Mikrobiomi syöpäpotilailla, joilla on suuriannoksinen kemoterapia kantasolusiirrolla (SCTMICROBIOM)

Tällä hetkellä saatavilla olevat löydökset, jotka tulevat pääasiassa allo-HSCT-tutkimuksista (hematopoieettisten solujen siirto), yhdistävät tietyt muutokset mikrobiotassa yleiseen eloonjäämiseen ja siirroksen jälkeisiin häiriöihin, erityisesti GvHD:hen. Rajallisten tietojen mukaan mikrobiomikoostumuksen muutosten ja toksisuuksien välisten yhteyksien lisäarviointi. Sekä mikrobiomin että isännän immuunijärjestelmän yksityiskohtainen tutkimus voi auttaa löytämään mikrobiomimarkkereita, jotka ovat hyödyllisiä sellaisten potilaiden hyvin varhaisessa tunnistamisessa, joilla on riski saada merkittäviä siirtoon liittyviä komplikaatioita. Tämä saattaa tuoda mahdollisuuden moduloida suoliston mikrobiota potilaalle sopivalla tavalla optimaalisen terapeuttisen tuloksen ja seurannan saavuttamiseksi välttäen samalla vakavia transplantaation jälkeisiä komplikaatioita.

Tämä on prospektiivinen, yhden keskuksen, ei-satunnaistettu hypoteesia luova tutkimus. Potilaita pyydetään toimittamaan näyte veristä, virtsasta ja ulosteesta. Tätä verta käytetään plasma- ja seerumipankkiin lisäanalyysiä varten, mukaan lukien mikro-RNA:n (miR) ja kemokiinien havaitseminen. Ulostetta käytetään mikrobiomitutkimuksiin - kokonais-DNA/RNA:n ja 16S:n (prokaryoottisen ribosomin pienen alayksikön RNA-komponentin) rRNA:n (ribosomaalisen ribonukleiinihapon) geenin sekvensointiin bakteerien taksonomista luokittelua varten. Lisäksi käytetään metagenomista sekvensointia ja myöhempää taksonomista ja toiminnallista mikrobigeenien luokittelua, mukaan lukien mikrobiomin mahdollisesti kliinisesti merkityksellisten piirteiden, kuten antibioottiresistenssin ja mikrobien virulenssitekijöiden karakterisointi.