Étiologie de la méningite et de la méningo-encéphalite orphelines communautaires. (MENINGITE)

Les méningites et méningo-encéphalites communautaires sont définies par la présence de plus de 10 leucocytes par ml de liquide céphalo-rachidien (LCR), rapportée éventuellement au nombre de globules rouges. Elles peuvent être associées à une encéphalite, définie par un dysfonctionnement cérébral ou cérébelleux en cas de transmission. L'évolution inclut le décès, ce qui fait la gravité de cette situation clinique. Cependant la performance diagnostique des méningites et méningo-encéphalites chez un patient sans contact avec une structure de soins est inférieure à 25% entraînant un soutien empirique chez la moitié des patients. En effet, le diagnostic microbiologique de la méningite et de la transmission ne cible actuellement que cinq agents pathogènes dont le VIH positif a entraîné une évolution importante pour accompagner le patient dans trois domaines, décision d'hospitalisation, décision d'isolement et décision de traitement antibiotique ou antiviral. Un suivi épidémiologique hebdomadaire du diagnostic microbiologique des méningites et méningo-encéphalites a permis de constater un décalage entre une courbe de demandes d'analyses et une courbe plate des diagnostics produits. Cet écart est interprété comme indiquant une épidémie communautaire de méningite ou de méningo-encéphalite non diagnostiquée par les méthodes de routine, appelée méningite orpheline ou méningo-encéphalite orpheline. Partant de ce constat, notre projet de recherche vise à améliorer les performances du diagnostic étiologique des méningites ou méningo-encéphalites communautaires. Pour ce faire, nous évaluerons les performances diagnostiques d'une technique de pointe, utilisant un prélèvement non invasif, l'écouvillonnage pharyngé du patient, pour rechercher des micro-organismes qui ne font pas partie de la flore commensale du pharynx et qui sont responsables de non détecté dans la méningite de routine. En effet les principaux agents pathogènes et de transmission des méningites (entérovirus, pneumocoque, méningocoque) donnent un portage pharyngé avant d'être responsables de méningite ou de méningo-encéphalite. Ces bactéries sont Coxiella burnetii, Bartonella spp., Tropheryma whipplei, Leptospira spp. et Borrelia spp.