Regulatoriskt nätverk och diagnostiskt värde av nyckel autofagi-relaterade gener i sepsis
30 augusti 2022 uppdaterad av: Sun Yat-Sen Memorial Hospital of Sun Yat-Sen University
Autofagi spelar en viktig roll i uppkomsten och utvecklingen av sepsis.
Denna studie syftar till att utforska och verifiera de viktigaste autofagi-relaterade generna i sepsis, sedan konstruera deras regulatoriska nätverk och utvärdera deras potentiella diagnostiska värde, för att ge nya idéer för diagnos och behandling av sepsis.
Studieöversikt
Status
Har inte rekryterat ännu
Intervention / Behandling
Detaljerad beskrivning
(1) Sepsis-relaterade datamängder GSE65682, GSE134347 och GSE134358 laddades ner från GEO-databasen, och DEmRNA, DElncRNA och DEmiRNA erhölls genom differentiell analys.
(2) Autophagy-relaterade gener (ARG) erhölls från Human Autophagy Database, och ARGs i GSE65682 och GSE134347 extraherades.
DEARG erhölls genom differentialanalys och GO- och KEGG-anrikningsanalys utfördes.
(3) Sepsis-relaterade gener erhölls genom WGCNA-analys, och nyckel-DEARGs i sepsis erhölls genom korsning med DEARGs, och sedan analyserades transkriptionsfaktorer och ceRNA-reglerande nätverk.
(4) Immuninfiltrationsanalys användes för att utvärdera fördelningen av immunceller i blodet hos patienter med sepsis, och dess korrelation med nyckel DEARG analyserades ytterligare.
(5) De diagnostiska funktionerna hos nyckel DEARG analyserades.
(6) Perifera blodprover från sepsispatienter och friska kontroller samlades in och verifierades med RT-qPCR.
Studietyp
Observationell
Inskrivning (Förväntat)
40
Kontakter och platser
Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.
Studiekontakt
- Namn: Zhijie He
- Telefonnummer: 13710898290
- E-post: hezhijie2004@126.com
Studera Kontakt Backup
- Namn: Li Yang
- Telefonnummer: 15254586586
- E-post: 375948656@qq.com
Deltagandekriterier
Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
18 år och äldre (Vuxen, Äldre vuxen)
Tar emot friska volontärer
Ja
Kön som är behöriga för studier
Allt
Testmetod
Icke-sannolikhetsprov
Studera befolkning
sepsisgrupp: Kvalificerade patienter med sepsis inlagda på ICU vid Sun Yat-sen Memorial Hospital vid Sun Yat-sen University från september 2022 till december 2022.
kontrollgrupp: Ålders- och könsmatchade friska kontroller.
Beskrivning
Inklusionskriterier:1) över 18 år; 2) Att uppfylla de diagnostiska kriterierna för Sepsis 3.0; 3) Sjukhusvistelse längre än 24 timmar.
Uteslutningskriterier: 1) Malign tumör; 2) Autoimmuna sjukdomar; 3) Användning av immunsuppressiva medel under de senaste två veckorna; 4) Återinläggning eller förflyttning från annan intensivvårdsavdelning på grund av samma sjukdom.
Studieplan
Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
kontrollgrupp
|
inget ingripande
|
|
sepsis grupp
|
inget ingripande
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Diagnostiskt värde av nyckel autofagi-relaterade gener i sepsis
Tidsram: Oktober 2022
|
De diagnostiska funktionerna hos nyckel DEARGs (Differential Autophagy-related Genes) analyserades
|
Oktober 2022
|
|
Regulatory Network of Key Autophagy-relaterade gener i sepsis
Tidsram: Oktober 2022
|
Viktiga DEARGs i sepsis analyserades för transkriptionsfaktorer och ceRNA-reglerande nätverk
|
Oktober 2022
|
|
Verifierade nyckelautofagirelaterade gener i sepsis med RT-qPCR.
Tidsram: December 2022
|
Perifera blodprover från sepsispatienter och friska kontroller samlades in och verifierades med RT-qPCR.
|
December 2022
|
Samarbetspartners och utredare
Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.
Publikationer och användbara länkar
Den som ansvarar för att lägga in information om studien tillhandahåller frivilligt dessa publikationer. Dessa kan handla om allt som har med studien att göra.
Allmänna publikationer
- Singer M, Deutschman CS, Seymour CW, Shankar-Hari M, Annane D, Bauer M, Bellomo R, Bernard GR, Chiche JD, Coopersmith CM, Hotchkiss RS, Levy MM, Marshall JC, Martin GS, Opal SM, Rubenfeld GD, van der Poll T, Vincent JL, Angus DC. The Third International Consensus Definitions for Sepsis and Septic Shock (Sepsis-3). JAMA. 2016 Feb 23;315(8):801-10. doi: 10.1001/jama.2016.0287.
- Takahashi W, Watanabe E, Fujimura L, Watanabe-Takano H, Yoshidome H, Swanson PE, Tokuhisa T, Oda S, Hatano M. Kinetics and protective role of autophagy in a mouse cecal ligation and puncture-induced sepsis. Crit Care. 2013 Jul 24;17(4):R160. doi: 10.1186/cc12839.
- Aguirre A, Lopez-Alonso I, Gonzalez-Lopez A, Amado-Rodriguez L, Batalla-Solis E, Astudillo A, Blazquez-Prieto J, Fernandez AF, Galvan JA, dos Santos CC, Albaiceta GM. Defective autophagy impairs ATF3 activity and worsens lung injury during endotoxemia. J Mol Med (Berl). 2014 Jun;92(6):665-76. doi: 10.1007/s00109-014-1132-7. Epub 2014 Feb 19.
- Oami T, Watanabe E, Hatano M, Sunahara S, Fujimura L, Sakamoto A, Ito C, Toshimori K, Oda S. Suppression of T Cell Autophagy Results in Decreased Viability and Function of T Cells Through Accelerated Apoptosis in a Murine Sepsis Model. Crit Care Med. 2017 Jan;45(1):e77-e85. doi: 10.1097/CCM.0000000000002016.
Studieavstämningsdatum
Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.
Studera stora datum
Studiestart (Förväntat)
1 september 2022
Primärt slutförande (Förväntat)
31 december 2022
Avslutad studie (Förväntat)
31 december 2022
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
30 augusti 2022
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
30 augusti 2022
Första postat (Faktisk)
1 september 2022
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
1 september 2022
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
30 augusti 2022
Senast verifierad
1 augusti 2022
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- SYSKY-2022-251-01
Plan för individuella deltagardata (IPD)
Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?
OBESLUTSAM
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Nej
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Nej
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .
Kliniska prövningar på Sepsis
-
University of Kansas Medical CenterUniversity of KansasRekryteringSepsis | Septisk chock | Sepsis syndrom | Sepsis, svår | Sepsis bakterie | Sepsis bakteriemiFörenta staterna
-
Jip GroenInBiomeRekryteringMikrobiell kolonisering | Neonatal infektion | Neonatal sepsis, tidig debut | Mikrobiell sjukdom | Klinisk sepsis | Kultur Negativ Neonatal Sepsis | Neonatal sepsis, sen debut | Kultur Positiv neonatal sepsisNederländerna
-
Karolinska InstitutetÖrebro University, SwedenAvslutadSepsis | Sepsis syndrom | Sepsis, svårSverige
-
Ohio State UniversityAvslutadSepsis, Svår Sepsis och Septisk ShockFörenta staterna
-
University of LeicesterUniversity Hospitals, Leicester; The Royal College of AnaesthetistsAvslutadSepsis | Septisk chock | Svår sepsis | Sepsis syndromStorbritannien
-
Indonesia UniversityAvslutadSvår sepsis med septisk chock | Svår sepsis utan septisk chockIndonesien
-
Beckman Coulter, Inc.Biomedical Advanced Research and Development AuthorityRekryteringSvår sepsis | Svår sepsis utan septisk chockFörenta staterna
-
Weill Medical College of Cornell UniversityNational Heart, Lung, and Blood Institute (NHLBI); New York Presbyterian... och andra samarbetspartnersAvslutadSepsis | Septisk chock | Svår sepsis | Infektion | Sepsis syndromFörenta staterna
-
Inverness Medical InnovationsAvslutadSepsis | Systemiskt inflammatoriskt svarssyndrom | Svår sepsis | Sepsis syndromFörenta staterna
-
Yale UniversityIndragenNeonatal tidig sepsis | Neonatal sent debuterande sepsisFörenta staterna
Kliniska prövningar på inget ingripande
-
Case Western Reserve UniversityAmerican UniversityHar inte rekryterat ännuNäring, hälsosam
-
Otsuka Pharmaceutical Factory, Inc.CelerionAvslutad
-
Seoul National University HospitalSamsung Medical Center; Chosun University HospitalAvslutadRadiofrekvensablation | MikrovågsablationKorea, Republiken av
-
Federal University of São PauloOkändHjärtkirurgi | Aorta No-touchBrasilien
-
University of MinnesotaAvslutad
-
Catharina Ziekenhuis EindhovenAvslutadVaskulära infektionerNederländerna
-
University of British ColumbiaAvslutadCentral Line komplikationKanada
-
Swiss Federal Institute of TechnologyInstituto de Investigação em ImunologiaAvslutadStörningar i järnmetabolism | Överbelastning av järn | PolyfenolerPortugal, Schweiz
-
Assistance Publique - Hôpitaux de ParisAvslutadSicklecellanemiFrankrike