Registro delle malattie infettive BIObank (INDI-REBIO)

Il registro fornirebbe un database completo comprendente una vasta popolazione di pazienti con malattie infettive, favorendo l’analisi di dati clinici, di laboratorio e terapeutici di specifiche condizioni infettive.

Le malattie infettive specifiche di maggiore interesse includono, tra le altre:

• Infezioni del torrente ematico (ovvero: sindromi infettive che si manifestano con batteriemia)
• Infezioni endovascolari (es.: endocardite infettiva, infezioni di dispositivi elettronici impiantabili cardiovascolari, infezioni di trapianti vascolari, ecc.)
• Infezioni del sistema nervoso centrale (es.: meningite, encefalite, ascesso cerebrale, infezioni di shunt ventricolari, ecc.)
• Infezioni delle ossa e delle articolazioni (es.: osteomielite, spondilodiscite, infezioni delle protesi articolari, ecc.)
• Infezioni sessualmente trasmissibili (es.: uretriti gonococciche e non gonococciche, proctiti, epididimo-orchiti, sifilide, ecc.)
• Infezione da HIV
• Malattie infettive emergenti e riemergenti.

Gli obiettivi generali dello studio per ciascuna specifica malattia infettiva includono:

• descrizione ed evoluzione nel tempo delle caratteristiche cliniche e di laboratorio dei pazienti affetti da specifiche malattie infettive;
• descrizione ed evoluzione nel tempo degli isolati microbici, compresi i test di sensibilità antimicrobica;
• descrizione ed evoluzione nel tempo dei trattamenti impiegati in pazienti affetti da specifiche malattie infettive;
• valutazione di fattori predittivi del successo del trattamento e della mortalità in pazienti con specifiche malattie infettive;
• descrizione, valutazione e impatto prognostico di biomarcatori microbici, immunologici e infiammatori.

Gli obiettivi generali dello studio, insieme ad obiettivi più specifici relativi ad una specifica malattia infettiva, saranno valutati in studi osservazionali specifici, annidati all'interno del Registro (ovvero, utilizzando dati e campioni biologici raccolti nel Registro con l'eventuale aggiunta di dati ottenuti da indagini eseguite sui campioni biologici disponibili).

Per raggiungere questi obiettivi, ai partecipanti viene chiesto di donare campioni biologici (sangue, liquido cerebrospinale, urina, altri campioni biologici rilevanti relativi alla specifica malattia infettiva, raccolti secondo la buona pratica clinica e le linee guida disponibili) per studi volti a identificare i modificatori di una specifica malattia infettiva. malattia e stabilire e validare marcatori biologici che tracciano il decorso progressivo della malattia considerata, insieme all'efficacia e alla tossicità dei farmaci.

I seguenti dati clinici e di laboratorio verranno registrati al basale e alle visite di follow-up:

• Età, misurata in anni
• Sesso alla nascita (maschio, femmina)
• Comorbilità, misurate con il punteggio Charlson (minimo 0 - massimo 37; punteggi più alti legati a esito peggiore)
• Fonte dell'infezione (sistema nervoso centrale, tratto respiratorio, infezione endovascolare, intra-addominale, tratto urinario, pelle e tessuti molli, ossa e articolazioni, altro).
• Punteggio SOFA (Sequential Organ Failure Assessment) (minimo 0 - massimo 24; punteggi più alti legati a risultati peggiori)
• Punteggio Pitt (minimo 0 - massimo 14; punteggi più alti legati a risultati peggiori)
• Durata della degenza ospedaliera (giorni)
• Numero di pazienti che necessitano di ricovero in unità di terapia intensiva (UTI), interventi chirurgici o altre procedure
• Compromissione nerologica (scala Rankin [minimo 0 - massimo 6; punteggi più alti legati a esito peggiore])
• Compromissione funzionale (scala Karnofsky [minimo 0 - massimo 100; punteggi più alti legati a risultati migliori])
• Risultati degli esami di laboratorio di routine
• Concentrazioni plasmatiche dei farmaci
• Risultati delle indagini microbiologiche (identificazione degli organismi causali, risultati dei test di sensibilità antimicrobica, meccanismo di resistenza)
• Risultati delle indagini per immagini
• Strategie di trattamento (tipologia, dose, somministrazione di antimicrobici)
• Sviluppo di tossicità da farmaci
• Mortalità (per tutte le cause e attribuibile all'infezione)

Sia i dati che i campioni biologici saranno raccolti a partire dalla linea di base (BL) della malattia infettiva dopo aver ottenuto il consenso informato. I dati di follow-up e i campioni biologici verranno raccolti alla fine del trattamento (EOT) e 6 mesi dopo l'EOT per la condizione specifica o, in caso di assenza di intervento terapeutico, 6 mesi dopo la diagnosi. Nei pazienti con infezione da HIV, i dati di follow-up e i campioni biologici verranno raccolti ogni anno dopo il basale. Ulteriori dati e campioni biologici saranno raccolti in altri momenti in base alla consueta evoluzione temporale di malattie specifiche e in caso di eventi clinici rilevanti o modifiche terapeutiche. Tutti i campioni verranno raccolti secondo la buona pratica clinica e le linee guida nazionali e internazionali disponibili.

L'analisi dei dati sarà eseguita dai ricercatori sulle proposte approvate. I metodi statistici saranno definiti come parte delle proposte.

Le variabili dello studio saranno descritte utilizzando medie o mediane e intervalli di confidenza al 95% o intervalli interquartili per variabili continue e proporzioni con i relativi intervalli di confidenza al 95% per variabili categoriali.

I confronti tra i gruppi verranno effettuati utilizzando il test del chi quadrato o il test esatto di Fisher (variabili categoriali) oppure utilizzando il test non parametrico di Mann-Whitney (variabili continue).

Variazioni significative delle variabili continue nel tempo possono essere valutate utilizzando test t per dati appaiati o Test dei segni dei ranghi di Wilcoxon (solo due punti temporali) o Analisi della varianza per misure ripetute o modelli misti lineari (tutti i punti temporali disponibili durante il follow-up).

La presenza di relazioni lineari tra variabili continue può essere verificata mediante coefficienti di correlazione di Pearson (parametrici) o coefficienti di correlazione di Spearman (non parametrici).

Verranno applicati modelli di regressione logistica per determinare i predittori dei risultati; verranno riportati i rischi (odds ratio) ed i corrispondenti intervalli di confidenza al 95%.

Verranno applicati modelli di regressione di Cox per determinare i predittori dei risultati; verranno riportati i rischi (odds ratio) e i corrispondenti intervalli di confidenza al 95%.