Hyperkapnisk respirationssvigtKina
-
Universidade Federal de PernambucoCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.AfsluttetCystisk fibroseBrasilien
-
Jie LiBinzhou Medical UniversityAfsluttetKronisk obstruktiv lungesygdom med (akut) eksacerbationKina
-
University Hospital, GrenobleRekrutteringHjertefejl | Lungesygdom, kronisk obstruktivFrankrig
-
UPECLIN HC FM Botucatu UnespUkendtEkstubationsfejl | Akut respirationssvigt efter ekstubationBrasilien
-
University Hospital, GrenobleAfsluttetRespiratorisk acidose hos ICU-patienterFrankrig
-
Patri-cia Angelica de Miranda Silva NogueiraAfsluttet
-
Fondazione Policlinico Universitario Agostino Gemelli...RekrutteringAkut hypoxæmisk respirationssvigtItalien
-
Qilu Hospital of Shandong UniversityRekruttering
-
San Francisco Veterans Affairs Medical CenterResMedAfsluttetLungesygdom, kronisk obstruktiv | Non-invasiv ventilationForenede Stater