Tämä sivu käännettiin automaattisesti, eikä käännösten tarkkuutta voida taata. Katso englanninkielinen versio lähdetekstiä varten.

Protokollan kehittäminen yksittäisten solujen genomiikkaa varten ja niiden toteuttaminen solujen välisen molekyylin monimuotoisuuden kannalta

tiistai 1. syyskuuta 2015 päivittänyt: Hadassah Medical Organization

Tutkijat erottavat yksittäisiä soluja ja analysoivat yksittäisten solujen sekä bulkkien molekyylikoostumuksen käyttämällä uusimpia yksisolu- ja bulkkigenomiikkaanalyysejä, mukaan lukien geneettisiä, epigeneettisiä, transkriptomisia ja proteomisia analyyseja, käyttäen uusimpia saatavilla olevia protokollia. Laaja luettelo tällaisista esimerkkiprotokollista on lueteltu alla.

Näytteet ja niiden molekyylien karakterisointi (mukaan lukien sekvensointi ja molekyylitasot) toimivat perustana yksittäisten solujen analyysimenetelmien kehittämiselle. Kehitetyt menetelmät on suunnattu yksittäisten solujen genomiseen transkriptomiseen, epigeneettiseen tai proteomiseen analyysiin, ja niillä on sama rakenne: mitattu piirre muunnetaan DNA-kirjastoon, joka edustaa ominaisuutta erillisellä määrityksellä.

Tämä kirjasto suoritetaan sekvensointitulosten asianmukaisen matemaattisen analyysin ohella halutun ominaisuuden päättämiseksi. Tällaisten protokollien yleinen rakenne on kuvattu katsauspaperissamme (Yksisolusekvensointiin perustuvat tekniikat mullistavat koko organismin tieteen, E. Shapiro, T. Biezuner & S. Linnarsson, Nature Reviews Genetics 14, 618-630, 2013) joka on ehdotuksemme liitteenä.

Lisäksi tutkijat käyttävät sekvensointiin perustuvia menetelmiä (olemassa olevia ja tulevaisuudessa kehitettyjä) yksittäisten solujen ja bulkkien vertaamiseen eri kudoksista ja/tai eri aikapisteistä samalta luovuttajalta geneettisen, epigeneettisen, transkriptomisen ja proteomisen monimuotoisuuden mittaamiseksi. .

Tutkimuksen yleiskatsaus

Tila

Tuntematon

Ehdot

Interventio / Hoito

Opintotyyppi

Havainnollistava

Ilmoittautuminen (Odotettu)

100

Yhteystiedot ja paikat

Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.

Osallistumiskriteerit

Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.

Kelpoisuusvaatimukset

Opintokelpoiset iät

18 vuotta ja vanhemmat (Aikuinen, Vanhempi Aikuinen)

Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia

Joo

Sukupuolet, jotka voivat opiskella

Kaikki

Näytteenottomenetelmä

Ei-todennäköisyysnäyte

Tutkimusväestö

Hankimme ihmisen yksittäisiä ja bulkkisoluja terveiltä luovuttajilta. Vapaaehtoiset ovat siittiöiden luovuttajia, jotka osoittavat osan tai täydellisen luovutuksen ehdotettuun tutkimukseen. Munasolujen luovuttajat, jotka nimeävät osan munista ehdotettuun tutkimukseen; naisille, jotka tulevat klinikoille hedelmällisyysongelmien vuoksi. Luovuttajien tavoittaminen tapahtuu käyttämällä mainoksia spermapankeissa ja naisten terveyskeskuksissa tai pyytämällä vapaaehtoisia opiskelijoita.

Kuvaus

Sisällyttämiskriteerit:

Aikuiset

Poissulkemiskriteerit:

  • Ei

Opintosuunnitelma

Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.

Miten tutkimus on suunniteltu?

Mitä tutkimuksessa mitataan?

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Toimenpiteen kuvaus
Aikaikkuna
Yksisoluisen vaihtelun mittaaminen yksisolugenomiikan avulla
Aikaikkuna: 5 vuotta
Yksittäiset solunäytteet useista kudoksista, mahdollisesti useissa aikapisteissä, karakterisoidaan käyttämällä kehittyneitä yksisoluisia genomiikkaprotokollia. Solujen genomiset, transkriptomiset ja epigenomiset allekirjoitukset mitataan. Genomisia allekirjoituksia käytetään määrittämään sukulinjasuhteita solujen välillä. Transkriptomisia ja epigenomisia allekirjoituksia käytetään karakterisoimaan solutyyppiä ja toiminnallista tilaa. Tilastollisen analyysin avulla karakterisoidaan solutyypin ja tilan vaihtelua ja sen korrelaatiota sukulinjasuhteiden, alkuperäkudoksen ja luovuttajan iän kanssa. Kokoomanäytteitä analysoidaan kontrolleina sekä yksisoluanalyysistä kerättyjen tietojen vertaamiseksi pelkästään massaanalyysillä saatuihin tietoihin.
5 vuotta

Yhteistyökumppanit ja tutkijat

Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.

Opintojen ennätyspäivät

Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan ​​julkisella verkkosivustolla.

Opi tärkeimmät päivämäärät

Opiskelun aloitus

Torstai 1. lokakuuta 2015

Ensisijainen valmistuminen (Odotettu)

Perjantai 1. kesäkuuta 2018

Opintoihin ilmoittautumispäivät

Ensimmäinen lähetetty

Tiistai 16. kesäkuuta 2015

Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit

Tiistai 1. syyskuuta 2015

Ensimmäinen Lähetetty (Arvio)

Perjantai 4. syyskuuta 2015

Tutkimustietojen päivitykset

Viimeisin päivitys julkaistu (Arvio)

Perjantai 4. syyskuuta 2015

Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit

Tiistai 1. syyskuuta 2015

Viimeksi vahvistettu

Maanantai 1. kesäkuuta 2015

Lisää tietoa

Tähän tutkimukseen liittyvät termit

Muut tutkimustunnusnumerot

  • 123456- HMO-CTIL

Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .

Kliiniset tutkimukset ei

3
Tilaa