Résultats du panel gastro-intestinal FilmArray® et de la procalcitonine sérique dans la colite aiguë et la diarrhée infectieuse aux urgences (PRODIARRAY)

Les diarrhées aiguës et les colites aiguës d'origine infectieuse sont des motifs fréquents de consultation aux urgences. L'approche diagnostique étiologique actuelle se limite à la détermination de marqueurs de l'inflammation, tels que la CRP et les leucocytes sanguins, qui manquent de spécificité et de sensibilité pour l'infection bactérienne. La culture de selles permet de détecter des pathogènes bactériens dans les selles avec un résultat au moins 48 heures plus tard et un taux de positivité

Cette étude décrira les concentrations de procalcitonine (PCT) (un biomarqueur d'infection bactérienne) dans cette population afin d'évaluer son utilité en fonction de l'étiologie virale ou bactérienne identifiée par le panel de PCR gastro-intestinale multiplex dans les selles (panel GI) et la culture de selles.

Les chercheurs émettent l'hypothèse que les taux de PCT seront plus élevés si le panel gastro-intestinal ou la culture de selles identifie une bactérie ou un parasite, comme c'est le cas dans les infections des voies respiratoires. S'il y a une détection d'un virus par le panel GI ou si la culture de selles et le panel GI sont négatifs, les enquêteurs s'attendent à ce que les valeurs PCT soient inférieures ou négatives.

Les investigateurs incluront les patients admis aux urgences avec une suspicion de diarrhée infectieuse ou de colite aiguë afin d'avoir un large panel représentatif des étiologies de diarrhée infectieuse.

Seuls les patients ayant un prélèvement sanguin prescrit comme soins de routine seront inclus. L'échantillon de sang est utile pour doser la CRP et la numération des cellules sanguines totales (WBC), qui font partie des analyses biologiques actuelles effectuées dans ce contexte. Après avoir obtenu le consentement du patient, l'investigateur ajoutera le dosage PCT dans le prélèvement sanguin et demandera au patient de fournir un échantillon de selles, afin d'avoir une culture de selles et d'effectuer une recherche approfondie des agents pathogènes grâce à la technologie PCR multiplex (Filmarray ® panneau IG).

Il sera demandé au médecin si tous ces résultats (ceux actuellement demandés avec le dosage de PCT et le panel GI) modifieront sa décision de commencer un antibiotique.

Le patient recevra un appel téléphonique au jour 15 après sa première admission aux urgences et il lui sera demandé s'il a consulté un nouveau médecin ou si un nouveau traitement par antibiotiques a été débuté.

Modalités de recueil des données : Les données du dossier médical seront recueillies par les investigateurs et l'assistant de recherche clinique du service des urgences. Toutes les données seront pseudonymisées. Le prélèvement se fera le jour de l'admission aux urgences et après l'entretien téléphonique au J15.

Justification statistique de la taille de l'échantillon : il s'agira d'une étude pilote pour décrire les résultats de la concentration de PCT et du panel GI multiplex. À notre connaissance, il n'y a pas d'étude publiée faisant état des concentrations de PCT dans cette population. Cela exclut un échantillon, le calcul de la taille. Les enquêteurs incluront autant de patients que possible pendant un an afin de couvrir les variations épidémiologiques saisonnières et d'obtenir un échantillon convenable d'au moins 100 patients.

Description des méthodes statistiques : les données cliniques et biologiques seront rapportées sous forme de médiane et d'intervalle interquartile ou moyenne +/- SD. Les valeurs de PCT seront rapportées sous forme médiane et IQR, respectivement s'il y a une infection virale, une infection documentée (bactérie ou parasite) ou aucun pathogène identifié par le panel GI et/ou la culture de selles (bactérie). Les caractéristiques du patient et les résultats PCT seront comparés dans tous les groupes, en utilisant comme référence le groupe où aucun agent pathogène n'est observé. Une analyse en sous-groupe sera effectuée sur la colite et la diarrhée aiguë respectivement, pour savoir s'il y a une différence avec les variables analysées car les deux pathologies ne sont pas prises en charge de la même manière.