Élargir notre compréhension de l'efficacité précoce et tardive du vaccin contre la grippe (BELIEVE)

Recrutement, sélection et évaluation de l'admissibilité

Les participants potentiels (University Hospitals of Leicester NHS Trust, personnel de l'UHL) seront contactés par e-mail pour annoncer et expliquer l'étude. L'e-mail fera partie des e-mails de vaccination de routine contre la grippe saisonnière qui sont envoyés chaque année pour rappeler au personnel de l'UHL de se faire vacciner. De plus, les enquêteurs feront de la publicité par des affiches dans les zones à fort trafic de personnel, par ex. le restaurant, et notre équipe de santé au travail aidera à cette publicité de l'étude. Les enquêteurs s'attendent à ce que certains travailleurs de la santé (TS) prennent connaissance de l'étude par le bouche à oreille.

L'étude comportera deux phases de recrutement. Pour le mois de septembre pour le groupe de vaccination « précoce » et de la mi-novembre à la mi-décembre pour le groupe de vaccination « tardif » - les horaires exacts peuvent varier en fonction du moment où les vaccins antigrippaux inactivés sont reçus et de la saisonnalité du virus , car tout le recrutement sera terminé avant le début de la saison grippale. L'attribution aux deux groupes de vaccination ne sera pas randomisée ; ce sera la décision des travailleurs de la santé s'ils souhaitent être vaccinés tôt ou tard. Il y aura une limite de 200 travailleurs de la santé recrutés dans chaque groupe.

Les personnes qui manifestent leur intérêt à participer à l'étude recevront une fiche d'information en personne ou par courriel. Ensuite, les enquêteurs leur donneront le temps dont ils ont besoin pour décider de participer ou non à l'étude. Si la personne accepte de participer, un membre de l'équipe de recherche procédera à une sélection et confirmera son admissibilité. Les participants ne seront recrutés que si tous les critères sont remplis. À ce moment-là, des dispositions seront prises pour que les membres du personnel assistent à un premier rendez-vous à l'espace de recherche du LRI. Le recrutement dans le domaine de la recherche respectera les mesures de distanciation sociale en vigueur à l'UHL.

Lors de ce premier rendez-vous, l'étude sera expliquée aux membres du personnel en groupes. Un membre de l'équipe de recherche demandera ensuite un consentement éclairé écrit, comme indiqué ci-dessous, à chaque travailleur de la santé individuellement. Si une personne a d'autres questions sur l'étude, un autre membre de l'équipe d'étude sera autorisé à soutenir et à faciliter le consentement éclairé.

Recrutement de patients hospitalisés Les cliniciens des services médicaux aigus seront informés avant le début de la saison grippale par e-mail et affiches, dans les zones cliniques, de l'étude impliquant des patients hospitalisés atteints de SG (syndrome grippal). Le service de virologie des hôpitaux universitaires de Leicester appelle régulièrement l'équipe clinique des cas positifs de grippe chez les patients hospitalisés pendant la saison grippale. Lorsque l'équipe clinique ira ensuite expliquer ce diagnostic au patient, elle l'informera également de l'étude et lui fournira une notice d'information pour les participants. Ensuite, les enquêteurs donneront au patient le temps dont il a besoin pour décider de participer ou non à l'étude. Si la personne accepte de participer, elle en informera un membre de l'équipe clinique qui avisera ensuite l'équipe de recherche. Un membre de l'équipe de recherche se rendra dans le service pour dépister et confirmer l'admissibilité. Les participants ne seront recrutés que si tous les critères sont remplis. À l'aide des données des résultats de laboratoire, vingt patients hospitalisés avec des écouvillons confirmés pour la grippe seront également recrutés de la même manière, en tant que groupe témoin.

Visites d'étude

Les activités suivantes seront réalisées à chaque visite et enregistrées dans le CRF :

Visite 1 : visite de référence

• Les participants seront inscrits à condition qu'ils répondent aux critères d'inclusion et d'exclusion et qu'ils donnent leur consentement écrit en toute connaissance de cause.
• Les participants se verront ensuite attribuer un numéro d'étude
• Les participants rempliront un court questionnaire qui comprendra des informations démographiques : âge, sexe, origine ethnique, rôle professionnel, comorbidités médicales, médicaments réguliers, antécédents de tabagisme, antécédents d'infections grippales et vaccin antigrippal.
• Recueillir 10 ml de sang coagulé avant la vaccination pour les anticorps de base. Traiter le sang et stocker le sérum pour les tests sérologiques. Le vaccin contre la grippe sera administré de la manière habituelle.
• Les participants recevront un thermomètre, deux trousses d'auto-prélèvement de la grippe (c. SG). Selon la définition de cas de l'OMS, un SG sera défini comme une fièvre > 37,8 oC et une toux apparue au cours des 10 derniers jours. On leur montrera comment faire fonctionner le thermomètre, prendre un auto-écouvillon (c'est-à-dire un écouvillon de gorge) et comment fixer l'écouvillon dans le tube d'échantillonnage. Ils apprendront également comment remplir un formulaire d'événement de SG (ILIef) - en enregistrant brièvement le moment et la nature de leurs symptômes/signes de SG.

Visite 2 : 3 semaines après la visite initiale (+ ou - 7 jours)

• Recueillir 10 ml de sang coagulé pour la sérologie. Traiter le sang et conserver le sérum.
• Les participants seront invités à fournir des échantillons d'haleine, cela servira de contrôle auquel les échantillons d'haleine qui se sont produits pendant le SG seront comparés. Visite 3 : pic de la saison grippale généralement de janvier à février (+ ou - 30 jours)
• Recueillir 10 ml de sang coagulé pour la sérologie. Traiter le sang et conserver le sérum. Visite 4 : Fin de la saison grippale généralement d'avril à mai (+ ou - 30 jours)
• Recueillir 10 ml de sang coagulé pour la sérologie. Traiter le sang et conserver le sérum. Visite d'étude d'événement de SG Les participants à l'étude contacteront l'équipe de l'étude par e-mail ou par téléphone pour les alerter qu'un événement de SG s'est produit et pour organiser la collecte par un membre de l'équipe de l'étude de l'écouvillon et de la SGII, dès que possible après qu'il a été prises, pour un stockage approprié (dans un congélateur à -80oC) jusqu'à ce qu'elles soient testées. Si les participants à l'étude sont à la maison lorsqu'ils développent un SG, il leur sera demandé de remplir l'auto-écouvillonnage et l'ILef. L'écouvillon sera emballé dans un double sac et collecté par un membre de l'équipe de recherche conformément aux directives de transport publiées dans les directives du gouvernement sur le COVID-19 : manipulation et traitement sûrs des échantillons dans les laboratoires conformément à UN3373, instructions d'emballage 650. Les écouvillons seront livrés au laboratoire de virologie de l'UHL et traités conformément aux procédures opérationnelles standard (voir section 8.7.1).

Il sera réitéré au participant à l'étude que les résultats de ces prélèvements lui seront envoyés par e-mail et par téléphone avec les derniers conseils en matière de santé au travail. Il leur sera conseillé de suivre la politique de santé au travail pour les SG en attendant les résultats de l'écouvillonnage, de signaler la maladie de la manière normale et de contacter leur médecin généraliste si des conseils médicaux supplémentaires concernant cette période actuelle de maladie sont nécessaires.

Le contenu de l'ILIef sera saisi dans le formulaire de rapport de cas (CRF) des participants, aucune information personnelle ne sera incluse. Ces détails seront utilisés dans l'interprétation du séquençage viral et des titres d'anticorps, effectués à l'OMS de Melbourne.

Si le participant à l'étude est au travail lorsqu'il développe un SG, il lui sera demandé de fournir un échantillon d'haleine et un échantillon de masque pour la détection de la grippe en utilisant de nouvelles méthodes avant de quitter le travail. Le matériel d'échantillonnage sera apporté à l'endroit où se trouve le travailleur de la santé, mais si cela ne pouvait pas se faire immédiatement, le travailleur de la santé serait invité à suivre les conseils de santé au travail et à rentrer chez lui. Les spécimens collectés à partir de ces processus sont détaillés dans la section 8.7.

Échantillon d'haleine d'un patient hospitalisé Les patients hospitalisés seront abordés conformément à la politique habituelle de contrôle des infections de l'UHL. Seuls les patients qui ont des résultats disponibles pour un prélèvement de gorge récent testé pour les agents pathogènes respiratoires courants seront approchés. Les services COVID-19 positifs ne seront pas impliqués dans le recrutement, mais les patients hospitalisés atteints de grippe et d'autres virus respiratoires seront recrutés dans les services COVID-19 négatifs. Les patients confirmés positifs pour la grippe sont généralement pris en charge dans des salles latérales conformément à la politique. Dans tous les cas, le patient n'aura pas à entrer en contact avec l'équipement d'analyse, car les processus de capture de souffle et d'analyse sont séparés. L'échantillonnage au masque ne sera pas effectué sur les patients nécessitant une oxygénothérapie via un masque facial. Une fois consenti à l'étude, un membre de l'équipe de recherche approchera le patient avec les masques, les seringues et les embouts buccaux nécessaires au prélèvement d'échantillons d'haleine. Un prélèvement de gorge répété sera également effectué à ce moment-là afin qu'une comparaison précise puisse avoir lieu entre les nouvelles méthodes de diagnostic et la pratique actuelle. Les trois méthodes d'échantillonnage de l'haleine, dans la mesure du possible, seront utilisées. Une fois les échantillons prélevés, ils seront placés dans un sac à risques biologiques et acheminés vers les machines d'analyse. Les écouvillons et les échantillons de masque seront transportés au laboratoire de virologie de Leicester Royal Infirmary pour traitement. Le matériel de capture respiratoire (seringues et embouts buccaux jetables) sera éliminé de la manière habituelle pour les déchets cliniques. Les tubes TD et l'échantillonneur Bio-VOC seront emballés dans un double sac et seront décontaminés. Il s'agit de la seule visite d'étude requise par les patients hospitalisés et aucun suivi supplémentaire n'est requis.

Auto-écouvillons Les écouvillons seront livrés au Département de microbiologie clinique des hôpitaux universitaires de Leicester NHS Trust où ils seront manipulés dans des conditions de catégorie 2 (BSL-2). Ils seront vortexés et les écouvillons jetés quittant le milieu de transport du virus inoculé (VTM). Les tubes VTM seront testés sur un test de diagnostic standard (habituellement utilisé pour les tests des patients hospitalisés) pour vérifier la présence de la grippe (car de nombreux virus respiratoires différents peuvent provoquer une « maladie de type grippal »). Si la grippe est détectée, une aliquote de ce VTM sera envoyée à l'OMS Melbourne, avec les échantillons de sérum, pour le séquençage viral de la grippe. Le VTM sera transporté au laboratoire de l'OMS conformément à la réglementation UN3733/Catégorie B.

Analyse de l'haleine COV Les trois plates-formes d'analyse utiliseront la même approche de collecte de base. Il sera demandé aux participants de ne rien avoir mangé ni bu au moins 30 minutes avant le prélèvement d'haleine. Avant l'échantillonnage, se rincer la bouche avec de l'eau qu'ils peuvent ensuite avaler - puis fournir trois échantillons d'haleine non forcée en expirant dans des embouts jetables pendant 3 à 5 secondes. Les chercheurs porteront des EPI dictés par la politique de confiance locale à l'UHL pour la collecte des écouvillons nasaux et oraux. Des gants cliniques jetables seront utilisés pour toutes les procédures. Les appareils d'analyse seront conservés dans le service ou dans une zone de recherche loin du contact direct avec le patient.

Pour l'analyse GC-IMS, l'embout buccal est fixé à un tube en plastique de 10 cm de long. Au fur et à mesure que le patient expire dans le tube, le chercheur prélèvera un échantillon d'haleine dans une seringue de 5 ml à mi-chemin dans le tube.

L'échantillon sera ensuite injecté à partir de la seringue par le chercheur dans le dispositif BreathSpecTM GC-IMS pour analyse. Tout matériel infectieux contenu dans l'échantillon sera détruit en étant chauffé à plus de 60°C dans le cadre du processus d'analyse.

L'eNose utilise une unité commerciale de capture d'haleine marquée CE, le Markes Bio-VOC. L'unité contient 129 ml d'haleine, est scellée et ne s'ouvre que lorsqu'elle est prête à l'emploi, et est jetable. L'utilisateur place un embout buccal en carton sur l'appareil avant l'échantillonnage. Une fois que le patient a respiré dans l'appareil, l'embout buccal est retiré et un raccord de seringue est ajouté, qui se connecte au nez électronique. La seringue est ensuite enfoncée et l'échantillon est analysé. Le temps d'analyse est inférieur à 5 minutes. La machine eNose sera décontaminée à la fin de chaque journée d'utilisation conformément aux directives du fabricant.

Pour l'analyse GC-MS, un autre échantillon d'haleine est à nouveau collecté à l'aide de l'unité Markes Bio-VOC comme ci-dessus. Une fois l'échantillon collecté, il sera transféré sur un tube de désorption thermique (TD) (généralement 89 mm x 6,4 mm). Les parois internes du tube sont recouvertes d'une couche absorbante à laquelle adhèrent les produits chimiques respiratoires. Le tube TD est placé à l'extrémité de l'unité Bio-VOC et l'air capturé est poussé à travers le tube. Une fois terminé, les extrémités des tubes sont scellées avec des embouts. Un processus de décontamination validé est ensuite entrepris pour l'échantillonneur Bio-VOC et les tubes TD via un cycle de chaleur long / élevé pour s'assurer que le virus est tué. Les tubes TD décontaminés seront conservés dans des boîtes de stockage dans la zone de recherche de Leicester Royal Infirmary pour être transportés à l'Université de Warwick pour analyse et élimination finale, conformément à un accord de transfert de matériel prédéfini.

Les résultats de l'analyse GC-IMS seront téléchargés régulièrement depuis BreathSpecTM sur un disque partagé DataSync et téléchargés par des analystes de l'Université de Warwick. Aucune donnée identifiable ne sera associée à ces données, seulement un numéro d'étude.

Échantillonnage de masque L'échantillonnage de masque consiste en des participants portant un masque facial modifié (chirurgical plat, à bec de canard ou FFP1) qui contient jusqu'à 5 bandes d'alcool polyvinylique (PVA) imprimé en 3D pendant jusqu'à 60 minutes tout en étant observé par un membre de l'équipe de recherche. Les enquêteurs fourniront une formation, un soutien et un équipement de protection individuelle au personnel de recherche qui obtiendra des échantillons et conviendront de protocoles pour le traitement local. Avant utilisation, les masques sont stérilisés et conservés dans des sacs d'échantillons scellés. Une fois portés, ils sont replacés dans ces sacs et scellés. Ils seront transportés au laboratoire de virologie de l'UHL conformément aux évaluations des risques et aux procédures opérationnelles standard en vigueur concernant le transport de matières dangereuses. L'ARN viral sera extrait et quantifié des bandes de PVA dans les masques à l'aide de la PCR quantitative en temps réel. Le traitement des bandes de PVA nécessite qu'elles soient dissoutes dans de l'eau, à partir de laquelle le virus à ARN est extrait et analysé à l'aide de méthodes moléculaires. Les masques et sacs seront détruits.

Tests sériques et séquençage viral À chacun des jours prévus nécessitant des échantillons de sérum, le sang coagulé sera stocké entre 2oC et 8oC et centrifugé dans les 24 heures à l'Espace de recherche, LRI. Les sérums seront stockés dans des cryotubes, avec tous les cryotubes étiquetés avec le numéro d'étude du participant, le numéro de visite et la date de collecte à l'espace de recherche, LRI. Les échantillons seront conservés congelés à -80 oC jusqu'à leur expédition. Un ensemble de cryotubes sera envoyé au laboratoire de référence de l'OMS à Melbourne une fois que tous les échantillons auront été collectés. L'autre ensemble de cryotubes sera stocké par mesure de sécurité en cas de problèmes de transport. Avec le consentement des participants, tous les échantillons de sérum inutilisés seront stockés pour de futures recherches approuvées sur le plan éthique et partagés avec d'autres collaborateurs de recherche dans d'autres institutions universitaires et partenaires industriels à l'intérieur et à l'extérieur du Royaume-Uni pour de futures recherches. Le sérum sera utilisé pour les tests d'inhibition de l'hémagglutination et de microneutralisation et une fois que tous les échantillons auront été traités, les résultats seront renvoyés à l'équipe de recherche de Leicester.

Les tests d'inhibition de l'hémagglutination (HAI) et de microneutralisation (MN), ainsi que le séquençage du virus de la grippe, seront effectués au Centre collaborateur de l'OMS pour la référence et la recherche sur la grippe (VIDRL), Peter Doherty Institute for Infection and Immunity, 792 Elizabeth Street, Melbourne, VIC 3000, Australie.