Repositionnement informatique des médicaments pour tous les cas d'EBS
Réorientation des médicaments informatiques pour tous les cas d'épidermolyse bulleuse simple (EBS)
Aperçu de l'étude
Statut
Statut
Les conditions
Les conditions
Intervention / Traitement
Intervention / Traitement
Description détaillée
Type d'étude
Type d'étude
Inscription (Estimé)
Inscription
Contacts et emplacements
Coordonnées de l'étude
Coordonnées de l'étude
- Nom: Monica Martin
- Numéro de téléphone: 650-723-0636
- E-mail: momartin@stanford.edu
Lieux d'étude
-
-
California
-
Palo Alto, California, États-Unis, 94304
- Recrutement
- Pediatric Dermatology Clinic at Stanford Children's Hospital
-
Chercheur principal:
- Joyce M Teng, MD, PhD
-
Contact:
- Monica Martin
- Numéro de téléphone: 650-723-0636
- E-mail: PediatricDermStudy@stanford.edu
-
Contact:
- Elidia V Tafoya, MPH
- Numéro de téléphone: 650-724-1982
- E-mail: PediatricDermStudy@stanford.edu
-
Sous-enquêteur:
- Kavita Sarin, MD, PhD
-
-
Critères de participation
Critère d'éligibilité
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
- Sujets de tous âges
- Diagnostic de tous les sous-types de sujets EB
- Sujets sains, non EB
- Capacité à effectuer une visite d'étude pour prélever des échantillons de tissus et de sang
Critère d'exclusion:
- Grossesse, allaitement
- Antécédents de maladie du foie
- Maladie ou infection concomitante grave connue, qui pourrait potentiellement présenter un risque pour la sécurité et/ou empêcher le prélèvement de tissus chez les sujets
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Cohorte
- Perspectives temporelles: Éventuel
Nombre de groupes / cohortes
Cohortes et interventions
Groupe / CohorteGroupe / Cohorte |
Intervention / TraitementIntervention / Traitement |
|---|---|
|
Groupe expérimental
Des échantillons de sang et de tissus seront prélevés sur des sujets présentant un diagnostic d'EB.
Un échantillon de tissu sera prélevé sur une peau cloquée et non cloquée.
|
Sujets avec un diagnostic d'EB
|
|
Groupe de contrôle
Des échantillons de sang et de tissus seront prélevés sur des sujets sains sans EB.
Un échantillon de tissu sera prélevé sur une zone cutanée peu visible.
|
Sujets avec un diagnostic d'EB
|
Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
|---|---|---|
|
Caractériser les changements d'expression génique dans l'EB à l'aide du séquençage de l'ARN (ARN-seq) et du profilage informatique des cibles médicamenteuses potentielles
Délai: Grâce à la réalisation d'études en 1 an.
|
Utilisation d'algorithmes bioinformatiques pour identifier les changements dans l'expression des gènes et examen de plus de 2000 médicaments approuvés par la FDA sur la base de la modulation prédite des changements d'expression des gènes à l'aide d'un système d'algorithme évolutif informatique.
|
Grâce à la réalisation d'études en 1 an.
|
Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Parrainer
Les enquêteurs
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Joyce M Teng, MD, PhD, Stanford University
Publications et liens utiles
Publications générales
- McLaren PJ, Mayne M, Rosser S, Moffatt T, Becker KG, Plummer FA, Fowke KR. Antigen-specific gene expression profiles of peripheral blood mononuclear cells do not reflect those of T-lymphocyte subsets. Clin Diagn Lab Immunol. 2004 Sep;11(5):977-82. doi: 10.1128/CDLI.11.5.977-982.2004.
- Sleasman JW, Leon BH, Aleixo LF, Rojas M, Goodenow MM. Immunomagnetic selection of purified monocyte and lymphocyte populations from peripheral blood mononuclear cells following cryopreservation. Clin Diagn Lab Immunol. 1997 Nov;4(6):653-8. doi: 10.1128/cdli.4.6.653-658.1997.
- Bray NL, Pimentel H, Melsted P, Pachter L. Near-optimal probabilistic RNA-seq quantification. Nat Biotechnol. 2016 May;34(5):525-7. doi: 10.1038/nbt.3519. Epub 2016 Apr 4. Erratum In: Nat Biotechnol. 2016 Aug 9;34(8):888.
- Robinson MD, McCarthy DJ, Smyth GK. edgeR: a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data. Bioinformatics. 2010 Jan 1;26(1):139-40. doi: 10.1093/bioinformatics/btp616. Epub 2009 Nov 11.
- Law V, Knox C, Djoumbou Y, Jewison T, Guo AC, Liu Y, Maciejewski A, Arndt D, Wilson M, Neveu V, Tang A, Gabriel G, Ly C, Adamjee S, Dame ZT, Han B, Zhou Y, Wishart DS. DrugBank 4.0: shedding new light on drug metabolism. Nucleic Acids Res. 2014 Jan;42(Database issue):D1091-7. doi: 10.1093/nar/gkt1068. Epub 2013 Nov 6.
- Sugaya N, Kanai S, Furuya T. Dr. PIAS 2.0: an update of a database of predicted druggable protein-protein interactions. Database (Oxford). 2012 Oct 10;2012:bas034. doi: 10.1093/database/bas034. Print 2012.
- Subramanian A, Kuehn H, Gould J, Tamayo P, Mesirov JP. GSEA-P: a desktop application for Gene Set Enrichment Analysis. Bioinformatics. 2007 Dec 1;23(23):3251-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btm369. Epub 2007 Jul 20.
- Cohn HI, Teng JM. Advancement in management of epidermolysis bullosa. Curr Opin Pediatr. 2016 Aug;28(4):507-16. doi: 10.1097/MOP.0000000000000380.
- Uitto J, Bruckner-Tuderman L, Christiano AM, McGrath JA, Has C, South AP, Kopelan B, Robinson EC. Progress toward Treatment and Cure of Epidermolysis Bullosa: Summary of the DEBRA International Research Symposium EB2015. J Invest Dermatol. 2016 Feb;136(2):352-358. doi: 10.1016/j.jid.2015.10.050.
- Nystrom A, Thriene K, Mittapalli V, Kern JS, Kiritsi D, Dengjel J, Bruckner-Tuderman L. Losartan ameliorates dystrophic epidermolysis bullosa and uncovers new disease mechanisms. EMBO Mol Med. 2015 Sep;7(9):1211-28. doi: 10.15252/emmm.201505061.
- Wally V, Kitzmueller S, Lagler F, Moder A, Hitzl W, Wolkersdorfer M, Hofbauer P, Felder TK, Dornauer M, Diem A, Eiler N, Bauer JW. Topical diacerein for epidermolysis bullosa: a randomized controlled pilot study. Orphanet J Rare Dis. 2013 May 7;8:69. doi: 10.1186/1750-1172-8-69.
- Li J, Zheng S, Chen B, Butte AJ, Swamidass SJ, Lu Z. A survey of current trends in computational drug repositioning. Brief Bioinform. 2016 Jan;17(1):2-12. doi: 10.1093/bib/bbv020. Epub 2015 Mar 31.
- Low YS, Daugherty AC, Schroeder EA, Chen W, Seto T, Weber S, Lim M, Hastie T, Mathur M, Desai M, Farrington C, Radin AA, Sirota M, Kenkare P, Thompson CA, Yu PP, Gomez SL, Sledge GW Jr, Kurian AW, Shah NH. Synergistic drug combinations from electronic health records and gene expression. J Am Med Inform Assoc. 2017 May 1;24(3):565-576. doi: 10.1093/jamia/ocw161.
- Bchetnia M, Tremblay ML, Leclerc G, Duperee A, Powell J, McCuaig C, Morin C, Legendre-Guillemin V, Laprise C. Expression signature of epidermolysis bullosa simplex. Hum Genet. 2012 Mar;131(3):393-406. doi: 10.1007/s00439-011-1077-7. Epub 2011 Aug 30.
- Roth W, Reuter U, Wohlenberg C, Bruckner-Tuderman L, Magin TM. Cytokines as genetic modifiers in K5-/- mice and in human epidermolysis bullosa simplex. Hum Mutat. 2009 May;30(5):832-41. doi: 10.1002/humu.20981.
- Lee B, Geyfman M, Andersen B, Dai X. Analysis of gene expression in skin using laser capture microdissection. Methods Mol Biol. 2013;989:109-17. doi: 10.1007/978-1-62703-330-5_10.
- Lovendorf MB, Mitsui H, Zibert JR, Ropke MA, Hafner M, Dyring-Andersen B, Bonefeld CM, Krueger JG, Skov L. Laser capture microdissection followed by next-generation sequencing identifies disease-related microRNAs in psoriatic skin that reflect systemic microRNA changes in psoriasis. Exp Dermatol. 2015 Mar;24(3):187-93. doi: 10.1111/exd.12604.
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Début de l'étude
Achèvement primaire (Estimé)
Achèvement primaire
Achèvement de l'étude (Estimé)
Achèvement de l'étude
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Première publication
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Estimé)
Dernière mise à jour publiée
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
- Anomalies congénitales
- Maladies génétiques, innées
- Maladies du tissu conjonctif
- Maladies de la peau, vésiculobulleuses
- Anomalies cutanées
- Maladies du collagène
- Maladies de la peau
- Maladies de la peau, Génétique
- Épidermolyse bulleuse
- Épidermolyse bulleuse dystrophique
- Épidermolyse Bulleuse Simplex
- Épidermolyse bulleuse jonctionnelle
Autres numéros d'identification d'étude
Autres numéros d'identification d'étude
- 41142
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?
Description du régime IPD
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .
Essais cliniques sur En bonne santé
-
NCT04478513Complété
Essais cliniques sur Groupe expérimental
-
NCT02691806Inconnue
-
NCT05311826ComplétéExercer | Gestion de la douleur | Scoliose idiopathique de l'adolescent | Fusion vertébrale
-
NCT07614555RecrutementVentilation mécanique | Lumbar Disc Herniation Surgery
-
NCT04137575ComplétéCancer du sein féminin | Peur de la récidive du cancer
-
NCT04852094Pas encore de recrutement
-
NCT05252299ComplétéFormation sur la sécurité des sièges d'auto pour enfants
-
NCT00651417InconnueCancer du sein localisé | Cancer localisé de la prostate | Patients recevant une radiothérapie externe
-
NCT07057115Recrutement