Icke-invasiv diagnostik av små njurmassar (NISar)

Studie 1:

Testmål:

Identifiering av biomarkörer i blod och urin samt att lägga grunden för ett minimalt invasivt diagnostiskt program för SRM.

Metod:

Provsamling:

Alla blodprover kommer att samlas in i rör som innehåller etylendiamin-tetraacetat (EDTA). två prover centrifugeras sedan vid 2000 G i 10 minuter för att isolera plasma, som sedan förvaras vid -80oC. De återstående 2 proverna lagras vid -80oC som de är. Total nukleinsyra (TNA) kommer att extraheras från koncentrerade urin- och plasmaprover som tidigare beskrivits med hjälp av ett NucliSENS easy MAG-instrument. Extraherad TNA kommer sedan att användas för målinriktad immun- och onkologisk profilering (mutationer och uttryck) med hjälp av nästa generations sekvensering (NGS)-baserad RNA- och DNA-sekvensering.

Det ytterligare kärnprovet från njurtumören kommer att lagras utan konserveringsmedel för NGS-baserad DNA- och RNA-sekv-analys.

Studie 2:

Testmål:

Identifiering av förändringar i cirkulerande biomarkörer efter kurativ behandling hos patienter med biopsiverifierad njurcancer.

Metoder:

Patientrekrytering:

Patienter kommer att registreras i studie 2 på samma sätt som studie 1.

Provsamling:

Utöver de fyra första proverna kommer ytterligare fyra blodprover (20 ml) att tas 1 månad och 6 månader efter kurativ behandling från varje patient. Alla prover kommer att kodas och ges ett ID enligt patientens CPR-nummer med hjälp av RedCap informatiska kodsystem.

Provförvaring, beredning och analys:

Blod- och urinprover kommer att hanteras på samma sätt som i studie 1. Statistisk analys för studie 1 och 2:

Explorativ analys av data kommer att utföras på molekylära uttrycksnivåer för specifika identifierade sekvenser, en oövervakad hierarkisk klustring kommer att passas in och värmekartor kommer att produceras. Egenskaper för klustrade element kommer att matchas ytterligare med histopatologiska resultat för att söka efter histologiska aggregeringsmönster.

Uttrycksnivåer av de identifierade sekvenserna i blod och urin kommer att jämföras med hjälp av Whitney U-test och Kruskal-Wallis-test. Förändringar i uttrycksnivåer från preoperativ till postoperativ kommer att utvärderas med Friedmans ANOVA och efterföljande post-hoc parvis jämförelse med Wilcoxons signerade rangtest med Bonferroni-korrigering.

Analys av mottagarens funktionskarakteristiska kurvor kommer att utföras ytterligare på preoperativa prover, för att testa validiteten av analyserna för varje markör för att skilja mellan benignant histologi och malignitet, med en cut-off för area under curve (AUC) på 0,75.

Urvalsstorlek Den minimala urvalsstorlek som krävs för att uppnå en statistisk styrka på 80 % med en signifikansnivå på 0,05 och en förväntad bortfallsfrekvens på 15 % kommer att vara 155 patienter.

Beräkningar för provstorlek har beräknats med programvaran GPower (Düsseldorf, DE).

Studie 3:

Testmål:

Att undersöka det diagnostiska värdet av mpMRI vid bestämning av malignitet i SRM.

Metod:

Patientrekrytering:

Efter att ha lämnat ett skriftligt medgivande kommer en mpMRI att schemaläggas samma dag men innan den primära biopsien. Alla mpMRI kommer att utföras lokalt och bilderna överförs till Odense Universitetssjukhus där en specialistradiolog kommer att undersöka skanningarna på ett förblindat sätt, vilket innebär att han kommer att vara okunnig om patologens diagnos. Resultatet kommer att lagras i en kodad RedCAP-databas.

MpMRI utförs enligt ett standardprotokoll och inkluderar följande sekvenser: T1 (med reducerad affinitet för fettvävnad) +/- kontrast, diffusionsviktade sekvenser och in-/tvättning.