Tämä sivu käännettiin automaattisesti, eikä käännösten tarkkuutta voida taata. Katso englanninkielinen versio lähdetekstiä varten.

Horisontaalisen tietojen integrointiluokituksen kehittäminen rintasyövän ei-invasiivista varhaista diagnosointia varten (RENOVATE)

maanantai 31. lokakuuta 2022 päivittänyt: Ospedale Policlinico San Martino

Tämä on translatiivinen voittoa tavoittelematon tutkimus. Ehdotuksemme tavoitteena on luoda ei-invasiivinen Horizontal Data Integration (HDI) -luokittelu rintasyövän varhaiseen diagnosointiin, ja lopullisena tavoitteena on välttää useimmissa tapauksissa turhat biopsiat radiologisen seulonnan aikana havaituista epäillyistä tapauksista.

Naiset, joilla on radiologisesti tunnistettu leesiot, BIRADS-3/4/5, jotka ovat radiologisen arvioinnin mukaan alle 2 cm (eli radiologinen T1), otetaan mukaan ja kutsutaan luovuttamaan ääreisverinäytteitä (35 ml) ja virtsanäytteitä (50 ml). Radiologisia kuvia sekä demografisia ja anatomopatologisia tietoja kerätään.

Tämän projektin tavoitteena on kehittää HDI-luokitin, joka mahdollistaa rintasyövän varhaisen noninvasiivisen diagnoosin rintabiopsiaa vastaavalla tarkkuudella. Tällainen luokitin kehitetään perifeerisen veren (ctDNA, proteiinit, eksosomit) ja virtsan (ctDNA) molekyyliprofiilin korrelaation perusteella, joka on kerätty T0:ssa (perustaso, ennen diagnostista biopsiaa) ja bioptisen diagnoosin välillä. Ääreisveren (ctDNA, proteiinit, eksosomit) ja virtsan (ctDNA) profiilin arviointi kahdessa vaiheessa diagnosoiduissa pT1-rintasyövissä (T0: lähtötaso, ennen biopsiaa; T1: pT1-rintasyövän diagnoosin jälkeen) antaa meille mahdollisuuden erottaa kasvain- ja isäntäspesifiset molekyylimuutokset rintasyövän esiintymisen/puuttumisen yhteydessä.

Tutkimuksen yleiskatsaus

Yksityiskohtainen kuvaus

Tausta: Tällä hetkellä invasiivisen rintasyövän varhainen diagnoosi perustuu mammografian ja ultraäänen yhteiskäyttöön. Nämä lähestymistavat ovat edelleen epäoptimaalisia tarkkuuden suhteen, ja radiologista epäilyä varten tarvitaan vahvistusbiopsia tai palautustestit. Viime aikoina syövän noninvasiivisten biomarkkerien tutkimus on saanut valtavasti kiinnostusta, jota on edistänyt teknologian kehitys ja mahdollisuudet havaita pahanlaatuisia kasvaimia varhaisessa vaiheessa. Mikään tutkimus ei kuitenkaan ole toistaiseksi yrittänyt soveltaa biologisesti erilaisten analyyttien samanaikaista arviointia ja datan karakterisointialgoritmeja (radiomiikkalähestymistapoja) varhaisen rintasyövän diagnoosin tarkkuuden lisäämiseksi.

Hypoteesi: Useita biologisia analyyttejä on yhdistettävä radiomiikan algoritmien tarkentamiseen, jotta voidaan voittaa varhaisen rintasyövän diagnoosin nykyiset rajoitukset. Hankkeen yleisenä tavoitteena on kehittää horisontaalinen dataintegraatio (HDI) luokitin, joka mahdollistaa invasiivisen rintasyövän varhaisen noninvasiivisen diagnoosin suurella tarkkuudella.

Tavoitteet: Tavoite 1: Testaa suorituskykyä pienten invasiivisten rintasyöpien diagnosoinnissa a) ultrasensitiivisellä seuraavan sukupolven sekvensoinnilla kiertävässä kasvain-DNA:ssa (ctDNA); b) aptameeri-emäs-proteomiikkajärjestelmät plasmaproteiineilla; c) radiomiikan koneoppimisalgoritmit. Tavoite 2: Kehittää edellä mainittuihin menetelmiin perustuva HDI-luokitin, jonka tavoitteena on vähentää invasiivisten toimenpiteiden tarvetta varhaisessa rintasyövän diagnosoinnissa. Tavoite 3: Parantaa HDI-luokittimen suorituskykyä integroimalla muita mahdollisesti transformatiivisia noninvasiivisen diagnoosin menetelmiä.

Kokeellinen suunnittelu: Perifeeriset veri- ja virtsanäytteet kerätään mahdolliselta 750 potilaan kohortilta, joilla on radiologisesti epäiltyjä pieniä rintavaurioita ja joille tehdään diagnostinen biopsia San Martinon sairaalan Diagnostics Senology Unitissa. Ultrasensitive Next Generation Sekvensointi (NGS) plasman ctDNA:lle suoritetaan käyttämällä mukautettua tagged-amplikonipaneelia, jonka olemme suunnitelleet 3 269 sekvensoidun rintasyöpätapauksen kohortille GENIE-aloitteesta. Meille tullaan myös soveltamaan uutta protokollaa, jota kutsutaan soluttomaksi metyloiduksi DNA-immunosaostukseksi ja korkean suorituskyvyn sekvensoinniksi (cfMeDIP-seq) yhteistyössä Bostonin Dana Farber Cancer Instituten kanssa pienten plasma- ja virtsan ctDNA-määrien metylomianalyysiin. Mahdollisia syöpään liittyviä plasmaproteiineja analysoidaan SomaScanin aptameeripohjaisten proteiinien avulla yhteistyössä Sidra Medical Centerin kanssa, Doha, Qatar. Genovan yliopiston sponsoroiman ASTOUND-tutkimuksen tutkivassa alaryhmässä Senology-tiimin kehittämä radiomiikan luokitin koulutetaan ja testataan samassa kohortissa. Myös muita noninvasiivisia diagnostisia menetelmiä arvioidaan. HDI-luokitin luodaan ctDNA:n, proteomiikan ja radiomiikan tuloksista käyttämällä kehittyneitä koneoppimismenetelmiä. HDI-luokittajamme integroidaan lopulta tarpeen mukaan muihin ennustajiin ja validoidaan kohortissamme.

Odotetut tulokset: 1. Huippuluokan ei-invasiivisten menetelmien suorituskyvyn arviointi varhaisen rintasyövän diagnoosin yhteydessä. 2. Varhaisen rintasyövän noninvasiivisen HDI-luokittajan kehittäminen. 3. Uudet biologiset oivallukset pienistä rintasyövistä.

Vaikutus syöpään: 1. Varhaisen rintojen diagnoosin tarkkuuden lisääminen nykyisiin menetelmiin verrattuna. 2. Muistutusten ja invasiivisten testien tarpeen vähentäminen rintasyövän diagnosoinnissa. 3. Pitkäaikainen vaikutus rintasyöpäkuolleisuuteen.

Opintotyyppi

Interventio

Ilmoittautuminen (Todellinen)

367

Vaihe

  • Ei sovellettavissa

Yhteystiedot ja paikat

Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.

Opiskelupaikat

      • Genova, Italia, 16132
        • Ospedale Policlinico San Martino

Osallistumiskriteerit

Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.

Kelpoisuusvaatimukset

Opintokelpoiset iät

18 vuotta ja vanhemmat (Aikuinen, Vanhempi Aikuinen)

Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia

Ei

Sukupuolet, jotka voivat opiskella

Nainen

Kuvaus

Sisällyttämiskriteerit:

  • Kirjallinen tietoinen suostumus
  • Rintojen leesiot havaittu digitaalisella bilateraalisella mammografialla
  • Kelpo diagnostiseen biopsiaan (tru-cut tai VABB) normaalin kliinisen käytännön mukaisesti
  • Kyky ja tahto noudattaa protokollan vaatimuksia

Poissulkemiskriteerit:

  • Aiempi syöpähistoria, kaikentyyppinen
  • Kliininen tai radiologinen epäily edenneestä tai metastaattisesta syövästä seulonnan aikana
  • Tunnettu aktiivinen tai hoidettu autoimmuunisairaus tai ilmeinen krooninen tai kausiluonteinen ja aktiivinen allerginen sairaus
  • Suuri trauma tai leikkaushistoria 24 viikkoa ennen seulontaa
  • Aktiivinen tartuntatauti, joko krooninen tai akuutti, mutta esiintynyt seulontaa edeltäneiden 8 viikon aikana
  • Aiemmin tunnetut akuutit tai krooniset sydän-, munuais- tai maksasairaudet tai akuutit sydäntapahtumat

Opintosuunnitelma

Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.

Miten tutkimus on suunniteltu?

Suunnittelun yksityiskohdat

  • Ensisijainen käyttötarkoitus: Diagnostiikka
  • Jako: Ei satunnaistettu
  • Inventiomalli: Peräkkäinen tehtävä
  • Naamiointi: Ei mitään (avoin tarra)

Aseet ja interventiot

Osallistujaryhmä / Arm
Interventio / Hoito
Kokeellinen: Rintasyövän vaiheen T1 ryhmä

Naiset, joilla on radiologisesti tunnistettu leesiot, BIRADS-3/4/5, jotka ovat pienempiä kuin 2 cm radiologisen arvioinnin mukaan (eli radiologinen T1), otetaan mukaan ja kutsutaan luovuttamaan ääreisverinäytteitä ja virtsanäytteitä lähtötilanteessa. Radiologisia kuvia sekä demografisia ja anatomopatologisia tietoja kerätään.

Jos bioptisesti varmistetaan T1-rintasyöpä, potilaille suoritetaan toinen perifeerinen veren ja virtsan keräys primaarisen rintasyövän leikkauksen jälkeen.

perifeerisen veren ja virtsan näytteenotto
perifeerisen veren ja virtsan näytteenotto
Active Comparator: Hyvänlaatuisten rintavaurioiden ryhmä

Naiset, joilla on radiologisesti tunnistettu leesiot, BIRADS-3/4/5, jotka ovat pienempiä kuin 2 cm radiologisen arvioinnin mukaan (eli radiologinen T1), otetaan mukaan ja kutsutaan luovuttamaan ääreisverinäytteitä ja virtsanäytteitä lähtötilanteessa. Radiologisia kuvia sekä demografisia ja anatomopatologisia tietoja kerätään.

Jos bioptisesti varmistetaan hyvänlaatuinen vaurio, muita näytteitä ei kerätä.

perifeerisen veren ja virtsan näytteenotto

Mitä tutkimuksessa mitataan?

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Toimenpiteen kuvaus
Aikaikkuna
HDI-luokittajan kehittäminen, joka mahdollistaa rintasyövän varhaisen noninvasiivisen diagnoosin samalla tarkkuudella kuin rintabiopsia
Aikaikkuna: 5 vuotta
Horisontaalisen dataintegraation (HDI) luokittelijan tarkkuus luokiteltaessa oikein pT1-rintasyövät hyvänlaatuisista leesioista (eli ei-invasiivisesta rintaadenokarsinoomasta), joilla on samanlaisia ​​radiologisia piirteitä (eli leesion enimmäishalkaisija on pienempi tai yhtä suuri kuin 2 cm). HDI-luokitin määritellään vaihtelevana yhdistelmänä ominaisuuksia, jotka on saatu erilaisista radiomiikka-analyyseistä lähtötilanteen mammogrammeilla ja molekyylianalyyseillä perifeerisellä verellä (ctDNA-metylaatio cfMeDIPSeq:n avulla, proteiinit SomaScan® Somalogic -alustaa käyttäen, miRNA-sekvensointi eksosomeista) ja virtsa (ctfDNA-metylaatio ctfDNA-metylaatiolla qfDNA-menetelmällä) ) kerätty T0:ssa (perustaso, ennen diagnostista biopsiaa). Tätä tulosta verrataan diagnostisen biopsian tarkkuuteen samasta potilasryhmästä.
5 vuotta

Toissijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Toimenpiteen kuvaus
Aikaikkuna
HDI-luokituksen tarkkuus
Aikaikkuna: 5 vuotta
HDI-luokittajan tarkkuus isäntäkohtaisten muuttujien huomioimisen ja poistamisen jälkeen arvioimalla samoja muuttujia leikkauksen jälkeen.
5 vuotta
HDI-luokituksen analyyttinen ja kliininen validiteetti
Aikaikkuna: 5 vuotta
Korvaimen analyyttinen ja kliininen kelpoisuus, halvemmat menetelmät samojen HDI-luokittelijaan sisältyvien muuttujien mittaamiseksi (esim. metylaatiospesifiset PCR-määritykset, ELISA-testit valituille proteiineille, kvantitatiivinen reaaliaikainen PCR miRNA:ille).
5 vuotta

Yhteistyökumppanit ja tutkijat

Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.

Tutkijat

  • Päätutkija: Gabriele Zoppoli, MD, PhD, Ospedale Policlinico San Martino

Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä

Tutkimusta koskevien tietojen syöttämisestä vastaava henkilö toimittaa nämä julkaisut vapaaehtoisesti. Nämä voivat koskea mitä tahansa tutkimukseen liittyvää.

Opintojen ennätyspäivät

Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan ​​julkisella verkkosivustolla.

Opi tärkeimmät päivämäärät

Opiskelun aloitus (Todellinen)

Tiistai 19. tammikuuta 2021

Ensisijainen valmistuminen (Odotettu)

Perjantai 1. joulukuuta 2023

Opintojen valmistuminen (Odotettu)

Sunnuntai 1. joulukuuta 2024

Opintoihin ilmoittautumispäivät

Ensimmäinen lähetetty

Tiistai 23. helmikuuta 2021

Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit

Tiistai 2. maaliskuuta 2021

Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)

Torstai 4. maaliskuuta 2021

Tutkimustietojen päivitykset

Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)

Tiistai 1. marraskuuta 2022

Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit

Maanantai 31. lokakuuta 2022

Viimeksi vahvistettu

Lauantai 1. lokakuuta 2022

Lisää tietoa

Tähän tutkimukseen liittyvät termit

Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)

Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?

Ei

Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat

Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta

Ei

Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta

Ei

Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .

Kliiniset tutkimukset Rintasyöpä

3
Tilaa