Computational Drug Repurposing pro všechny případy EBS
Computational Drug Repurposing pro všechny případy Epidermolysis Bullosa Simplex (EBS).
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Intervence / Léčba
Intervence / Léčba
Detailní popis
Typ studie
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Zápis
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
Studijní kontakt
- Jméno: Monica Martin
- Telefonní číslo: 650-723-0636
- E-mail: momartin@stanford.edu
Studijní místa
-
-
California
-
Palo Alto, California, Spojené státy, 94304
- Nábor
- Pediatric Dermatology Clinic at Stanford Children's Hospital
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Joyce M Teng, MD, PhD
-
Kontakt:
- Monica Martin
- Telefonní číslo: 650-723-0636
- E-mail: PediatricDermStudy@stanford.edu
-
Kontakt:
- Elidia V Tafoya, MPH
- Telefonní číslo: 650-724-1982
- E-mail: PediatricDermStudy@stanford.edu
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Kavita Sarin, MD, PhD
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Předměty všech věkových kategorií
- Diagnostika všech podtypů subjektů s EB
- Zdravé, non-EB subjekty
- Schopnost dokončit studijní návštěvu k odběru vzorků tkáně a krve
Kritéria vyloučení:
- Těhotenství, kojení
- Předchozí onemocnění jater v anamnéze
- Závažné známé souběžné lékařské onemocnění nebo infekce, které by mohly potenciálně představovat bezpečnostní riziko a/nebo bránit odběru tkáně od subjektů
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Kohorta
- Časové perspektivy: Budoucí
Počet skupin / kohort
Kohorty a intervence
Skupina / kohortaSkupina / kohorta |
Intervence / LéčbaIntervence / Léčba |
|---|---|
|
Experimentální skupina
Vzorky krve a tkáně budou odebrány subjektům s diagnózou EB.
Vzorek tkáně bude odebrán z kůže s puchýři a bez puchýřů.
|
Subjekty s diagnózou EB
|
|
Kontrolní skupina
Vzorky krve a tkáně budou odebrány od zdravých subjektů s non-EB.
Vzorek tkáně bude odebrán z nenápadné oblasti kůže.
|
Subjekty s diagnózou EB
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Charakterizujte změny genové exprese v EB pomocí sekvenování RNA (RNA-seq) a výpočetního profilování potenciálních cílů léků
Časové okno: Prostřednictvím ukončení studia za 1 rok.
|
Použití bioinformatických algoritmů k identifikaci změn v genové expresi a přezkoumání více než 2000 léků schválených FDA na základě předpokládané modulace změn genové exprese pomocí systému výpočetních evolučních algoritmů.
|
Prostřednictvím ukončení studia za 1 rok.
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Vyšetřovatelé
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Joyce M Teng, MD, PhD, Stanford University
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- McLaren PJ, Mayne M, Rosser S, Moffatt T, Becker KG, Plummer FA, Fowke KR. Antigen-specific gene expression profiles of peripheral blood mononuclear cells do not reflect those of T-lymphocyte subsets. Clin Diagn Lab Immunol. 2004 Sep;11(5):977-82. doi: 10.1128/CDLI.11.5.977-982.2004.
- Sleasman JW, Leon BH, Aleixo LF, Rojas M, Goodenow MM. Immunomagnetic selection of purified monocyte and lymphocyte populations from peripheral blood mononuclear cells following cryopreservation. Clin Diagn Lab Immunol. 1997 Nov;4(6):653-8. doi: 10.1128/cdli.4.6.653-658.1997.
- Bray NL, Pimentel H, Melsted P, Pachter L. Near-optimal probabilistic RNA-seq quantification. Nat Biotechnol. 2016 May;34(5):525-7. doi: 10.1038/nbt.3519. Epub 2016 Apr 4. Erratum In: Nat Biotechnol. 2016 Aug 9;34(8):888.
- Robinson MD, McCarthy DJ, Smyth GK. edgeR: a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data. Bioinformatics. 2010 Jan 1;26(1):139-40. doi: 10.1093/bioinformatics/btp616. Epub 2009 Nov 11.
- Law V, Knox C, Djoumbou Y, Jewison T, Guo AC, Liu Y, Maciejewski A, Arndt D, Wilson M, Neveu V, Tang A, Gabriel G, Ly C, Adamjee S, Dame ZT, Han B, Zhou Y, Wishart DS. DrugBank 4.0: shedding new light on drug metabolism. Nucleic Acids Res. 2014 Jan;42(Database issue):D1091-7. doi: 10.1093/nar/gkt1068. Epub 2013 Nov 6.
- Sugaya N, Kanai S, Furuya T. Dr. PIAS 2.0: an update of a database of predicted druggable protein-protein interactions. Database (Oxford). 2012 Oct 10;2012:bas034. doi: 10.1093/database/bas034. Print 2012.
- Subramanian A, Kuehn H, Gould J, Tamayo P, Mesirov JP. GSEA-P: a desktop application for Gene Set Enrichment Analysis. Bioinformatics. 2007 Dec 1;23(23):3251-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btm369. Epub 2007 Jul 20.
- Cohn HI, Teng JM. Advancement in management of epidermolysis bullosa. Curr Opin Pediatr. 2016 Aug;28(4):507-16. doi: 10.1097/MOP.0000000000000380.
- Uitto J, Bruckner-Tuderman L, Christiano AM, McGrath JA, Has C, South AP, Kopelan B, Robinson EC. Progress toward Treatment and Cure of Epidermolysis Bullosa: Summary of the DEBRA International Research Symposium EB2015. J Invest Dermatol. 2016 Feb;136(2):352-358. doi: 10.1016/j.jid.2015.10.050.
- Nystrom A, Thriene K, Mittapalli V, Kern JS, Kiritsi D, Dengjel J, Bruckner-Tuderman L. Losartan ameliorates dystrophic epidermolysis bullosa and uncovers new disease mechanisms. EMBO Mol Med. 2015 Sep;7(9):1211-28. doi: 10.15252/emmm.201505061.
- Wally V, Kitzmueller S, Lagler F, Moder A, Hitzl W, Wolkersdorfer M, Hofbauer P, Felder TK, Dornauer M, Diem A, Eiler N, Bauer JW. Topical diacerein for epidermolysis bullosa: a randomized controlled pilot study. Orphanet J Rare Dis. 2013 May 7;8:69. doi: 10.1186/1750-1172-8-69.
- Li J, Zheng S, Chen B, Butte AJ, Swamidass SJ, Lu Z. A survey of current trends in computational drug repositioning. Brief Bioinform. 2016 Jan;17(1):2-12. doi: 10.1093/bib/bbv020. Epub 2015 Mar 31.
- Low YS, Daugherty AC, Schroeder EA, Chen W, Seto T, Weber S, Lim M, Hastie T, Mathur M, Desai M, Farrington C, Radin AA, Sirota M, Kenkare P, Thompson CA, Yu PP, Gomez SL, Sledge GW Jr, Kurian AW, Shah NH. Synergistic drug combinations from electronic health records and gene expression. J Am Med Inform Assoc. 2017 May 1;24(3):565-576. doi: 10.1093/jamia/ocw161.
- Bchetnia M, Tremblay ML, Leclerc G, Duperee A, Powell J, McCuaig C, Morin C, Legendre-Guillemin V, Laprise C. Expression signature of epidermolysis bullosa simplex. Hum Genet. 2012 Mar;131(3):393-406. doi: 10.1007/s00439-011-1077-7. Epub 2011 Aug 30.
- Roth W, Reuter U, Wohlenberg C, Bruckner-Tuderman L, Magin TM. Cytokines as genetic modifiers in K5-/- mice and in human epidermolysis bullosa simplex. Hum Mutat. 2009 May;30(5):832-41. doi: 10.1002/humu.20981.
- Lee B, Geyfman M, Andersen B, Dai X. Analysis of gene expression in skin using laser capture microdissection. Methods Mol Biol. 2013;989:109-17. doi: 10.1007/978-1-62703-330-5_10.
- Lovendorf MB, Mitsui H, Zibert JR, Ropke MA, Hafner M, Dyring-Andersen B, Bonefeld CM, Krueger JG, Skov L. Laser capture microdissection followed by next-generation sequencing identifies disease-related microRNAs in psoriatic skin that reflect systemic microRNA changes in psoriasis. Exp Dermatol. 2015 Mar;24(3):187-93. doi: 10.1111/exd.12604.
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Začátek studia
Primární dokončení (Odhadovaný)
Primární dokončení
Dokončení studie (Odhadovaný)
Dokončení studie
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Odhadovaný)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- 41142
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Popis plánu IPD
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Zdravý
-
NCT04261231Dokončeno
-
NCT02792140DokončenoNeuroscience of Dreaming, Health
-
NCT03885232DokončenoPreventivní zdravotní služby (PREV HEALTH SERV)
-
NCT06067633NáborZveřejnění článků předložených American Journal of Public Health
-
NCT07552857Zatím nenabírámePreventivní zdravotní služby (PREV HEALTH SERV)
-
NCT06971978Aktivní, ne náborTeplo | Havarijní připravenost | Extrémní teplo | Health Health | Extrémní tepelné vlny | Řízení katastrof | Plánování katastrof | Katastrofy
-
NCT03961152DokončenoBolest | Užívání opioidů | Totální náhrada kolena | Aplikace E-health
-
NCT07173283NáborProfesionální integrace nově odstupňovaných pracovních terapeutů | Peer Mentorship in Health Professions | Přechod včasného kariéry a profesní identita
-
NCT07053553DokončenoRegistrováno u Kelkit District State Hospital Home Health Unit | Být pacientem domácí péče
-
NCT04814576DokončenoPorucha duševního zdraví | Duševní zdraví wellness 1 | Role sestry | Care Acceptor, Health | Vztah, sestra pacienta
Klinické studie na Experimentální skupina
-
NCT04739033Dokončeno
-
NCT06889077Zápis na pozvánkuVzdělávání ošetřovatelství | Studenti ošetřovatelství | Klinická praxe | Ošetřovatelství založené na důkazech
-
NCT07192549Zatím nenabírámePooperační delirium | Pooperační kognitivní dysfunkce
-
NCT06129929DokončenoVzdělávací problémy | Ošetřovatelství | Násilí na pracovišti
-
NCT02871414Dokončeno
-
NCT06975098Dokončeno