Virulence de Staphylococcus Lugdunensis dans les infections sévères (VISLISI)

L'objectif principal est d'identifier de nouveaux facteurs de virulence produits par Staphylococcus lugdunensis pouvant être associés à des signes cliniques d'infections sévères et à des symptômes identifiés. L'approche méthodologique est basée sur la comparaison entre la production de toxines par un isolat de S. lugdunensis donné classé dans des groupes de patients selon l'infection cliniquement définie. Chaque groupe sera comparé à la présence ou non des facteurs de virulence étudiés. Les caractéristiques cliniques associées à l'activité de la toxine ne sont pas connues pour S. lugdunensis. Cette approche comparative s'appuie sur les hypothèses qui ont conduit à la définition des groupes de patients et de leurs critères cliniques. Cependant, en l'absence de corrélation évidente entre la production de toxines et le type d'infection, l'évaluation statistique sera complétée par une analyse multivariée. Cette approche n'a pas été choisie en premier lieu en raison des multiples paramètres subis lors de l'infection qui peuvent révéler des relations sans véritable corrélation. Concernant le nombre de patients inclus dans chaque groupe défini, si l'un d'entre eux n'atteint pas le nombre attendu, nous pourrions encore étendre les inclusions à 3-6 mois de plus. La présence d'infections graves sans risque habituellement défini est intrigante. Pour ces derniers patients, nous avons prévu, après leur consentement individuel, de réaliser un séquençage de l'exome. Les données obtenues seront comparées aux ressources disponibles pour le génome humain. En filtrant les données à travers les protocoles habituels, nous espérons pouvoir nous concentrer sur quelques gènes qui évoquent une sensibilité spécifique aux infections, par ex. endocardite sévère à S. lugdunensis sans risque défini.