Změny střevní mikrobioty po enterální výživě (u alkoholické hepatitidy) (CREED)

Subjekty přijaté do nemocnice s diagnózou alkoholické hepatitidy a u kterých je plánována nasogastrická výživa po dobu alespoň 7 dnů, budou způsobilé pro studii.

Vzorek stolice bude odebrán před zahájením enterální výživy nazogastrickou sondou a analyzován. Následně budou odebrány další vzorky stolice a analyzovány v den 3 a den 7 po zahájení nasogastrické výživy.

Z každého vzorku bude extrahována DNA a bakteriální 16S rRNA geny budou amplifikovány pomocí PCR a odeslány k sekvenování v CGEBM pomocí přístroje Illumina MiSeq. To vygeneruje alespoň 2 miliony párových koncových čtení (2 x 300 bp), které budou sestaveny a analyzovány pomocí softwarové platformy Mothur. Výzkumníci budou také analyzovat profily mastných kyselin s krátkým řetězcem ve vzorcích stolice pomocí plynové chromatografie. Shannonův index diverzity bude použit k posouzení bakteriální diverzity a Pielouův index bude použit k posouzení rovnoměrnosti druhů v každém časovém bodě. Bude provedeno srovnání mezi časovými body. Složení mikroflóry v různých časových bodech bude hodnoceno pomocí softwaru Mothur, aby se zjistilo, zda dochází k systematickým změnám specifických členů střevní mikroflóry během enterální výživy. Prevalence pomocí různých molekulárních metodologií bude hodnocena a výsledky od studovaných pacientů budou porovnány s jejich základními vzorky pomocí Fisherova exaktního testu.

Chybějící data budou řešena pomocí chybějícího indikátoru.

Subjekty budou osloveny týmem odpovědným za klinickou péči a bude jim nabídnuta možnost vstoupit do studie. Informační leták bude subjektu poskytnut 24 hodin před souhlasem a možností projednání se zkušebním týmem.

Data budou shromažďována autorizovanými členy zkušebního týmu ve vhodné ad hoc databázi Excel chráněné heslem jako eCRF. Zdrojovými daty budou elektronická dokumentace pacienta nebo papírové poznámky k případu. Zdrojovými daty analýzy mikrobiomů bude počítačová zpráva. Přesnost zadávání údajů bude kontrolovat samostatný pověřený člen týmu. Externí monitorování probíhá pravidelně u klinického hodnocení, které zajišťuje zadavatel.

Důvěrnost pacienta bude po celou dobu zachována. Nebudou shromažďovány žádné identifikovatelné údaje. eCRF bude chráněn heslem a uložen v zašifrovaném nemocničním počítači chráněném heslem. souhlas nebo jiná listinná dokumentace bude uchovávána odděleně v uzamčených skříních v areálu nemocnice.

Hlášení nežádoucích příhod bude provedeno kompetentním a pověřeným zaměstnancem v souladu s naším standardním operačním postupem sponzora a bude zaznamenáno.