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Protokollentwicklung für die Genomik einzelner Zellen und ihre Implementierung für die molekulare Diversität zwischen Zellen

1. September 2015 aktualisiert von: Hadassah Medical Organization

Die Forscher werden einzelne Zellen extrahieren und die molekulare Zusammensetzung einzelner Zellen sowie von Massen unter Verwendung der neuesten Protokolle für Einzelzell- und Massengenomikanalysen analysieren, einschließlich genetischer, epigenetischer, transkriptomischer und proteomischer Analysen unter Verwendung der neuesten verfügbaren Protokolle. Eine breite Liste solcher Beispielprotokolle ist unten aufgeführt.

Die Proben und ihre molekulare Charakterisierung (einschließlich Sequenzierung und molekularer Ebene) dienen als Grundlage für die Entwicklung von Methoden zur Einzelzellanalyse. Die entwickelten Methoden zielen auf die genomische transkriptomische, epigenetische oder proteomische Analyse einzelner Zellen ab und haben die gleiche Struktur: Das gemessene Merkmal wird in eine DNA-Bibliothek übersetzt, die das Merkmal durch einen speziellen Assay darstellt.

Diese Bibliothek wird zusammen mit einer ordnungsgemäßen mathematischen Analyse der Sequenzierungsergebnisse durchgeführt, um das gewünschte Merkmal zu ermitteln. Die allgemeine Struktur solcher Protokolle ist in unserem Übersichtsartikel beschrieben (Single-cell sequencing-basedTechnologies will revolutionise Whole-Organism Science, E. Shapiro, T. Biezuner & S.Linnarsson, Nature Reviews Genetics 14, 618-630, 2013) die unserem Vorschlag beigefügt ist.

Darüber hinaus werden die Forscher sequenzierungsbasierte Methoden (bestehende und künftig zu entwickelnde) verwenden, um einzelne Zellen und Massen aus verschiedenen Geweben und/oder verschiedenen Zeitpunkten desselben Spenders zu vergleichen und so die genetische, epigenetische, transkriptomische und proteomische Diversität zu messen .

Studienübersicht

Status

Unbekannt

Bedingungen

Intervention / Behandlung

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Voraussichtlich)

100

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

18 Jahre und älter (Erwachsene, Älterer Erwachsener)

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Ja

Studienberechtigte Geschlechter

Alle

Probenahmeverfahren

Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe

Studienpopulation

Wir werden menschliche Einzel- und Großzellen von gesunden Spendern gewinnen. Bei den Freiwilligen handelt es sich um Samenspender, die einen Teil oder den gesamten Betrag für die geplante Forschung spenden. Eizellspenderinnen, die einen Teil der Eizellen für die geplante Forschung zur Verfügung stellen; für Frauen, die wegen Fruchtbarkeitsproblemen in die Klinik kommen. Um die Spender zu erreichen, werden Anzeigen in Samenbanken und Frauengesundheitszentren geschaltet oder studentische Freiwillige werden gesucht.

Beschreibung

Einschlusskriterien:

Erwachsene

Ausschlusskriterien:

  • Nicht

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Messung der Einzelzellvariabilität mithilfe der Einzelzellgenomik
Zeitfenster: 5 Jahre
Einzelne Zellproben aus mehreren Geweben, möglicherweise zu mehreren Zeitpunkten, werden mithilfe fortschrittlicher Protokolle zur Einzelzellgenomik charakterisiert. Die genomischen, transkriptomischen und epigenomischen Signaturen der Zellen werden gemessen. Genomische Signaturen werden verwendet, um Abstammungsbeziehungen zwischen Zellen festzustellen. Transkriptomische und epigenomische Signaturen werden zur Charakterisierung des Zelltyps und des Funktionszustands verwendet. Es wird eine statistische Analyse durchgeführt, um die Zelltyp- und Zustandsvariabilität sowie deren Korrelation mit Abstammungsbeziehungen, Herkunftsgewebe und Spenderalter zu charakterisieren. Massenproben werden als Kontrollen sowie zum Vergleich der aus der Einzelzellanalyse gewonnenen Informationen mit denen, die ausschließlich aus der Massenanalyse gewonnen werden, analysiert.
5 Jahre

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Sponsor

Hadassah Medical Organization

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn

1. Oktober 2015

Primärer Abschluss (Voraussichtlich)

1. Juni 2018

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

16. Juni 2015

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

1. September 2015

Zuerst gepostet (Schätzen)

4. September 2015

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Schätzen)

4. September 2015

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

1. September 2015

Zuletzt verifiziert

1. Juni 2015

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Andere Studien-ID-Nummern

  • 123456- HMO-CTIL

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