Комбинация биомаркеров поверхности клеток лейкоцитов, измеренных цитометрией, для дифференциации бактериальных и вирусных инфекций в отделениях неотложной помощи: многоцентровая когорта для проверки диагностических показателей (CYTOBACT)

Пациенты, поступающие в отделение неотложной помощи одного из участвующих центров по подозрению на инфекцию, будут проинформированы и приглашены к участию. После получения согласия на участие во время планового забора крови, проводимого в отделении неотложной помощи, будет собран дополнительный объем цельной крови в 30 мл, аликвотирован и сохранен при -80°C, включая, в частности, 12 мл цельной крови, к которой Добавляют 1 мл стабилизатора Cytodelics® и инкубируют при комнатной температуре в течение 10 минут, а затем разделяют на аликвоты и хранят при -80°C. Оставшуюся цельную кровь собирают в пробирки с ЭДТА и Paxgen, центрифугируют, отбирают аликвоты и хранят при -80°C для взятия крови.

Клинические данные при поступлении (история болезни, жизненно важные параметры, источник инфекции (если таковой имеется), лечение, проведенное в отделении неотложной помощи) будут записаны в электронную ИРК. За участниками будут наблюдать до выписки из больницы и не дольше 28-го дня. Все микробиологические тесты, проведенные во время пребывания в больнице, также будут записаны в электронную ИРК. Диагностическая эффективность комбинаций маркеров клеточной поверхности будет оцениваться по диагностическому эталону бактериальной или вирусной квалификации каждого инфекционного события. Эта диагностическая ссылка будет установлена ​​независимой экспертной комиссией после анализа всех зарегистрированных клинических и биологических данных (за исключением результатов проточной цитометрии) для определения бактериальной, вирусной инфекции или отсутствия инфекции, а также среди инфицированных пациентов для классификации на инфекцию. , сепсис или септический шок (сепсис 3.0).

После завершения набора участников панель маркеров клеточной поверхности будет измерена партиями на спектральном цитометре, включая, в частности, уже опубликованные интересующие биомаркеры: HLA-DR, CD169 и CX3CR1 на моноцитах, а также MerTk, CD64 и CD24 на нейтрофилах. .

В первую очередь будут проверены характеристики комбинаций маркеров клеточной поверхности, уже идентифицированных в литературе. Однако, чтобы уточнить лучшие комбинации биомаркеров для различения бактериальной инфекции от вирусной, алгоритмы машинного обучения, такие как дерево повышения градиента и станки опорных векторов, будут применяться ко всем результатам измерения маркеров клеточной поверхности. Диагностическая эффективность будет оцениваться путем расчета чувствительности, специфичности и площади под ROC-кривой выбранных комбинаций биомаркеров.