Kombinasjon av leukocyttcelleoverflatebiomarkører målt ved cytometri, for å skille bakterieinfeksjoner fra virale infeksjoner i akuttmottaket: en multisentrisk kohort for validering av diagnostiske ytelser (CYTOBACT)

Pasienter som går på akuttmottaket til et av deltakersentrene ved mistanke om infeksjon vil bli informert og bedt om å delta. Etter å ha innhentet en ikke-motstand til å delta, under den rutinemessige blodprøvetakingen utført i akuttmottaket, vil et ekstra volum på 30 ml fullblod samles inn, alikvoteres og lagres ved -80°C, spesielt bestående av 12 ml fullblod som 1 ml Cytodelics® Stabilizer vil tilsettes og inkuberes ved romtemperatur i 10 minutter før den blir delt ut og lagret ved -80°C. Det gjenværende fullblodet vil bli samlet på EDTA- og Paxgen-rør, sentrifugert, alikvotert og lagret ved -80°C for blodprøvetaking.

Kliniske data ved innleggelse (tidligere medisinsk historie, vitale parametere, smittekilde (hvis noen), behandlinger levert på akuttmottaket) vil bli registrert i en eCRF. Deltakerne vil bli fulgt opp til de forlater sykehuset og ikke lenger enn dag-28. Alle mikrobiologiske tester utført under sykehusoppholdet vil også bli registrert i eCRF. Den diagnostiske ytelsen til kombinasjonene av celleoverflatemarkører vil bli evaluert mot en diagnostisk referanse på bakterie- eller viral-kvalifiseringen for hver smittsom hendelse. Denne diagnostiske referansen vil bli etablert av en uavhengig ekspertkomité etter å ha gjennomgått alle kliniske og biologiske data som er registrert (unntatt resultatene av flowcytometri), for å avgjøre mellom bakteriell, viral eller ingen infeksjon, og blant infiserte pasienter for å klassifisere i infeksjon , sepsis eller septisk sjokk (sepsis 3.0).

Etter å ha fullført rekrutteringen av deltakere, vil et panel av celleoverflatemarkører bli målt batchvis på et spektralcytometer, som spesielt omfatter biomarkørene av interesse som allerede er publisert: HLA-DR, CD169 og CX3CR1 på monocytter, og MerTk, CD64 og CD24 på nøytrofiler .

Ytelsen til kombinasjonene av celleoverflatemarkører som allerede er identifisert i litteraturen vil bli testet prioritert. Men for å foredle de beste kombinasjonene av biomarkører for å skille bakteriell fra virusinfeksjon, vil maskinlæringsalgoritmer som gradientforsterkende tre og støttevektormaskinverktøy bli brukt på hele resultatene av målte celleoverflatemarkører. Den diagnostiske ytelsen vil bli evaluert ved å beregne sensitiviteten, spesifisiteten, arealet under ROC-kurven til de valgte biomarkørkombinasjonene.