Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Protokolludvikling for enkeltcelle-genomik og deres implementering for molekylær mangfoldighed mellem celler

1. september 2015 opdateret af: Hadassah Medical Organization

Efterforskerne vil udtrække enkeltceller og analysere den molekylære sammensætning af enkeltceller såvel som bulks ved hjælp af de nyeste protokoller for enkeltcelle- og bulk genomiske analyser, herunder genetiske, epigenetiske, transkriptomiske og proteomiske analyser ved hjælp af de seneste tilgængelige protokoller. En bred liste over sådanne eksempelprotokoller er anført nedenfor.

Prøverne og deres molekylære karakterisering (inklusive sekventering og molekylære niveauer) vil tjene som grundlag for udvikling af metoder til enkeltcelleanalyse. De udviklede metoder er rettet mod genomisk transkriptomisk, epigenetisk eller proteomisk analyse af enkeltceller og deler den samme struktur: det målte træk vil blive oversat til et DNA-bibliotek, som vil repræsentere træk ved et dedikeret assay.

Dette bibliotek sammen med korrekt matematisk analyse af sekventeringsresultaterne vil blive udført for at afslutte den ønskede funktion. Den generelle struktur af sådanne protokoller er beskrevet i vores gennemgangspapir (Enkeltcelle-sekventeringsbaserede teknologier vil revolutionere helorganismevidenskab, E. Shapiro, T. Biezuner & S.Linnarsson, Nature Reviews Genetics 14, 618-630, 2013) som er vedhæftet vores forslag.

Derudover vil forskerne bruge sekventeringsbaserede metoder (eksisterende og fremtidigt udviklede) til at sammenligne enkelte celler og bulks fra forskellige væv og/eller forskellige tidspunkter fra den samme donor for at måle genetisk, epigenetisk, transkriptomisk og proteomisk diversitet .

Studieoversigt

Status

Ukendt

Betingelser

Intervention / Behandling

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Forventet)

100

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

18 år og ældre (Voksen, Ældre voksen)

Tager imod sunde frivillige

Ja

Køn, der er berettiget til at studere

Alle

Prøveudtagningsmetode

Ikke-sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Vi vil få humane enkelt- og bulkceller fra raske donorer. Frivillige vil være sæddonorer, som skal udpege en del eller fuld donation til den foreslåede forskning. Ægdonorer, der udpeger en del af æggene til den foreslåede forskning; for kvinder, der kommer til klinikker for fertilitetsproblemer. At nå donorerne vil være at bruge annoncer i sædbanker og i kvindesundhedscentre eller bede om frivillige studerende.

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

Voksne

Ekskluderingskriterier:

  • Ikke

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Måling af enkeltcellevariabilitet ved hjælp af enkeltcellet genomik
Tidsramme: 5 år
Individuelle celleprøver fra flere væv, muligvis på flere tidspunkter, vil blive karakteriseret ved hjælp af avancerede enkeltcellede genomiske protokoller. De genomiske, transkriptomiske og epigenomiske signaturer af cellerne vil blive målt. Genomiske signaturer vil blive brugt til at etablere slægtsrelationer mellem celler. Transkriptomiske og epigenomiske signaturer vil blive brugt til at karakterisere celletype og funktionel tilstand. Statistisk analyse vil blive udført for at karakterisere celletype og tilstandsvariabilitet og dens korrelation med afstamningsrelationer, oprindelsesvæv og donoralder. Bulkprøver vil blive analyseret som kontroller, såvel som for at sammenligne informationen indsamlet fra enkeltcelleanalyse med den, der udelukkende opnås ved bulkanalyse.
5 år

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart

1. oktober 2015

Primær færdiggørelse (Forventet)

1. juni 2018

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

16. juni 2015

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

1. september 2015

Først opslået (Skøn)

4. september 2015

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Skøn)

4. september 2015

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

1. september 2015

Sidst verificeret

1. juni 2015

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Andre undersøgelses-id-numre

  • 123456- HMO-CTIL

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med ikke

3
Abonner