Расшифровка нарушений развития у хумамов (devodecode)

Нарушения развития, включающие врожденные аномалии и интеллектуальные нарушения, включая расстройства аутистического спектра, представляют собой обширную группу патологий, вызванных сложным набором генетических и экологических факторов. Они могут поражать несколько органов или тканей, например, аномалии головного мозга, пороки развития головы и шеи, пороки сердца, нарушения скелета, а также офтальмологические или слуховые патологии. Они встречаются примерно в 2–3% случаев живорождений, ежегодно поражая около 150 000 новорожденных в Европе (1). Эти патологии связаны с высокими показателями заболеваемости и смертности. В 2013 году они стали причиной 632 000 смертей во всем мире (2), что представляет собой серьезную социальную, экономическую проблему и проблему здравоохранения.

В совокупности эти заболевания представляют собой серьезную проблему с точки зрения медицинской помощи и генетического консультирования, подчеркивая серьезный дефицит фундаментальных и клинических знаний на сегодняшний день.

В больнице Неккера-Детских болезней и Институте генетических заболеваний Imagine ежегодно проходят лечение от 20 000 до 25 000 пациентов, страдающих широким спектром нарушений развития. Междисциплинарные консультации вместе с современными геномными исследованиями, такими как сравнительная гибридизация генома (CGH) и полноэкзомное секвенирование (WES), предоставляют исследовательским и клиническим группам глубокие знания о естественном течении этих заболеваний и фенотипы больных пациентов, а также лучшее понимание их генетической основы. Несмотря на это, уровень неизвестных диагнозов очень высок (более 65-70% случаев остаются без четкой патофизиологической метки), что связано как с гетерогенностью этих заболеваний, так и со сложностью их генетической архитектуры, вероятно, с участием некодирующей ДНК в много случаев. Поэтому изучение этой некодирующей ДНК требует таких технологий, как полногеномное секвенирование (WGS).

Основная цель проекта DEVO-DECODE — согласовать наши в настоящее время ограниченные знания о генетической архитектуре нарушений развития с нашими более глубокими знаниями об их «феноме». Для решения этой задачи мы предлагаем использовать опыт и ресурсы, доступные в исследовательских и клинических группах Institut Imagine и Hôpital Necker, чтобы:

1. создавать хорошо охарактеризованные, однородные когорты.
2. систематизировать сбор образцов от пациентов для биобанков и других исследований.
3. проводить исследования WGS не только для уточнения данных секвенирования экзома, но, прежде всего, для выявления и подтверждения некодирующих изменений ДНК как в транскрибируемых, так и в нетранскрибируемых геномных доменах.
4. разработать точные доклинические модели для функциональных исследований возможных патофизиологических путей.