BBOT : charge bactérienne dans les procédures d'ortho-traumatologie

Les os infectés et brisés qui ne guérissent pas sont un problème clinique difficile qui affecte considérablement la qualité de vie des patients. La méthodologie actuelle de détection des bactéries (croissance dans les cultures de laboratoire) est inadéquate pour détecter les infections causées par des bactéries présentes dans un biofilm, qui est la couche de « vase » trouvée en présence de corps étrangers (par exemple, des dispositifs métalliques implantés pour réparer les os cassés) . Les progrès de la biologie moléculaire ont permis le développement de tests très sensibles pour détecter les bactéries à l'état de biofilm. Cependant, les recherches antérieures limitées n'ont pas inclus de groupes témoins ni comparé les performances de différents tests très sensibles. Pour répondre à ces limitations et mieux définir le rôle des tests bactériens hautement sensibles dans la pratique clinique, les chercheurs émettent l'hypothèse qu'il y aura une augmentation de la charge bactérienne lors de la comparaison de la chirurgie des os cassés propres (1ère chirurgie) au retrait du dispositif métallique implanté (2ème chirurgie, os cicatrisé) pour indexer la chirurgie de pseudarthrose (chirurgie ultérieure, os non cicatrisé) telle que mesurée par le pourcentage de cas positifs pour les bactéries à l'aide de tests bactériens très sensibles. De plus, les tests bactériens hautement sensibles (système Illumina MiSeq et biocapteur Ibis T5000) auront une capacité similaire à quantifier le nombre de bactéries et à différencier les espèces bactériennes. Les patients éligibles seront constitués de trois groupes. Le groupe 1 est une chirurgie propre des os fracturés subissant une fixation par plaque et vis, une fixation par enclouage intramédullaire où le site de fracture est accessible ou un traitement par étapes d'un os fracturé initialement traité par un dispositif de fixation externe enjambant l'articulation. Le groupe 2 comprendra des patients ayant une plaque et des vis retirées sans signe clinique d'infection. Le groupe 3 sera composé de patients subissant une procédure initiale pour une pseudarthrose de fracture. Les tissus obtenus au moment de la chirurgie seront envoyés au laboratoire de recherche pour la culture et la réalisation des deux tests hautement sensibles. Les échantillons de tissus prélevés seront des tissus normalement retirés et jetés au cours de ces procédures particulières. Les taux de positivité pour la culture et les tests très sensibles seront comparés entre les trois groupes. Les enquêteurs compareront également le nombre de bactéries et la distribution des espèces bactériennes trouvées à l'aide des deux tests très sensibles. Ces données seront ensuite soumises à une analyse statistique par rapport aux données cliniques recueillies à partir de l'examen des dossiers des patients. L'objectif global du projet est d'établir la pertinence clinique des tests bactériens hautement sensibles dans le diagnostic des pseudarthroses infectées. La capacité d'identifier plus précisément les patients infectés peut entraîner un changement dans la prise de décision clinique en ce qui concerne l'intervention chirurgicale ou le traitement antibiotique. Ce projet développera une meilleure compréhension du rôle potentiel des tests bactériens hautement sensibles dans le diagnostic des pseudarthroses infectées par rapport à la norme de soins actuelle, qui consiste à cultiver des bactéries en laboratoire dans des conditions artificielles.