Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Nye genomiske teknikker og behandling af multiresistent tuberkulose (GENO-MDR)

28. marts 2022 opdateret af: Assistance Publique - Hôpitaux de Paris

Nye genomiske værktøjers indvirkning på behandlingen af ​​patienter med multiresistent tuberkulose

I forbindelse med fremkomsten af ​​tilfælde af multiresistent tuberkulose (MDR-TB) er det afgørende at forbedre patientbehandlingen. Derfor vurderer man stedet for innovative strategier, der muliggør diagnosticering af disse tilfælde (f.eks. WGS og Deeplex-MycTB) i den personlige pleje af patienter med MDR-TB og rationaliseringen af ​​medicinske biologiske procedurer er et stort problem. Dette projekt deltager i disse mål, da efterforskerne vil: (i) vurdere de diagnostiske kvaliteter og ydeevnen af ​​de forskellige innovative strategier, der muliggør påvisning af resistens over for anti-tuberkuloselægemidler, (ii) vurdere virkningen af ​​disse strategier i implementeringen af ​​personaliserede behandlinger for MDR-TB-patienter, og (iii) vurdere de samlede omkostninger ved disse strategier.

Studieoversigt

Status

Rekruttering

Detaljeret beskrivelse

Ikke-interventionel monocentrisk undersøgelse om evaluering af pålideligheden og validiteten af ​​en diagnostisk test baseret på en biologisk samling af M. tuberculosis MDR-stammer modtaget på NRC-MyRMA. Undersøgelsen vil gælde for alle stammer og prøver af multiresistent M. tuberculosis påvist i Frankrig. Disse stammer sendes alle til NRC-MyRMA (Nationalt referencecenter for mykobakterier og resistens over for anti-tuberkuloselægemidler) til testning af lægemiddelfølsomhed (DST) til første- og andenlinje-anti-tuberkuloselægemidler i overensstemmelse med de nationale retningslinjer.

I øjeblikket udføres en genotypisk og fænotypisk diagnose af antibiotikaresistens ved modtagelse af en stamme af M. tuberculosis MDR ved CNR-MyRMA, henholdsvis ved PCR-sekvensteknikker og kommercielle kits og ved fænotypisk antibiogram ved referencemetoden kaldet proportioner. I tilfælde af en prøve er kun den genotypiske diagnose umiddelbart gennemførlig, realiseringen af ​​den fænotypiske diagnose kan kun udføres fra en stamme, så efterforskerne skal vente på, at der opnås en positiv kultur.

Ud over denne nuværende strategi vil to innovative strategier baseret på sekventering af stammernes komplette genom (WGS og Deeplex-MycTB) blive implementeret. Disse analyser kræver ikke en ekstra patients prøver.

Følsomhederne og specificiteterne og arealet under ROC-kurven for de forskellige tests, med hensyn til hver modstand, vil blive beregnet, og deres konfidensinterval vil blive estimeret ved bootstrap. Sammenligningen af ​​sensitiviteter, specificiteter og arealer under kurven mellem de forskellige teknikker vil blive udført ved en Gaussisk test baseret på en bootstrap. Overensstemmelsen mellem de forskellige tests vil blive målt ved at beregne en Cohen kappa. Et Kappa-konfidensinterval vil blive estimeret ved bootstrap. Kappaen mellem hver genotypisk metode og den fænotypiske metode vil blive sammenlignet med en Gaussisk test baseret på en bootstrap.

Sammenligningen af ​​resultaternes rapporteringstid vil blive udført ved en sammenligningstest af rækkernes symmetri med hensyn til medianværdien (Mann Whithney Wilcoxon test.

Generelt vil de kvantitative variable blive beskrevet ved de klassiske positionsmålinger (middelværdi, median, 1. og 3. kvartil, minimum og maksimum) og spredningsmål (standardafvigelse). Kvalitative variable vil blive beskrevet i form af absolut værdi og procent.

Grad af statistisk signifikans:

Signifikansniveauet for testene vil blive sat til en alfa på 0,05.

Software:

Alle analyser vil blive udført på URC på SAS-software eller R-software i deres seneste version, der er tilgængelig på det tidspunkt, de udføres.

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Forventet)

172

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiekontakt

Studiesteder

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

18 år og ældre (VOKSEN, OLDER_ADULT)

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Køn, der er berettiget til at studere

Alle

Prøveudtagningsmetode

Ikke-sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Alle patienter diagnosticeret med MDR-TB i Frankrig i løbet af projektets rammetid

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • alder ≥ 18 år;
  • patient med bakteriologisk påvist tuberkulose på grund af en multilægemiddelresistensstamme (dvs. resistent over for rifampin og isoniazid)
  • patient informeret om undersøgelsen og ikke er imod at deltage i forskningen

Ekskluderingskriterier:

  • Patient med tuberkulose uden MDR;
  • Umulighed at udføre et fænotypisk antibiogram (fravær af bakteriekultur, forurenet kultur)

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

Kohorter og interventioner

Gruppe / kohorte
Kohorte
Patienter diagnosticeret med MDR-TB

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Følsomhed til påvisning af bedaquilinresistens
Tidsramme: Ved slutningen af ​​tilmeldingen
Følsomheden af ​​WGS-baserede strategier vil blive sammenlignet med fænotypisk strategi til påvisning af bedaquilins resistens
Ved slutningen af ​​tilmeldingen

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Præstationer (deadlines for at opnå resultater, sensitivitet, specificitet) for at identificere arten i tuberkulosekomplekset og for at diagnosticere resistens over for anti-tuberkulosemedicin
Tidsramme: Ved slutningen af ​​tilmeldingen
Sammenligning af ydeevnen (deadlines for opnåelse af resultater, sensitivitet, specificitet) af WGS- og Deeplex-MycTB-strategier sammenlignet med ydeevnen af ​​den fænotypiske referencemetode, for at identificere arterne i tuberkulosekomplekset og for at diagnosticere resistens over for anti-tuberkuloselægemidler fra bakteriekulturer og direkte fra positive prøver ved mikroskopisk undersøgelse
Ved slutningen af ​​tilmeldingen
Antal anti-tuberkulose-dage
Tidsramme: Ved slutningen af ​​tilmeldingen
Sammenligning af antallet af anti-tuberkulose-dage, der ville være blevet ordineret ved overskud eller ved en fejl mellem den dato, hvor resultaterne af de genotypiske lægemiddelfølsomhedstests er tilgængelige og modtagelsen af ​​prøven eller stammen for hver af strategierne, og datoen, hvor endelige lægemiddelfølsomhedsresultater er tilgængelige (dvs. dem opnået med den fænotypiske metode, som er referencemetoden)
Ved slutningen af ​​tilmeldingen
Ydeevner (følsomhed, specificitet) af WGS-strategien ved at bruge forskellige pipelines
Tidsramme: Ved slutningen af ​​tilmeldingen
Følsomheden og specificiteten af ​​WGS-resultaterne analyseret med forskellig pipeline ((BioNumerics, TB-Profiler, PhyResSe) samt CNR-MyrMA egen pipeline) vil blive sammenlignet med lægemiddelfølsomhedstestresultatet af den fænotypiske metode, som er referencen. metode
Ved slutningen af ​​tilmeldingen
Antal laboratorieprocedurer
Tidsramme: Ved slutningen af ​​tilmeldingen
Antal laboratorieprocedurer udført for WGS- og Deeplex-MycTB-strategier sammenlignet med antallet af procedurer udført for den nuværende genotypiske strategi anvendt på CNR-MyrMA
Ved slutningen af ​​tilmeldingen
Omkostninger til personlig tid og laboratorieprocedurer
Tidsramme: Ved slutningen af ​​tilmeldingen
Omkostninger til personlig tid (medicinsk og ikke-medicinsk) og laboratorieprocedurer, der kræves til WGS- og Deeplex-MycTB-strategier sammenlignet med omkostninger til personlig tid og laboratorieprocedurer, der kræves til de genotypiske metoder, der anvendes på CNR-MyrMA
Ved slutningen af ​​tilmeldingen

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Efterforskere

  • Ledende efterforsker: Alexandra AUBRY, Pr, Pitié Salpêtrière Hospital AP-HP

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (FAKTISKE)

29. august 2020

Primær færdiggørelse (FORVENTET)

1. september 2022

Studieafslutning (FORVENTET)

1. december 2022

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

12. maj 2020

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

19. maj 2020

Først opslået (FAKTISKE)

21. maj 2020

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (FAKTISKE)

29. marts 2022

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

28. marts 2022

Sidst verificeret

1. marts 2022

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Multi-Drug Resistent Tuberkulose

Abonner