Identyfikacja czynników gospodarza infekcji norowirusem w modelu mini-jelita

Głównym celem tego badania jest ustalenie listy białek komórkowych gospodarza, które pośredniczą w zakażeniu norowirusem.

Norowirus jest jednym z najczęstszych patogenów przypisywanych biegunkom powodowanym przez niebezpieczną żywność. Jest to również główna przyczyna śmiertelności wśród małych dzieci i dorosłych w zakażeniach przenoszonych przez żywność. Norowirus to nie tylko obciążenie przenoszone przez żywność. W niedawnej metaanalizie norowirus odpowiada za prawie jedną piątą wszystkich przyczyn ostrego zapalenia żołądka i jelit (w tym przeniesienia z człowieka na człowieka) zarówno w przypadkach sporadycznych, jak i epidemii, i dotyczy wszystkich grup wiekowych. Bez wątpienia norowirus jest głównym problemem zdrowia publicznego zarówno w krajach rozwiniętych, jak i rozwijających się. Wysiłki badawcze mające na celu lepsze zrozumienie patobiologii norowirusów będą niezbędne do ukierunkowanej interwencji.

Od koronawirusa zespołu oddechowego na Bliskim Wschodzie po wirusa Zika, wysiłki mające na celu identyfikację czynników gospodarza ważnych dla pośredniczenia w infekcji wirusowej zawsze były priorytetem badawczym. Takie informacje rzucą światło na potencjalne cele terapeutyczne w interwencji przeciwwirusowej. Badania interakcji wirusa norowirusa z gospodarzem były utrudnione przez brak solidnego modelu hodowli komórkowej w ciągu ostatnich 20 lat. W 2016 roku norowirus został ostatecznie z powodzeniem wyhodowany w pochodzącej z komórek macierzystych trójwymiarowej strukturze przypominającej ludzkie jelita, zwanej enteroidem lub mini-jelitem.

W tym badaniu jelitowe komórki macierzyste zostaną wyizolowane z biopsji dwunastnicy pobranych od uczestników, a następnie zróżnicowane w minijelita. Genetyczne badania przesiewowe całego genomu pod kątem istotnych i restrykcyjnych czynników żywiciela zostaną przeprowadzone na zakażonych mini-jelitach odpowiednio przez nokaut CRISPR i wzmocnienie funkcji CRISPR SAM. Kandydaci z krótkiej listy zostaną poddani wstępnej walidacji funkcjonalnej w liniach komórkowych. Dane te dostarczą wglądu w potencjalne cele terapeutyczne przeciwko zakażeniu norowirusem.