- ICH GCP
- Yhdysvaltain kliinisten tutkimusten rekisteri
- Kliininen tutkimus NCT02540941
Protokollan kehittäminen yksittäisten solujen genomiikkaa varten ja niiden toteuttaminen solujen välisen molekyylin monimuotoisuuden kannalta
Tutkijat erottavat yksittäisiä soluja ja analysoivat yksittäisten solujen sekä bulkkien molekyylikoostumuksen käyttämällä uusimpia yksisolu- ja bulkkigenomiikkaanalyysejä, mukaan lukien geneettisiä, epigeneettisiä, transkriptomisia ja proteomisia analyyseja, käyttäen uusimpia saatavilla olevia protokollia. Laaja luettelo tällaisista esimerkkiprotokollista on lueteltu alla.
Näytteet ja niiden molekyylien karakterisointi (mukaan lukien sekvensointi ja molekyylitasot) toimivat perustana yksittäisten solujen analyysimenetelmien kehittämiselle. Kehitetyt menetelmät on suunnattu yksittäisten solujen genomiseen transkriptomiseen, epigeneettiseen tai proteomiseen analyysiin, ja niillä on sama rakenne: mitattu piirre muunnetaan DNA-kirjastoon, joka edustaa ominaisuutta erillisellä määrityksellä.
Tämä kirjasto suoritetaan sekvensointitulosten asianmukaisen matemaattisen analyysin ohella halutun ominaisuuden päättämiseksi. Tällaisten protokollien yleinen rakenne on kuvattu katsauspaperissamme (Yksisolusekvensointiin perustuvat tekniikat mullistavat koko organismin tieteen, E. Shapiro, T. Biezuner & S. Linnarsson, Nature Reviews Genetics 14, 618-630, 2013) joka on ehdotuksemme liitteenä.
Lisäksi tutkijat käyttävät sekvensointiin perustuvia menetelmiä (olemassa olevia ja tulevaisuudessa kehitettyjä) yksittäisten solujen ja bulkkien vertaamiseen eri kudoksista ja/tai eri aikapisteistä samalta luovuttajalta geneettisen, epigeneettisen, transkriptomisen ja proteomisen monimuotoisuuden mittaamiseksi. .
Tutkimuksen yleiskatsaus
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Odotettu)
Yhteystiedot ja paikat
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
Aikuiset
Poissulkemiskriteerit:
- Ei
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
---|---|---|
Yksisoluisen vaihtelun mittaaminen yksisolugenomiikan avulla
Aikaikkuna: 5 vuotta
|
Yksittäiset solunäytteet useista kudoksista, mahdollisesti useissa aikapisteissä, karakterisoidaan käyttämällä kehittyneitä yksisoluisia genomiikkaprotokollia.
Solujen genomiset, transkriptomiset ja epigenomiset allekirjoitukset mitataan.
Genomisia allekirjoituksia käytetään määrittämään sukulinjasuhteita solujen välillä.
Transkriptomisia ja epigenomisia allekirjoituksia käytetään karakterisoimaan solutyyppiä ja toiminnallista tilaa.
Tilastollisen analyysin avulla karakterisoidaan solutyypin ja tilan vaihtelua ja sen korrelaatiota sukulinjasuhteiden, alkuperäkudoksen ja luovuttajan iän kanssa.
Kokoomanäytteitä analysoidaan kontrolleina sekä yksisoluanalyysistä kerättyjen tietojen vertaamiseksi pelkästään massaanalyysillä saatuihin tietoihin.
|
5 vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus
Ensisijainen valmistuminen (Odotettu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Arvio)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Arvio)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muut tutkimustunnusnumerot
- 123456- HMO-CTIL
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .
Kliiniset tutkimukset ei
-
University Hospital, MontpellierValmisHengitysvajaus | Ei-invasiivinen ilmanvaihto terveellä vapaaehtoisellaRanska
-
Universitätsklinikum Hamburg-EppendorfValmisVerenpaine | Perioperatiivinen hypotensioSaksa
-
University of MessinaSocieta Italiana Anestesia Analgesia Rianimazione e Terapia IntensivaRekrytointiPostoperatiiviset komplikaatiot | Hemodynaaminen seuranta | Verenpaineen määritysItalia
-
University Hospital, GrenobleRekrytointiSydämen vajaatoiminta | Keuhkosairaus, krooninen obstruktiivinenRanska
-
University Hospital, GrenobleLopetettuHengitysteiden asidoosi tehohoitopotilaillaRanska
-
Royal Brompton & Harefield NHS Foundation TrustTuntematonVentrikulaarinen takykardia | Ventrikulaarinen ektooppinen lyönti(S)
-
University Hospital, GrenobleTuntematon
-
Identifai GeneticsRekrytointiGenetiikka | Prenataalinen diagnoosiYhdysvallat
-
CorEvitasIlmoittautuminen kutsustaAtooppinen ihottumaYhdysvallat
-
Cliniques universitaires Saint-Luc- Université...Valmis