Epidemiologia zakażenia wirusem zapalenia wątroby typu E w Izraelu i potencjalne czynniki ryzyka

Wirus zapalenia wątroby typu E jest jednoniciowym wirusem RNA o dodatniej polaryzacji z genomem o długości około 7,2 kb. Genom HEV jest zamknięty na końcu 5', po którym następuje mały nieulegający translacji region o 27 nukleotydach i poliadenalowany na końcu 3', poprzedzony innym UTR o długości 65 nukleotydów. HEV ma trzy otwarte ramki odczytu: ORF1, ORF2 i ORF3, które kodują białka strukturalne i niestrukturalne. ORF1 jest największa, ma około 5000 nt długości, znajduje się na końcu 5' i koduje ważne białka w procesie replikacji (metylotransferazę, papainopodobną proteazę cysteinową, helikazę i polimerazę RNA zależną od RNA). Niekodujący, hiperzmienny region w ORF1 wykazuje znaczną różnorodność genetyczną; region ten wydaje się modulować wydajność replikacji HEV. Warto zauważyć, że różnice w wielkości genomu między różnymi szczepami HEV ograniczają się głównie do tego regionu. ORF2 znajduje się na końcu 3', koduje strukturalne białka kapsydu o długości 660 aminokwasów i zawiera trzy potencjalne miejsca glikozylacji. Białko ORF2 zawiera wiele miejsc immunogennych, a przeciwciała neutralizujące są skierowane przeciwko nim wszystkim. Kluczowym regionem białka dla immunogenności jest 452aa-617aa, a ostatnio wykazano, że epitopy neutralizujące są konformacyjne. ORF3 znajduje się między dwoma pozostałymi odczytami tworzy ramki i koduje małą fosfoproteinę składającą się ze 123 aminokwasów. Jego dokładna funkcja nie została jeszcze określona, ​​jednak zaproponowano wiele funkcji. Uważa się, że wchodzi w interakcje z komórkową kinazą białkową aktywowaną mitogenem, fosfatazą i innymi kinazami zewnątrzkomórkowymi, sprzyjając przeżywalności komórek poprzez aktywację wewnątrzkomórkowych szlaków sygnałowych. Co więcej, wiązanie białka kodowanego przez ORF3 z białkami specyficznymi dla gospodarza wydaje się wpływać na patogenezę zakażeń HEV Schematyczny rysunek genomu HEV jest opisany na Figurze 1.