Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Vývoj protokolů pro genomiku jednotlivých buněk a jejich implementace pro molekulární diverzitu mezi buňkami

1. září 2015 aktualizováno: Hadassah Medical Organization

Vyšetřovatelé budou extrahovat jednotlivé buňky a analyzovat molekulární složení jednotlivých buněk i objemů pomocí nejnovějších protokolů pro analýzy jednotlivých buněk a hromadné genomické analýzy včetně genetických, epigenetických, transkriptomických a proteomických analýz s využitím nejnovějších dostupných protokolů. Široký seznam takových příkladů protokolů je uveden níže.

Vzorky a jejich molekulární charakterizace (včetně sekvenování a molekulárních úrovní) poslouží jako základ pro vývoj metod pro analýzu jednotlivých buněk. Vyvinuté metody jsou zaměřeny na genomickou transkriptomickou, epigenetickou nebo proteomickou analýzu jednotlivých buněk a sdílejí stejnou strukturu: měřený znak bude převeden do knihovny DNA, která bude tento znak reprezentovat specializovaným testem.

Tato knihovna spolu s řádnou matematickou analýzou výsledků sekvenování bude provedena za účelem uzavření požadovaného rysu. Obecná struktura takových protokolů je popsána v našem přehledovém článku (technologie založené na jednobuněčném sekvenování způsobí revoluci ve vědě o celém organismu, E. Shapiro, T. Biezuner & S. Linnarsson, Nature Reviews Genetics 14, 618-630, 2013) který je přílohou našeho návrhu.

Kromě toho budou výzkumníci používat metody založené na sekvenování (stávající i budoucí vyvinuté), aby porovnali jednotlivé buňky a objemy z různých tkání a/nebo různých časových bodů od stejného dárce za účelem měření genetické, epigenetické, transkriptomické a proteomické rozmanitosti. .

Přehled studie

Postavení

Neznámý

Podmínky

Intervence / Léčba

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Očekávaný)

100

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

18 let a starší (Dospělý, Starší dospělý)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ano

Pohlaví způsobilá ke studiu

Všechno

Metoda odběru vzorků

Vzorek nepravděpodobnosti

Studijní populace

Získáme lidské jednotlivé i hromadné buňky od zdravých dárců. Dobrovolníky budou dárci spermatu, kteří určí částečné nebo úplné dárcovství navrhovaného výzkumu. dárci vajíček, kteří určí část vajíček pro navrhovaný výzkum; pro ženy, které přicházejí do klinik s problémy s plodností. K oslovení dárců bude sloužit reklama ve spermobankách a ženských zdravotních střediscích nebo poptávka po studentských dobrovolnících.

Popis

Kritéria pro zařazení:

Dospělí

Kritéria vyloučení:

  • Ne

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Měření jednobuněčné variability pomocí jednobuněčné genomiky
Časové okno: 5 let
Jednotlivé vzorky buněk z více tkání, případně ve více časových bodech, budou charakterizovány pomocí pokročilých protokolů jednobuněčné genomiky. Budou měřeny genomické, transkriptomické a epigenomické signatury buněk. Genomické podpisy budou použity k vytvoření liniových vztahů mezi buňkami. K charakterizaci buněčného typu a funkčního stavu budou použity transkriptomické a epigenomické signatury. Bude provedena statistická analýza k charakterizaci buněčného typu a variability stavu a její korelace s příbuznými liniemi, tkání původu a věkem dárce. Hromadné vzorky budou analyzovány jako kontroly, stejně jako pro porovnání informací získaných z jednobuněčné analýzy s informacemi získanými pouze hromadnou analýzou.
5 let

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia

1. října 2015

Primární dokončení (Očekávaný)

1. června 2018

Termíny zápisu do studia

První předloženo

16. června 2015

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

1. září 2015

První zveřejněno (Odhad)

4. září 2015

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Odhad)

4. září 2015

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

1. září 2015

Naposledy ověřeno

1. června 2015

Více informací

Termíny související s touto studií

Další identifikační čísla studie

  • 123456- HMO-CTIL

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Klinické studie na Zdravý

Klinické studie na ne

3
Předplatit