Nenäliman proteomi ja immunoterapia

Nenän lima nenän limakalvon ensimmäisenä puolustusesteenä sisältää erilaisia ​​proteiineja, jotka toimivat toiminnallisina yksiköinä. Osoitimme äskettäin, että nenän liman proteomi allergisen nuhan potilaiden ja terveiden kontrollien välillä on muuttunut merkittävästi. Proteiinitasolla immuunivaste allergisessa nuhassa voimistuu ja estetoiminta heikkenee, mikä näkyy lisääntyneen epiteelin läpäisevyyden vuoksi. Lisäksi synnynnäisissä antiproteaaseissa on epäsuotuisa epätasapaino. Siitepölyjyvissä olevia proteaaseja ei siksi voitu deaktivoida riittävästi limassa, mikä vaurioittaa edelleen epiteeliä, mikä johtaa allergeenien limakalvon alle tunkeutumiseen ja helpottaa niiden esiintymistä antigeeniä esitteleville soluille.

Tämän projektin tavoitteena on osoittaa muutoksia nenän limaproteomissa allergisen nuhapotilaiden ja terveiden kontrollien välillä siitepöly- ja ei-siitepölykaudella sekä selvittää, muuttuuko proteomi immunoterapian aikana ja jos niin miten. Ensimmäistä tarkoitusta varten potilaat ja terveet kontrollit otetaan mukaan kahtena ajankohtana, nimittäin siitepölykauden aikana ja sen ulkopuolella. Tilastolliset erot määritellään ryhmien sisällä ja ryhmien välillä. Proteiinimuutokset ajan mittaan heijastavat sitä, kuinka allergiset, mutta myös terveet kontrollit reagoivat allergeenihaasteeseen. Tulosten pitäisi antaa käsitys mahdollisista biomarkkereista, joita voitaisiin käyttää diagnostiikassa ja terapiassa. Proteiinin substituutio tai esto voi olla tulevaisuuden hoitomuoto nenäliman estetoiminnan vahvistamiseksi ja allergisen nuhan oireiden hoitamiseksi. Immunoterapian vaikutus ainoana syyhoitona selvitetään ja terapiaan reagoivia verrataan ei-vasteisiin. Oletamme, että vastaajat osoittavat proteomimuutoksia, jotka ovat samanlaisia ​​​​kuin terveet olosuhteet. Tämä konkretisoi edelleen erilliset proteiinit biomarkkereina, joita voitaisiin käyttää terapeuttisina aineina. Lisäksi proteomimuutoksia voitaisiin käyttää ennustamaan ja seuraamaan terapeuttista menestystä tai epäonnistumista, ja potilaat voidaan jakaa muiden terapeuttisten strategioiden kohteeksi kuin immunoterapia säästäen aikaa ja rahaa.

Lima kerätään erityisellä imulaitteella, jossa on limaloukku. Sitten proteominen analyysi suoritetaan LC MS/MS-massaspektrometrialla. Tietokantahaku tunnistaa erilliset proteiinit ja niiden toiminta, alkuperä jne. merkitään. Proteiiniryhmät analysoidaan reitin rikastamisen ja klusterianalyysin avulla. Tällä tavoin monimutkaista proteomista dataa voidaan visualisoida proteiiniverkostojen ja toimintojen globaalien muutosten ymmärtämiseksi paremmin.

Nenän liman proteomin tutkiminen sairaassa ja terveessä tilassa johtaa parempaan ymmärrykseen sen estetoiminnasta ja reaktiosta allergeeneihin. Erillisiä proteiineja ja/tai proteiiniryhmiä voitaisiin käyttää biomarkkereina uusissa diagnostisissa ja terapeuttisissa lähestymistavoissa. Lisäksi voidaan määrittää immunoterapian mekanismeja vasteessa ja hoidon onnistuminen tai epäonnistuminen.