Genômica e metagenômica da gravidade da asma (GEMAS)

A asma é uma doença inflamatória crônica das vias aéreas caracterizada por obstrução reversível do fluxo aéreo e hiper-reatividade brônquica em resposta a uma variedade de estímulos. Na maioria dos pacientes, o início dos sintomas da asma pode ser controlado. No entanto, muitos deles podem manifestar ataques de asma ou crises respiratórias denominadas exacerbações, que ocorrem com problemas respiratórios, chiado, tosse ou aperto no peito, podendo ameaçar sua vida. Tais exacerbações são causadas por uma combinação de fatores ambientais e genéticos. No entanto, como os estudos até agora foram limitados, foi identificado um número reduzido de genes associados à predisposição a essas complicações. Além disso, alguns estudos usaram técnicas de sequenciamento de DNA de última geração para caracterizar o microbioma (ou seja, comunidade microbiana) das vias aéreas, encontrando alterações relacionadas à asma. A principal hipótese do estudo Genomics and Metagenomics of Asthma Severity (GEMAS) é que as exacerbações da asma são causadas por uma combinação de fatores genéticos intrínsecos do indivíduo, alterações no microbioma respiratório e a interação entre ambos os fatores. Os objetivos deste projeto são: 1) identificar variantes genéticas associadas às exacerbações da asma; 2) examinar as alterações que ocorrem nas comunidades microbianas da cavidade oral e do trato respiratório em indivíduos com exacerbações; 3) analisar a associação das variantes genéticas do hospedeiro e as alterações do microbioma relacionadas às exacerbações.

Um total de 300 indivíduos espanhóis com asma com e sem história de exacerbações de asma nos últimos 12 meses serão recrutados. Amostras de saliva, nasais e faríngeas serão coletadas para estudar a cavidade oral e o microbioma do trato respiratório superior por meio de tecnologias de sequenciamento de última geração. A sequenciação do gene 16S ribossomal RNA (16S rRNA) permitirá caracterizar a diversidade e abundância bacteriana, bem como inferir a funcionalidade do microbioma em cada amostra. Esses parâmetros serão usados ​​para estabelecer correlações entre o microbioma e a presença de exacerbações de asma. Finalmente, a associação entre a variação genética associada às exacerbações em estudos genômicos e as medidas de abundância, diversidade e funções relacionadas às exacerbações serão examinadas em conjunto.