DNA livre de células e sua integridade usando sequências ALU como um biomarcador para diagnóstico de câncer de mama

O câncer de mama (CM) é o câncer mais comum em mulheres em todo o mundo e é a principal causa de morte por câncer entre as mulheres em todo o mundo. A mamografia é o método padrão para detecção precoce de CM em muitos países, com mais de 1,3 milhão de novos casos diagnosticados anualmente. No Egito, o câncer de mama é o câncer mais comum em mulheres, representando 38,8% de todos os cânceres femininos. Embora os programas de triagem radiológica tenham sido aplicados com sucesso na detecção do câncer de mama em estágios iniciais, nenhum biomarcador sanguíneo valioso foi identificado para esse fim. No entanto, as taxas de reconvocação falso-positivo variam de acordo com a idade, densidade da mama e terapia hormonal pós-menopausa, entre outros. Para mulheres com mamas densas, a precisão da mamografia é diminuída. Marcadores séricos circulantes para monitoramento de CM estão em desenvolvimento há várias décadas. Marcadores tumorais convencionais, como antígeno de câncer 15-3 (CA15-3), antígeno carcinoembrionário (CEA) e contagem de células tumorais circulantes (CTC), estão disponíveis clinicamente, no entanto, sua utilidade é limitada principalmente a pacientes com câncer avançado e metastático BC (MBC). Portanto, existe a necessidade de desenvolver novos biomarcadores que possam ser usados ​​como ferramentas valiosas na identificação de pacientes de alto risco, para prever o prognóstico da doença e, assim, ter um impacto no manejo do paciente. DNA livre de células (cfDNA) são fragmentos curtos de ácidos nucleicos presentes em a circulação. Vários estudos também indicaram níveis elevados de DNA cf no câncer de mama. As sequências ALU (Arthrobacter luteus) foram escolhidas, pois são os elementos repetidos mais abundantes e ativos no genoma humano, normalmente com 300 nucleotídeos de comprimento, representando mais de 10% do genoma. A integridade do DNA foi calculada como a razão de (ALU247/ALU115). Como os locais de recozimento de ALU115 estão dentro dos locais de recozimento de ALU247, a proporção de ALU247 para ALU115 é denominada integridade do DNA. Caracteriza o padrão de fragmentação do DNA livre de células circulantes. A integridade do DNA é "1" se o DNA molde não for truncado e "0" se o DNA for completamente truncado em fragmentos menores que 247 pb (par de bases). Assim, foi avaliado por seu papel potencial diagnóstico e prognóstico em pacientes com câncer de mama