Identification des facteurs hôtes des infections à norovirus dans le modèle Mini-Gut

L'objectif principal de cette étude est d'établir une liste des protéines cellulaires de l'hôte qui interviennent dans l'infection à norovirus.

Le norovirus est l'un des agents pathogènes les plus couramment attribués aux maladies diarrhéiques provenant d'aliments insalubres. C'est aussi la principale cause de mortalité chez les jeunes enfants et les adultes dans les infections d'origine alimentaire. Le norovirus n'est pas seulement un fardeau d'origine alimentaire. Dans une méta-analyse récente, le norovirus représente près d'un cinquième de toutes les causes de gastro-entérite aiguë (y compris la transmission interhumaine) dans les contextes sporadiques et épidémiques et affecte tous les groupes d'âge. Il ne fait aucun doute que le norovirus est un problème de santé publique majeur dans les pays développés comme dans les pays en développement. Des efforts de recherche pour mieux comprendre la pathobiologie des norovirus seront nécessaires pour une intervention ciblée.

Du coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient au virus Zika, les efforts pour identifier les facteurs hôtes importants pour la médiation de l'infection virale ont toujours été une priorité de recherche. De telles informations éclaireront les cibles thérapeutiques potentielles dans l'intervention antivirale. Les études sur l'interaction norovirus virus-hôte ont été entravées par l'absence d'un modèle de culture cellulaire robuste au cours des 20 dernières années. En 2016, le norovirus a finalement été cultivé avec succès dans une structure ressemblant à un intestin humain tridimensionnel dérivée de cellules souches appelée entéroïde ou mini-intestin.

Dans cette étude, les cellules souches intestinales seront isolées à partir de biopsies duodénales prélevées sur les participants, suivies d'une différenciation en mini-intestins. Un dépistage génétique à l'échelle du génome pour les facteurs essentiels et restrictifs de l'hôte sera effectué sur les mini-intestins infectés par CRISPR knock-out et CRISPR SAM à gain de fonction, respectivement. Les candidats présélectionnés subiront une validation fonctionnelle préliminaire dans des lignées cellulaires. Ces données fourniront des informations sur les cibles thérapeutiques potentielles contre l'infection à norovirus.