Biomarkery podłużne z wybranymi miarami wyników w CMT (CMT-BIO-Extend)

Do tej pory zastosowano tylko badania fizyczne i elektrofizjologiczne do określenia nasilenia choroby u pacjentów z CMT. Wynik neuropatii CMT (CMTN) jest ważną i niezawodną dziewięciopunktową skalą kompozytową, która rozważa objawy czuciowe i motoryczne (Shy i in. 2005). Jednak jego funkcja jako marker nasilenia lub progresji jest kontrowersyjny ze względu na powolne pogorszenie przez lata (Wang i in. 2017). Biomarkery zastępcze dotkliwości i progresji choroby służyłyby jako potężne narzędzia do monitorowania efektów terapeutycznych w badaniach klinicznych. Obecnie nie są dostępne praktyczne biomarkery dla CMT1a. Nieinwazyjne badanie MRI wykazało zmiany w akumulacji mięśni i tłuszczów domięśniowych w kończynach dolnych, które korelowały z zaburzeniami klinicznymi (Gaeta i in. 2012). Ta metoda pokazuje obiecujące wyniki jako zastępczy miarę wyniku dla badań klinicznych, ale jest technicznie wymagająca i jak dotąd była testowana tylko u niewielkiej grupy pacjentów z CMT i osób z różnymi innymi zaburzeniami nerwowo -mięśniowymi.

Analiza molekularna płynów ustrojowych lub próbek tkanek jest obiecującą strategią opracowywania klinicznie praktycznych biomarkerów zastępczych dotkliwości choroby w CMT1A. We wstępnej pracy naszej grupy badawczej analizy ekspresji genów szczurów CMT były skorelowane z biopsjami skóry u pacjentów z CMT1A. Ta analiza zidentyfikowała kilka poszczególnych genów (STT2, CTSA, PPARG, CDA, ENPP1 i NRG1), które korelowały z ciężkością choroby (Fledrich i in. 2017). Dodatkowe eksperymenty z wykorzystaniem analiz ekspresji genów skóry i nerwu kulszowego (N. Ischiadicus) umożliwił rozróżnienie między szczurami CMT niewielki i poważnie dotkniętych (Fledrich i in. 2012).

Ze względu na wysoką zmienność ekspresji choroby postulowaliśmy, że duża część manifestacji choroby występuje na poziomie epigenetycznym. Opierając się na tym, nasze początkowe podejście ujawniło znaczące nakładanie się różnie metylowanych regionów DNA i zmian transkrypcyjnych u szczurów CMT. To odkrycie sugeruje, że zmiany metylacji DNA mogą przyczynić się do zmienionej ekspresji genów, a tym samym do patogenezy CMT1a. W szczególności dwa klastry zawierały wysoce regulowane transkrypty wzbogacone genami związanymi z regulacją cyklu komórkowego. Regulacja cyklu komórkowego jest powiązana z PMP22/GAS315, genem powodującym CMT1a. Analiza czynników transkrypcyjnych wykazała znaczne zaangażowanie ważnego regulatora cyklu komórkowego z rodziny E2F, wraz z jego znanym efektorowym EZH2, metylazą niezbędną do represji transkrypcyjnej w komórkach Schwanna poprzez metylację histonu H3.

Na tej podstawie odbyła się rekrutacja 150 pacjentów w latach 2016–2019, którzy oceniono na trzech wizytach pod kątem zmienności fenotypowej, nasilenia choroby i wyników klinicznych (NCT03386266). W tym badaniu translacyjnym zastosowano szczury nadeksprymujące gen PMP22 i materiał pacjenta. Od 150 zwierząt, 4 lub 5 z odpowiednio łagodnymi i ciężkimi ekspresją choroby. Pacjenci rekrutowano za pośrednictwem sieci CMT-NET, w której CMTNSV2 zastosowano jako wynik choroby. Analizy RNASEQ zidentyfikowały kilka genów kandydujących, które nakładały się zarówno u pacjentów z CMT1A, jak i modeli szczurów, wskazując potencjalne markery ciężkości choroby.

Te wstępne dane dostarczają dowodów na to, że dane epigenetyczne i inne OMIC zarówno z modeli zwierzęcych CMT1A, jak i ludzkich pacjentów mogą być wykorzystywane do dwukierunkowego, pouczającego translacji w kierunku do przodu, jak i do tyłu. Na podstawie tych dwukierunkowych danych sekwencjonowanie RNA przeprowadzono z krwi pacjentów w CMT-NET, gdzie zidentyfikowano początkowe potencjalne biomarkery, modyfikatory choroby i markery zastępcze (Linhoff i in., Publikacja w przygotowaniu). Dane RT-PCR zapewniają wgląd w predykcyjne stwierdzenia na temat rozwoju klinicznego pacjentów w czasie.

Na podstawie tych ustaleń planujemy dalej zbadać zidentyfikowane biomarkery podczas czwartej wizyty, zgodnie z naszym najnowszym zastosowaniem etyki do CMT-NET, i potwierdzić ich obecność w biopsjach skóry. Koncentruje się szczególnie na markerach związanych z nowo zaobserwowanymi objawami, takimi jak zaburzenia autonomiczne i drżenie. To rozszerzone podejście ma na celu poprawę diagnozy i monitorowania choroby, umożliwiając bardziej precyzyjne i zindywidualizowane podejścia terapeutyczne.

Celem tego projektu jest lepsze zrozumienie naturalnego postępu choroby CMT1A i zidentyfikowanie potencjalnych czynników ryzyka, które mogą wpływać na przebieg choroby. CMT1A, podtyp CMT, jest najczęstszą dziedziczną neuropatią obwodową. Jego powolny, postępujący przebieg choroby wykazuje dużą zmienność poszczególnych fenotypów pomimo jednorodności genetycznej. Głównym celem projektu jest analiza potencjalnych determinantów ekspresji fenotypowej, w tym poziomów nasilenia, oraz udokumentowanie zmienności objawów przez całkowity okres pięciu lat jako wskaźnik dynamiki choroby.

CMT jest rzadką, nieuleczalną chorobą, chociaż obecnie rozwija się nowe farmakoterapie. Wykazanie skuteczności w badaniach klinicznych stanowi wyzwanie ze względu na powolny postęp i brak wrażliwych miar wyników. Głównym celem tego podprojektowania jest potwierdzenie zidentyfikowanych biomarkerów (DNA/Epigenetyka i RNA/RT-PCR) oraz wybrane wrażliwe pomiary wyników we krwi i skórze pacjentów z CMT w okresie obserwacji co najmniej 5 lat w celu poprawy oceny skuteczności W przyszłych badaniach terapii klinicznej, w tym diagnostyczne monitorowanie postępu choroby u pacjentów z CMT. Około 25 zdrowych wolontariuszy zostanie również włączonych jako kontrole. W przypadku wolontariuszy zostaną rejestrowane krótką historię medyczną, a pobrane zostaną próbki krwi i skóry w celu potwierdzenia biomarkerów.

Celem tego podprojektowania jest zebranie próbek tkanek (skóra, krew i hodowane fibroblasty) od pacjentów z CMT z różnymi podtypami do nieograniczonych celów badań naukowych i medycznych, na przykład do projektów badawczych w niemieckiej sieci CMT-NET. Partnerzy naukowe otrzymają bezpłatny dostęp do próbek i danych. Wykorzystanie komercyjne poza celami badawczymi nie jest przeznaczone. Za pomocą zbierania tkanki CMT partnerzy CMT-NET mogą przeprowadzać morfologiczne i molekularne analizy biologiczne materiału pacjenta, a także wykorzystywać kultury fibroblastów. Można również przeprowadzić badania genotyp-fenotyp. Do tej pory istnieje zbiór ponad 100 znormalizowanych biopsji skóry od klinicznie dobrze scharakteryzowanych pacjentów z CMT1A. Ta kolekcja jest jedynym repozytorium tkanek próbek tkanek od pacjentów z dziedzicznymi neuropatią w Niemczech.

Celem tego projektu jest lepsze zrozumienie naturalnego postępu choroby CMT1A i zidentyfikowanie potencjalnych czynników ryzyka, które mogą wpływać na przebieg choroby. CMT1A, podtyp CMT, jest najczęstszą dziedziczną neuropatią obwodową. Jego powolny, postępujący przebieg choroby wykazuje dużą zmienność poszczególnych fenotypów pomimo jednorodności genetycznej. Głównym celem projektu jest analiza potencjalnych determinantów ekspresji fenotypowej, w tym poziomów nasilenia, oraz udokumentowanie zmienności objawów przez całkowity okres pięciu lat jako wskaźnik dynamiki choroby.

CMT jest rzadką, nieuleczalną chorobą, chociaż obecnie rozwija się nowe farmakoterapie. Wykazanie skuteczności w badaniach klinicznych stanowi wyzwanie ze względu na powolny postęp i brak wrażliwych miar wyników. Głównym celem tego podprojektowania jest potwierdzenie zidentyfikowanych biomarkerów (DNA/Epigenetyka i RNA/RT-PCR) oraz wybrane wrażliwe pomiary wyników we krwi i skórze pacjentów z CMT w okresie obserwacji co najmniej 5 lat w celu poprawy oceny skuteczności W przyszłych badaniach terapii klinicznej, w tym diagnostyczne monitorowanie postępu choroby u pacjentów z CMT. Około 25 zdrowych wolontariuszy zostanie również włączonych jako kontrole. W przypadku wolontariuszy zostaną rejestrowane krótką historię medyczną, a pobrane zostaną próbki krwi i skóry w celu potwierdzenia biomarkerów.

Celem tego podprojektowania jest zebranie próbek tkanek (skóra, krew i hodowane fibroblasty) od pacjentów z CMT z różnymi podtypami do nieograniczonych celów badań naukowych i medycznych, na przykład do projektów badawczych w niemieckiej sieci CMT-NET. Partnerzy naukowe otrzymają bezpłatny dostęp do próbek i danych. Wykorzystanie komercyjne poza celami badawczymi nie jest przeznaczone. Za pomocą zbierania tkanki CMT partnerzy CMT-NET mogą przeprowadzać morfologiczne i molekularne analizy biologiczne materiału pacjenta, a także wykorzystywać kultury fibroblastów. Można również przeprowadzić badania genotyp-fenotyp. Do tej pory istnieje zbiór ponad 100 znormalizowanych biopsji skóry od klinicznie dobrze scharakteryzowanych pacjentów z CMT1A. Ta kolekcja jest jedynym repozytorium tkanek próbek tkanek od pacjentów z dziedzicznymi neuropatią w Niemczech.

Celem tego projektu jest lepsze zrozumienie naturalnego postępu choroby CMT1A i zidentyfikowanie potencjalnych czynników ryzyka, które mogą wpływać na przebieg choroby. CMT1A, podtyp CMT, jest najczęstszą dziedziczną neuropatią obwodową. Jego powolny, postępujący przebieg choroby wykazuje dużą zmienność poszczególnych fenotypów pomimo jednorodności genetycznej. Głównym celem projektu jest analiza potencjalnych determinantów ekspresji fenotypowej, w tym poziomów nasilenia, oraz udokumentowanie zmienności objawów przez całkowity okres pięciu lat jako wskaźnik dynamiki choroby.

CMT jest rzadką, nieuleczalną chorobą, chociaż obecnie rozwija się nowe farmakoterapie. Wykazanie skuteczności w badaniach klinicznych stanowi wyzwanie ze względu na powolny postęp i brak wrażliwych miar wyników. Głównym celem tego podprojektowania jest potwierdzenie zidentyfikowanych biomarkerów (DNA/Epigenetyka i RNA/RT-PCR) oraz wybrane wrażliwe pomiary wyników we krwi i skórze pacjentów z CMT w okresie obserwacji co najmniej 5 lat w celu poprawy oceny skuteczności W przyszłych badaniach terapii klinicznej, w tym diagnostyczne monitorowanie postępu choroby u pacjentów z CMT. Około 25 zdrowych wolontariuszy zostanie również włączonych jako kontrole. W przypadku wolontariuszy zostaną rejestrowane krótką historię medyczną, a pobrane zostaną próbki krwi i skóry w celu potwierdzenia biomarkerów.