Transplantation de microbiote fécal pour la décolonisation des entérobactéries résistantes aux carbapénèmes (FMT)

La colonisation CRE est associée à un risque d'infection de 16,5 % avec un taux de mortalité de 10 %. Le CRE exerce également une pression énorme sur le coût des soins de santé ainsi que sur le personnel médical/infirmier. Le séjour hospitalier est multiplié par deux pour les cas infectés par CRE par rapport aux cas non infectés. Les porteurs de CRE doivent souvent rester dans des hôpitaux aigus pendant de longues périodes après avoir réglé leurs maladies aiguës, à la fois en raison de l'impossibilité logistique de les transférer dans des unités de réadaptation ou des maisons de soins infirmiers, qui sont dépourvues de chambres d'isolement.

Des mesures proactives ont été mises en œuvre dans les hôpitaux du monde entier pour prévenir la propagation des MDRO, en particulier chez les personnes vulnérables. Ces mesures comprennent généralement la culture de surveillance, la recherche des contacts, l'isolement des porteurs et la désinfection de l'environnement. Néanmoins, les installations d'isolement ne sont pas toujours facilement disponibles, en particulier dans les régions aux ressources limitées. De plus, l'isolement par contact peut entraîner divers effets indésirables sur le bien-être mental des patients isolés, tels que la dépression, l'anxiété et la colère. Le temps passé avec les patients isolés par les travailleurs de la santé est moindre, ce qui a un effet négatif sur la sécurité des patients avec une multiplication par huit du risque d'événements indésirables dus à l'échec des soins de soutien.

Il y a eu un intérêt croissant pour l'extension du FMT pour la décolonisation de la CRE. Cependant, la plupart des études se limitent à des rapports de cas ou à des séries de cas avec des échantillons de petite taille (allant de 10 à 39 patients) comme le montre une récente revue systématique. Le taux cumulé de décolonisation CRE est prometteur à 62,1%. Cependant, un essai contrôlé randomisé (ECR) reste la conception d'étude la plus optimale pour étudier le véritable effet bénéfique de la FMT sur la décolonisation de la CRE. La FMT par voie de lavement présente plusieurs avantages par rapport à l'administration par voie gastro-intestinale supérieure ou à la coloscopie. Premièrement, l'administration de suspension fécale via une sonde d'alimentation peut ne pas être acceptable pour certains patients. Deuxièmement, la coloscopie entraîne des complications de perforation intestinale, d'aspiration et de suppression cardiopulmonaire dues à l'utilisation de sédatifs, en particulier chez les patients fragiles et âgés.