BBOT: Bakteriální zátěž u ortotraumatických procedur

Infikované zlomené kosti, které se nehojí, jsou obtížným klinickým problémem, který významně ovlivňuje kvalitu života pacienta. Současná metodika detekce bakterií (růst v laboratorních kulturách) je nedostatečná pro detekci infekcí způsobených bakteriemi existujícími v biofilmu, což je vrstva „slizu“ nalezená v přítomnosti cizích těles (např. implantované kovové prostředky k fixaci zlomených kostí) . Pokroky v molekulární biologii umožnily vývoj vysoce citlivých testů k detekci bakterií ve stavu biofilmu. Omezený předchozí výzkum však nezahrnoval kontrolní skupiny ani neporovnával výkon různých vysoce citlivých testů. Aby se tato omezení vyřešila a dále definovala úloha vysoce citlivých bakteriálních testů v klinické praxi, předpokládají výzkumníci, že při srovnání čistého chirurgického zákroku zlomené kosti (1. operace) s odstraněním implantovaného kovového zařízení (2. operace, kost zhojená) bude narůstat bakteriální zátěž. indexovat operaci nesrůstání (následný chirurgický zákrok, kost se nezhojila) měřeno procentem případů pozitivních na bakterie pomocí vysoce citlivých bakteriálních testů. Navíc vysoce citlivé bakteriální testy (systém Illumina MiSeq a biosenzor Ibis T5000) budou mít podobnou schopnost kvantifikovat počet bakterií a odlišit bakteriální druhy. Způsobilí pacienti se budou skládat ze tří skupin. Skupina 1 je čistý chirurgický zákrok zlomené kosti podstupující fixaci dlahou a šroubem, fixaci nitrodřeňovým hřebem tam, kde je místo zlomeniny přístupné, nebo postupnou léčbu zlomených kostí, která byla původně ošetřena kloubem zahrnujícím externí fixační zařízení. Skupina 2 bude zahrnovat pacienty s odstraněnou dlahou a šrouby bez klinických známek infekce. Skupinu 3 budou tvořit pacienti, kteří podstoupí počáteční proceduru pro neshojení zlomeniny. Tkáň získaná v době operace bude odeslána do výzkumné laboratoře ke kultivaci a provedení dvou vysoce citlivých testů. Odebrané vzorky tkáně budou v průběhu těchto konkrétních postupů normálně odstraněny a zlikvidovány. Míry pozitivity pro kultivaci a vysoce citlivé testy budou porovnány mezi těmito třemi skupinami. Výzkumníci budou také porovnávat počet bakterií a distribuci bakteriálních druhů nalezených pomocí dvou vysoce citlivých testů. Tato data pak projdou statistickou analýzou proti klinickým datům získaným z přehledu pacientských tabulek. Celkovým cílem projektu je stanovit klinickou relevanci vysoce citlivých bakteriálních testů při diagnostice infikovaných nesrůstů. Schopnost přesněji identifikovat pacienty s infekcí může vést ke změně klinického rozhodování s ohledem na chirurgický zákrok nebo léčbu antibiotiky. Tento projekt rozvine lepší porozumění potenciální roli vysoce citlivých bakteriálních testů při diagnostice infikovaných nesrůstů ve srovnání se současným standardem péče, kterým je pěstování bakterií v laboratoři za umělých podmínek.