Seroprevalens av Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) antistoffer i et sårbart nabolag, Buenos Aries Argentina

En seroprevalensundersøkelse på samfunnsnivå ble utført i et tverrsnittsdesign under en deltakende handlingsforskning (PAR).

Starter PAR-team: forsker som utviklet Elisa-testen, virolog som utførte analysen av testen og lege som fungerte som frivillig feltepidemiolog ved overvåkingssystemet (DetectAr Barrio 31) tilbød teknisk samarbeid for å teste personer som opplever hjemløshet.

PAR-Første trinn: En prøve for bekvemmelighet for hjemløse ble testet i løpet av 3 dager i en populær spisesal administrert av en ikke-statlig organisasjon. Prøver ble samlet av en DetectAr-sykepleier og en frivillig epidemiolog.

PAR-andre trinn: gjennomførbarhet ble bestemt av DetectAr-koordinatorene til Community Health Division i Helsedepartementet og de 12 helsemiljøarbeiderne (HCWs) da to frivillige epidemiologer fra et universitetsinstitutt forklarte feltorganisasjonen (prøveteknikk, datainnsamling og databaseoppføring) for å få et sannsynlig utvalg av innbyggere. PAR-prosessen var en hjørnestein for å nå prøvestørrelsen.

PAR-Tredje trinn: En tverrsnittsstudie for seroprevalensundersøkelse ble utført.

Prøvestørrelse og prøvemetode Prøvestørrelse ble beregnet for en seroprevalens på 5 % i henhold til bevis. En to-trinns tilfeldig prøvetakingsmetode ble brukt. Første nivå: sektor av slummen, Andre nivå: geografiske områder bestemt av Institutt for statistikk og folketelling. Tretti hus ble valgt på dette nivået. Personer over 14 år ble testet ved inngangsdøren til husene sine.

Serologisk test En enzymkoblet immunosorbentanalyse [ELISA] utviklet i Argentina, av et laboratorium i Buenos Aires, Argentina, ble brukt. Ytelseskarakteristikker er høy spesifisitet (>95 %) og høy sensibilitet (>95 %) for SARS-COV-2 IgG. Testen oppdager antistoffer mot to virale antigener, trimerisk spike og reseptorbindingsdomenet (RBD) til spiken. Virale proteiner ble uttrykt i humane celler. Dette settet har fått regulatorisk godkjenning av Argentinas nasjonale legemiddelmyndighet (ANMAT, National Administration for Drugs, Food and Medical Devices)[. Blodprøver ble tatt i et kapillærrør fra et fingerstikk, tatt ved inngangsdøren til hvert hus. Alle HCW-er ble trent og epidemiologiske data ble lagt inn i en database. Prøver ble behandlet og analysert ved virologilaboratoriet på et pediatrisk sykehus i Buenos Aires.

Statistisk analyse For å få den vektede prevalensen ble prøvedatasettet utvidet til det fra forrige folketelling med 3 faktorer: på nabolagsnivå, på husholdningsnivå og på individnivå. Beregningen av ekspansjonsfaktorer på husholdningsnivå er den inverse av fellessannsynligheten for å velge den siste prøveenheten (en husholdning). Ekspansjonsfaktorene på husholdningsnivå innebærer tre typer tilpasninger. Den første er relatert til frafall (gitt at noen husholdninger ikke ønsket å svare på undersøkelsen); den andre tilsvarer projeksjonen av utvalget til hele populasjonen, og den tredje til kalibreringsteknikker med en endelig justering etter alders- og kjønnsgrupper, ved bruk av ekstern informasjon fra folketellingen. Derfor var kalibreringsvariabler personer 14 år eller eldre, gruppert etter kjønn og etter aldersintervaller: 14-30; 31-45; 46-59; 60 og mer.

Prevalensen av IgG-antistoffer ble justert ved hjelp av prøvetakingsvekter og post-stratifisering for å tillate forskjeller i frafallsrater basert på aldersgruppe, kjønn og inntekt i folketellingen.

Siden husholdningsmedlemmer deler eksponering for covid-19, bør derfor utfallet (prevalens av covid-19 IgG) vise en viss sammenheng i husholdningen. For å teste klyngeeffekten ble en logistisk regresjonsmodell for tilfeldige effekter (flernivåmodell) brukt da den inkluderer variasjonen mellom klynger eksplisitt i sannsynligheten og derfor tar hensyn til intraclusterkorrelasjon.