Koronavirustaudin 2019 (COVID-19) vasta-aineiden seroprevalenssi haavoittuvassa naapurustossa, Buenos Aries Argentiina

Yhteisötason seroprevalenssitutkimus tehtiin poikkileikkaussuunnitelmassa osallistuvan toimintatutkimuksen (PAR) aikana.

Starter PAR -tiimi: Elisa Testin kehittänyt tutkija, testin analysointia suorittava virologi ja valvontajärjestelmän (DetectAr Barrio 31) vapaaehtoisena kenttäepidemiologina toiminut lääkäri tarjosivat teknistä yhteistyötä kodittomuuden kokeneiden testaamiseen.

PAR-Ensimmäinen vaihe: Kodittomien mukavuusnäyte testattiin 3 päivän ajan suositussa, kansalaisjärjestön johtamassa ruokasalissa. Näytteet keräsivät DetectAr-sairaanhoitaja ja vapaaehtoinen epidemiologi.

PAR-Toinen vaihe: Terveysministeriön yhteisön terveysosaston DetectAr-koordinaattorit ja 12 terveysalan työntekijää (HCW) määrittelivät toteutettavuuden, kun kaksi vapaaehtoista epidemiologia yliopistoinstituutista selittivät kenttäorganisaation (näytteenottotekniikka, tiedonkeruu ja tietokantamerkintä) asukkaiden todennäköisyyspohjaisen otoksen saamiseksi. PAR-prosessi oli kulmakivi otoskoon saavuttamiselle.

PAR-Kolmas vaihe: Poikkileikkaustutkimus seroprevalenssitutkimuksesta suoritettiin.

Näytteen koko ja näytemenetelmä Näytteen koko laskettiin 5 %:n seroprevalenssille todisteiden mukaan. Käytettiin kaksivaiheista satunnaisotantamenetelmää. Ensimmäinen taso: slummien sektori, toinen taso: Tilasto- ja väestölaskentalaitoksen määrittelemät maantieteelliset alueet. Tällä tasolla valittiin kolmekymmentä taloa. Yli 14-vuotiaita testattiin heidän talonsa ulko-ovella.

Serologinen testi Käytettiin Argentiinassa Buenos Airesissa, Argentiinassa sijaitsevassa laboratoriossa kehitettyä entsyymikytkentäistä immunosorbenttimääritystä [ELISA]. Suorituskykyominaisuudet ovat korkea spesifisyys (> 95 %) ja korkea herkkyys (> 95 %) SARS-COV-2 IgG:lle. Testi havaitsee vasta-aineet kahta virusantigeeniä, trimeeripiikkiä ja piikin reseptoria sitovaa domeenia (RBD) vastaan. Virusproteiinit ilmentyivät ihmissoluissa. Tämä sarja on saanut Argentiinan kansallisen lääkevalvontaviraston (ANMAT, National Administration for Drugs, Food and Medical Devices) hyväksynnän[. Verinäytteet otettiin kapillaariputkeen sormenpistosta jokaisen talon etuovesta. Kaikki HCW:t koulutettiin ja epidemiologiset tiedot syötettiin tietokantaan. Näytteet käsiteltiin ja analysoitiin virologian laboratoriossa lastensairaalassa Buenos Airesissa.

Tilastollinen analyysi Painotetun esiintyvyyden saamiseksi otosaineistoa laajennettiin viimeisimmän väestönlaskennan tietoihin kolmella tekijällä: naapurustasolla, kotitaloustasolla ja yksilötasolla. Laajennemiskertoimien laskeminen kotitaloustasolla on käänteisarvo yhteiselle todennäköisyydelle valita viimeinen otantayksikkö (kotitalous). Kotitaloustason kasvutekijät sisältävät kolmenlaisia ​​sopeutuksia. Ensimmäinen liittyy vastaamatta jättämiseen (koska jotkin kotitaloudet eivät halunneet vastata kyselyyn); toinen vastaa otoksen projisointia koko väestöön ja kolmas kalibrointitekniikoita, joissa on lopullinen säätö ikä- ja sukupuoliryhmittäin käyttäen ulkopuolista väestölaskennan tietoa. Siksi kalibrointimuuttujat olivat 14-vuotiaita tai sitä vanhempia ihmisiä ryhmiteltynä sukupuolen ja iän mukaan: 14-30; 31-45; 46-59; 60 ja enemmän.

IgG-vasta-aineiden esiintyvyyttä säädettiin käyttämällä näytteenottopainoja ja jälkikerrosta, jotta ikäryhmän, sukupuolen ja väestönlaskennan tulojen perusteella voidaan ottaa huomioon erot reagoimattomuusasteessa.

Koska kotitalouden jäsenet jakavat altistumisen COVID-19-tartunnalle, tuloksen (COVID-19 IgG:n esiintyvyys) pitäisi näyttää jonkin verran korrelaatiota kotitalouden sisällä. Klusterivaikutuksen testaamiseen käytettiin satunnaisvaikutusten logistista regressiomallia (monitasomalli), koska se sisältää klustereiden välisen vaihtelun nimenomaisesti todennäköisyydessä ja ottaa siksi huomioon klusterin sisäisen korrelaation.