- ICH GCP
- Registr klinických studií v USA
- Klinická studie NCT03127111
Genetické a epigenetické determinanty odpovědi na adjuvantní chemoterapii na bázi fluorouracilu u pacientů s kolorektálním karcinomem stadia III
Identifikace, validace a implementace molekulárních markerů k predikci odpovědi na adjuvantní chemoterapii na bázi fluorouracilu u pacientů s kolorektálním karcinomem stadia III – prospektivní klinická observační studie
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Detailní popis
Jedná se o prospektivní projekt v oblasti sběru a hodnocení dat klinických výsledků souvisejících s molekulárním profilováním nádorů na základě vzorků z periferní krve, primárního nádoru a přilehlé normální kolorektální tkáně.
Cíle:
- Validace prediktivní hodnoty známých markerů CpG ostrovního metylátorového fenotypu (CIMP) a mikrosatelitní nestability (MSI) v odpovědi na chemoterapii na bázi 5-fluorouracilu u pacientů s kolorektálním karcinomem stadia III.
- Průzkumné hodnocení potenciálních prediktivních hodnot známých genetických variací včetně, ale bez omezení na, mutací KRAS, BRAF, PIK3A a EGFR mutací atd.
- Průzkumná identifikace a hodnocení prediktivní hodnoty nových metylačních aberací identifikovaných celogenomovým bisulfitovým sekvenováním.
- Průzkumná identifikace a hodnocení prediktivní hodnoty nových genetických aberací objevených sekvenováním RNA (RNA-seq) nebo celogenomovou asociační studií (GWAS).
Obrys:
Krev se odebírá na začátku a vyšetřuje se na jednonukleotidové polymorfismy (SNP) a úroveň exprese specifického genu. Nádor a odpovídající normální tkáň při chirurgické resekci a hodnocené na genové metylace, mutace a exprese.
Typ studie
Zápis (Očekávaný)
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
Hubei
-
Wuhan, Hubei, Čína, 430060
- Department of Gastrointestinal Surgery II, Renmin Hospital of Wuhan University
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
Požadavky na parametry nádoru
- Histologicky potvrzený kolorektální adenokarcinom.
- Onemocnění stadia III (jakýkoli pT, N1-2, M0).
- Nádory musely být kurativní resekcí (R0).
- Žádné známky reziduálního postižení lymfatických uzlin nebo metastatického onemocnění v době registrace.
Požadavky na charakteristiky pacienta
- V den souhlasu se studií je pacientovi ≥ 18 let.
- Stav výkonnosti východní kooperativní onkologické skupiny (ECOG PS) 0 nebo 1 v době screeningu.
- Plodné pacientky musí používat účinnou antikoncepci.
- Pacienti musí prokázat schopnost porozumět a ochotu podepsat písemný informovaný souhlas.
- Pacienti musí prokázat schopnost vyplnit studijní dotazníky.
- Pacienti musí před provedením postupů nebo hodnocení specifických pro studii poskytnout písemný informovaný souhlas a musí být ochotni podřídit se léčbě a dalšímu sledování.
Požadované výchozí laboratorní hodnoty
- Leukocyty ≥ 3 000/mm^3
- Absolutní počet neutrofilů ≥ 1 500/mm^3
- Počet krevních destiček ≥ 100 000/mm^3
- Kreatinin ≤ 1,5násobek horní hranice normálu (ULN)
- Celkový bilirubin ≤ 1,5krát ULN
- Aspartátaminotransferáza (AST) ≤ 2,5krát ULN
- Alaninaminotransferáza (ALT) ≤ 2,5krát ULN
Kritéria vyloučení:
- Pacienti se známou anamnézou alergických reakcí připisovaných sloučeninám podobného chemického nebo biologického složení jako fluorouracil.
- Nekontrolované interkurentní onemocnění, včetně, ale bez omezení na, probíhající nebo aktivní infekce vyžadující intravenózní antibiotika nebo psychologické, rodinné, sociologické nebo geografické podmínky, které by omezovaly shodu s požadavky studie
- Po kardiovaskulárních stavech během posledních 6 měsíců: Infarkt myokardu, nestabilní angina pectoris, symptomatické městnavé srdeční selhání, závažná nekontrolovaná srdeční arytmie, cerebrovaskulární příhoda nebo tranzitorní ischemická ataka, hluboká žilní trombóza, jiná významná tromboembolická příhoda.
- Pacienti se známým virem lidské imunodeficience (HIV) pozitivní a pacienti se známou hepatitidou B nebo C.
- Pacienti s prokázanými jinými primárními malignitami během posledních 5 let, s výjimkou adekvátně léčeného bazaliomu kůže nebo karcinomu in situ děložního čípku.
- Těhotná nebo kojící.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Adjuvantní chemoterapie
Vzorky od pacientů s kolorektálním karcinomem stadia III, kteří budou dostávat adjuvantní chemoterapii na bázi fluorouracilu, budou použity pro analýzu genových mutací, analýzu methylace genů, analýzu genové exprese, analýzu SNP a analýzu exprese proteinů.
|
Genomová DNA extrahovaná z párovaných čerstvě zmrazených nádorových a normálních tkání se používá pro mutace KRAS, BRAF, PIK3A a EGFR mutace atd., sekvenováním a pro MSI analýzu pomocí PCR a kapilární elektroforézy.
Genomová DNA extrahovaná z spárovaných čerstvě zmrazených nádorových a normálních tkání se používá pro specifickou genovou methylaci nebo analýzu stavu CIMP pomocí MethyLight nebo bisulfitového sekvenování.
K identifikaci nové sady kandidátů prediktivních markerů bude použito celogenomové bisulfitové sekvenování.
RNA extrahovaná z párovaných čerstvě zmrazených nádorových a normálních tkání nebo séra se používá pro specifickou analýzu genové exprese pomocí PCR s reverzní transkripcí v reálném čase (RT-qPCR).
RNA-seq bude použita k identifikaci nové sady kandidátů prediktivních markerů.
Genomová DNA extrahovaná ze séra se používá pro specifickou analýzu SNP pomocí sekvenování.
GWAS s polem SNP bude použito k identifikaci nové sady kandidátů prediktivních markerů.
Tkáňový mikročip vyrobený z párových nádorových a normálních tkání fixovaných v parafínu (FFPE) se používá pro specifickou analýzu proteinové exprese imunohistochemickým barvením.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Doba do opakování (TTR)
Časové okno: 3 roky po operaci
|
Čas do jakékoli události, kromě smrti nesouvisející s rakovinou.
Všechny recidivy, úmrtí související s léčbou, druhá stejná nebo jiná primární rakovina a úmrtí na jiné rakoviny jsou považovány za události.
Ztráta následků a úmrtí nesouvisejících s rakovinou jsou cenzurována.
Budou analyzovány asociace mezi TTR a genetickými a epigenetickými markery.
|
3 roky po operaci
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Přežití bez onemocnění (DFS)
Časové okno: 3 roky, 5 let po operaci
|
Čas na jakoukoli událost, bez ohledu na příčinu.
Jsou zahrnuty všechny události, kromě ztráty na sledování.
Budou analyzovány asociace mezi DFS a genetickými a epigenetickými markery.
|
3 roky, 5 let po operaci
|
|
Přežití specifické pro rakovinu (CSS)
Časové okno: 3 roky, 5 let po operaci
|
Doba do smrti způsobená stejnou rakovinou, ať už kvůli původnímu nádoru nebo druhé primární stejné rakovině.
Jedinou událostí je úmrtí na stejnou rakovinu, bez ohledu na to, zda je smrt způsobena primárním nádorem nebo druhou stejnou rakovinou.
Lokoregionální recidiva, vzdálené metastázy, druhé primární stejné rakoviny a druhé další primární rakoviny jsou ignorovány.
Úmrtí na jiné druhy rakoviny, úmrtí nesouvisející s rakovinou, úmrtí související s léčbou a ztráta sledování jsou cenzurována.
Budou analyzovány asociace mezi CSS a genetickými a epigenetickými markery.
|
3 roky, 5 let po operaci
|
|
Celkové přežití (OS)
Časové okno: 3 roky, 5 let po operaci
|
Čas smrti, bez ohledu na příčinu.
Není třeba upřesňovat, zda k úmrtí došlo na rakovinu.
Lokoregionální recidiva, vzdálené metastázy, druhý primární kolorektální karcinom a druhý další primární karcinom jsou ignorovány.
Ztráta následných opatření je cenzurována.
Budou analyzovány asociace mezi OS a genetickými a epigenetickými markery.
|
3 roky, 5 let po operaci
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- Punt CJ, Buyse M, Kohne CH, Hohenberger P, Labianca R, Schmoll HJ, Pahlman L, Sobrero A, Douillard JY. Endpoints in adjuvant treatment trials: a systematic review of the literature in colon cancer and proposed definitions for future trials. J Natl Cancer Inst. 2007 Jul 4;99(13):998-1003. doi: 10.1093/jnci/djm024. Epub 2007 Jun 27.
- Jover R, Nguyen TP, Perez-Carbonell L, Zapater P, Paya A, Alenda C, Rojas E, Cubiella J, Balaguer F, Morillas JD, Clofent J, Bujanda L, Rene JM, Bessa X, Xicola RM, Nicolas-Perez D, Castells A, Andreu M, Llor X, Boland CR, Goel A. 5-Fluorouracil adjuvant chemotherapy does not increase survival in patients with CpG island methylator phenotype colorectal cancer. Gastroenterology. 2011 Apr;140(4):1174-81. doi: 10.1053/j.gastro.2010.12.035. Epub 2010 Dec 24.
- Carethers JM, Smith EJ, Behling CA, Nguyen L, Tajima A, Doctolero RT, Cabrera BL, Goel A, Arnold CA, Miyai K, Boland CR. Use of 5-fluorouracil and survival in patients with microsatellite-unstable colorectal cancer. Gastroenterology. 2004 Feb;126(2):394-401. doi: 10.1053/j.gastro.2003.12.023.
- Gamazon ER, Huang RS, Cox NJ, Dolan ME. Chemotherapeutic drug susceptibility associated SNPs are enriched in expression quantitative trait loci. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 May 18;107(20):9287-92. doi: 10.1073/pnas.1001827107. Epub 2010 May 4.
- Dai J, Gu J, Huang M, Eng C, Kopetz ES, Ellis LM, Hawk E, Wu X. GWAS-identified colorectal cancer susceptibility loci associated with clinical outcomes. Carcinogenesis. 2012 Jul;33(7):1327-31. doi: 10.1093/carcin/bgs147. Epub 2012 Apr 12.
- Xing J, Myers RE, He X, Qu F, Zhou F, Ma X, Hyslop T, Bao G, Wan S, Yang H, Chen Z. GWAS-identified colorectal cancer susceptibility locus associates with disease prognosis. Eur J Cancer. 2011 Jul;47(11):1699-707. doi: 10.1016/j.ejca.2011.02.004. Epub 2011 Mar 12.
- Lin M, Gu J, Eng C, Ellis LM, Hildebrandt MA, Lin J, Huang M, Calin GA, Wang D, Dubois RN, Hawk ET, Wu X. Genetic polymorphisms in MicroRNA-related genes as predictors of clinical outcomes in colorectal adenocarcinoma patients. Clin Cancer Res. 2012 Jul 15;18(14):3982-91. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-11-2951. Epub 2012 Jun 1.
- O'Donnell PH, Stark AL, Gamazon ER, Wheeler HE, McIlwee BE, Gorsic L, Im HK, Huang RS, Cox NJ, Dolan ME. Identification of novel germline polymorphisms governing capecitabine sensitivity. Cancer. 2012 Aug 15;118(16):4063-73. doi: 10.1002/cncr.26737. Epub 2012 Jan 3.
- Yoon HH, Tougeron D, Shi Q, Alberts SR, Mahoney MR, Nelson GD, Nair SG, Thibodeau SN, Goldberg RM, Sargent DJ, Sinicrope FA; Alliance for Clinical Trials in Oncology. KRAS codon 12 and 13 mutations in relation to disease-free survival in BRAF-wild-type stage III colon cancers from an adjuvant chemotherapy trial (N0147 alliance). Clin Cancer Res. 2014 Jun 1;20(11):3033-43. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-13-3140. Epub 2014 Mar 31.
- Roepman P, Schlicker A, Tabernero J, Majewski I, Tian S, Moreno V, Snel MH, Chresta CM, Rosenberg R, Nitsche U, Macarulla T, Capella G, Salazar R, Orphanides G, Wessels LF, Bernards R, Simon IM. Colorectal cancer intrinsic subtypes predict chemotherapy benefit, deficient mismatch repair and epithelial-to-mesenchymal transition. Int J Cancer. 2014 Feb 1;134(3):552-62. doi: 10.1002/ijc.28387. Epub 2013 Sep 13.
- Dalerba P, Sahoo D, Paik S, Guo X, Yothers G, Song N, Wilcox-Fogel N, Forgo E, Rajendran PS, Miranda SP, Hisamori S, Hutchison J, Kalisky T, Qian D, Wolmark N, Fisher GA, van de Rijn M, Clarke MF. CDX2 as a Prognostic Biomarker in Stage II and Stage III Colon Cancer. N Engl J Med. 2016 Jan 21;374(3):211-22. doi: 10.1056/NEJMoa1506597.
- Sinicrope FA, Mahoney MR, Smyrk TC, Thibodeau SN, Warren RS, Bertagnolli MM, Nelson GD, Goldberg RM, Sargent DJ, Alberts SR. Prognostic impact of deficient DNA mismatch repair in patients with stage III colon cancer from a randomized trial of FOLFOX-based adjuvant chemotherapy. J Clin Oncol. 2013 Oct 10;31(29):3664-72. doi: 10.1200/JCO.2013.48.9591. Epub 2013 Sep 9.
- Sinicrope FA, Shi Q, Smyrk TC, Thibodeau SN, Dienstmann R, Guinney J, Bot BM, Tejpar S, Delorenzi M, Goldberg RM, Mahoney M, Sargent DJ, Alberts SR. Molecular markers identify subtypes of stage III colon cancer associated with patient outcomes. Gastroenterology. 2015 Jan;148(1):88-99. doi: 10.1053/j.gastro.2014.09.041. Epub 2014 Oct 8.
- Toiyama Y, Hur K, Tanaka K, Inoue Y, Kusunoki M, Boland CR, Goel A. Serum miR-200c is a novel prognostic and metastasis-predictive biomarker in patients with colorectal cancer. Ann Surg. 2014 Apr;259(4):735-43. doi: 10.1097/SLA.0b013e3182a6909d.
- Calon A, Lonardo E, Berenguer-Llergo A, Espinet E, Hernando-Momblona X, Iglesias M, Sevillano M, Palomo-Ponce S, Tauriello DV, Byrom D, Cortina C, Morral C, Barcelo C, Tosi S, Riera A, Attolini CS, Rossell D, Sancho E, Batlle E. Stromal gene expression defines poor-prognosis subtypes in colorectal cancer. Nat Genet. 2015 Apr;47(4):320-9. doi: 10.1038/ng.3225. Epub 2015 Feb 23.
- Kap EJ, Seibold P, Scherer D, Habermann N, Balavarca Y, Jansen L, Zucknick M, Becker N, Hoffmeister M, Ulrich A, Benner A, Ulrich CM, Burwinkel B, Brenner H, Chang-Claude J. SNPs in transporter and metabolizing genes as predictive markers for oxaliplatin treatment in colorectal cancer patients. Int J Cancer. 2016 Jun 15;138(12):2993-3001. doi: 10.1002/ijc.30026. Epub 2016 Feb 19.
- Dienstmann R, Vermeulen L, Guinney J, Kopetz S, Tejpar S, Tabernero J. Consensus molecular subtypes and the evolution of precision medicine in colorectal cancer. Nat Rev Cancer. 2017 Mar 23;17(4):268. doi: 10.1038/nrc.2017.24. No abstract available.
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Očekávaný)
Primární dokončení (Očekávaný)
Dokončení studie (Očekávaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- GEDEREFAC-CRC
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Analýza genových mutací
-
Burcin CelikOndokuz Mayıs UniversityZatím nenabírámeChronická obstrukční plicní nemoc (CHOPN)
-
Istituto per la Ricerca e l'Innovazione BiomedicaNábor
-
University of VirginiaNeznámý
-
IRCCS Eugenio MedeaDokončenoPoruchou autistického spektra | Včasná intervenceItálie
-
University of AlbertaNáborMrtvice | Dětská mozková obrna | Traumatické zranění mozku | Poranění míchy | Idiopatická chůze po prstech | Dědičná spastická paraparéza | Tethering míchy | Dědičná smyslová motorická neuropatieKanada
-
Johns Hopkins UniversityNational Institute on Deafness and Other Communication Disorders (NIDCD); GN...DokončenoZávrať | ZávraťSpojené státy
-
The Cleveland ClinicNational Heart, Lung, and Blood Institute (NHLBI)DokončenoAneuryzma břišní aortySpojené státy
-
QIAGEN Gaithersburg, IncDokončeno
-
Fundacion Clinic per a la Recerca BiomédicaHospital Clinic of BarcelonaNáborNevi a melanomy | Melanom (rakovina kůže)Španělsko