Samling av gastrointestinala maligna och icke-maligna mänskliga prover

Syftet med den föreslagna forskningen är att samla in vävnads-, blod- och fekala prover från patienter som genomgår standardvård för sin gastrointestinala sjukdom, inklusive Inflammatory Bowel Disease (IBD) och kolorektal cancer (CRC). Vävnads- och blodprover kommer att tas under procedurer som är en del av normal behandling, inklusive blod- och avföringsuppsamling, kirurgisk resektion och biopsiuppsamling. Prover kommer att tas från patienter med samtycke vid Seton Dell Medical Center vid University of Texas (SDMCUT), eller andra relevanta anläggningar (se avsnitt 6.i nedan), och endast vävnad som inte krävs för histopatologisk analys kommer att samlas in. Inledningsvis kommer fokus att ligga på IBD, och CRC, där det finns omfattande tidigare studier att dra ifrån.

De insamlade proverna från den föreslagna studien kommer att användas för att etablera biomimetiska mänskliga organ-på-ett-chip-plattformar genom att utnyttja mikrofluidisk vävnadsodlingsteknologi. Ett annat fokus för forskningen kommer att vara att studera det mänskliga tarmmikrobiomet som är starkt associerat med patogenesen av mänskliga gastrointestinala sjukdomar. Utredarna har utvecklat mikrochipteknologin för att efterlikna strukturen och fysiologiska funktionen hos mänsklig tarm genom att integrera verktyg utvecklade i en mikrofluidisk enhet, vävnadsteknik och klinisk mikrobiologi, med hjälp av tarmcellinjer. För att återskapa mer tillförlitliga modeller för tarmsjukdomar och för att ytterligare undersöka interaktioner mellan värd och tarmmikrobiom i dessa experimentella plattformar, övergår utredarna till att använda humana kliniska prover. Utredarna kommer att använda vävnadsbiopsier för att odla mänskliga tarmceller inklusive epitel, endotel, bindväv på chipet. Blodprover kommer också att tas för att isolera perifera mononukleära blodceller (PBMC) som representerar en blandad population av vita blodkroppar (WBC). Isolerade WBC kommer att samodlas med tarmceller. Eventuell tillämpning av mikrobiomrelaterade terapier såsom fekal mikrobiotatransplantation (FMT) kommer också att undersökas ytterligare.