Seroprevalens av Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) antikroppar i ett sårbart grannskap, Buenos Aries Argentina

En seroprevalensundersökning på gemenskapsnivå genomfördes i en tvärsnittsdesign under en Participatory Action Research (PAR).

Starter PAR-team: forskare som utvecklade Elisa-testet, virolog som utför analysen av testet och läkare som tjänstgjorde som frivillig fältepidemiolog vid övervakningssystemet (DetectAr Barrio 31) erbjöd tekniskt samarbete för att testa människor som upplever hemlöshet.

PAR-Första steg: Ett prov för bekvämlighet för hemlösa testades under 3 dagar i en populär matsal som sköts av en icke-statlig organisation. Prover togs av en DetectAr-sköterska och en frivillig epidemiolog.

PAR-Andra steg: genomförbarheten fastställdes av DetectAr-samordnarna för Community Health Division av hälsoministeriet och de 12 hälsovårdsarbetarna (HCW) när två frivilliga epidemiologer från ett universitetsinstitut förklarade fältorganisationen (provteknik, datainsamling och databaspost) för att få ett probabilistiskt urval av invånare. PAR-processen var en hörnsten för att nå urvalsstorleken.

PAR-Tredje steget: En tvärsnittsstudie för seroprevalensundersökning genomfördes.

Provstorlek och provmetod Provstorleken beräknades för en seroprevalens på 5 % enligt bevis. En slumpmässig urvalsmetod i två steg användes. Första nivån: sektor av slummen, Andra nivån: geografiska områden som bestäms av Department of Statistics and Census. Trettio hus valdes ut på denna nivå. Personer över 14 år testades vid ytterdörren till sina hus.

Serologiskt test En enzymkopplad immunosorbentanalys [ELISA] utvecklad i Argentina av ett laboratorium i Buenos Aires, Argentina, användes. Prestandaegenskaper är en hög specificitet (>95%) och en hög känslighet (>95%) för SARS-COV-2 IgG. Testet detekterar antikroppar mot två virala antigener, trimerisk spike och spikens receptorbindande domän (RBD). Virala proteiner uttrycktes i mänskliga celler. Detta kit har erhållit myndighetsgodkännande av Argentinas nationella läkemedelsmyndighet (ANMAT, National Administration for Drugs, Food and Medical Devices)[. Blodprover togs i ett kapillärrör från ett fingerstick, taget vid ytterdörren till varje hus. Alla HCWs utbildades och epidemiologiska data fördes in i en databas. Prover bearbetades och analyserades vid virologilaboratoriet på ett pediatriskt sjukhus i Buenos Aires.

Statistisk analys För att erhålla den viktade prevalensen utökades provdatauppsättningen till den från den senaste folkräkningen med tre faktorer: på grannskapsnivå, på hushållsnivå och på individnivå. Beräkningen av expansionsfaktorer på hushållsnivå är inversen av den gemensamma sannolikheten för att välja den sista urvalsenheten (ett hushåll). Expansionsfaktorerna på hushållsnivå innebär tre typer av anpassningar. Den första är relaterad till bortfall (med tanke på att vissa hushåll inte ville svara på enkäten); den andra motsvarar projiceringen av urvalet till hela populationen och den tredje motsvarar kalibreringstekniker med en slutlig justering efter ålders- och könsgrupper, med hjälp av extern information från folkräkningen. Därför var kalibreringsvariabler personer 14 år eller äldre, grupperade efter kön och efter åldersintervall: 14-30; 31-45; 46-59; 60 och mer.

Prevalensen av IgG-antikroppar justerades med hjälp av provtagningsvikter och post-stratifiering för att möjliggöra skillnader i utebliven svarsfrekvens baserat på åldersgrupp, kön och inkomst från folkräkningen.

Eftersom hushållsmedlemmar delar på exponeringen för covid-19, bör resultatet (prevalensen av covid-19 IgG) visa en viss korrelation inom hushållet. För att testa klustringseffekten användes en logistisk regressionsmodell för slumpmässiga effekter (flernivåmodell) eftersom den inkluderar variationen mellan kluster explicit i sannolikheten och därför tar hänsyn till intraklusterkorrelation.