Kimlinjeendringer av svulstfølsomhetsgener hos kreftpasienter i New York

For å etablere signifikante korrelasjoner mellom genetiske polymorfismer og kreft, foreslås en storskala, systematisk sammenligning av genetiske endringer ved bruk av en case-control metodikk. Til dags dato har slike studier vært begrenset på grunn av det store antallet prøver som er nødvendig for å oppnå statistisk signifikans, og mangelen på raske og nøyaktige metoder for å screene for genetiske polymorfismer. Vi foreslår å bruke et anonymisert design for å få DNA fra gjenværende materiale fra rutinemessige diagnostiske blodprøver, for å koble disse prøvene til et begrenset sett med kliniske variabler, og for å teste for frekvensen av kandidatalleler for kreftmottakelighet med lav penetrans. Disse dataene vil bli kombinert med lignende data fra en kontrollgruppe av alders- og etnisk matchende frivillige for en relatert kohortstudie som skal utføres separat. Polymorfismer som skal screenes for inkluderer de som involverer genene PTEN, APC, TGF βR-I, BLM, CHK2, et p85 fosfoprotein, ATM, ER, PR, MCP-1, MPIF, CCR2/5, CCR3 og SULT1A1. Kreft som skal inkluderes er bryst-, blære-, nyre-, tykktarms-, testikkel-, lunge-, prostata-, ovarie-, lymfoide neoplasmer og hode- og nakkekarsinomer. Gener med SNP som er kjent for å være relevante for enten utvikling eller behandling av lymfoide maligniteter vil også bli målrettet. Spesifikt vil kandidatgener bli valgt fra 1) cytokinsignalering, 2) DNA-reparasjon og 3) apoptose regulatoriske veier.