Mikrobiota v kůži a sliznici pacientů se zánětlivými kožními chorobami

Pozadí a cíl Patogeneze mnoha zánětlivých onemocnění nejsou zcela pochopeny, přesto je dysregulace lidské mikroflóry stále více zkoumána jako možný přispívající faktor. Lidská mikroflóra zahrnuje bakterie, archaea, viry a houby. Obecně je málo známo o kolonizaci plísní u zánětlivých kožních onemocnění, i když se zdá, že u pacientů s psoriázou a atopickou dermatitidou jsou druhy Candida v ústní sliznici, kůži a stolici zvýšené. Zánět je také důležitou součástí patogeneze u dalších kožních onemocnění, jako je hidradenitis suppurativa, akné, vaskulitida a zánětlivé vředy. Zvýšená kolonizace plísní může být přítomna u mnoha zánětlivých kožních onemocnění, ale toto nebylo dříve zkoumáno. Studie zánětlivých onemocnění zahrnujících další části těla, jako je systémový lupus erythematodes, Sjögrenova choroba, roztroušená skleróza a spondyloartritida, také prokázaly zvýšenou kolonizaci druhy Candida. Není však jasné, zda je kolonizace Candidou příčinou nebo důsledkem zánětlivého onemocnění. Léčba zánětlivých onemocnění systémovými imunomodulačními léky nebo rekurentní antibiotická terapie může také ovlivnit kolonizaci kvasinkami. Vznik biologických terapií, které přímo nebo nepřímo modulují dráhu interleukinu (IL) 17, zdůrazňuje potřebu dalších znalostí, protože dráha IL-17 se podílí na obraně proti kvasinkovým infekcím u zdravých jedinců. Až dosud se výzkumy kolonizace kvasinkami zaměřovaly především na Candidu a Malassezii. Zda mohou být zajímavé i jiné druhy kvasinek, je stále nejisté.

Tato studie si klade za cíl zkoumat prevalenci mikrobiomu a infekcí v kůži a sliznici dutiny ústní u různých pacientů a zdravých dobrovolníků navštěvujících dermatologickou ambulanci.

Metody Realizace studie Projekt je realizován ve spolupráci mezi Dermatologickým oddělením, Roskilde University Hospital a Statens Serum Institut (SSI) pod vedením primární řešitelky, primářky v dermatologii, PhD, Ditte Marie Lindhardt Saunte. Projekt podporuje lékařka v dermatologii, PhD Elisabeth Hjardem Taudorf, sestra pro dermatologii Helle Anette Jensen a zavedená výzkumná skupina na kožním oddělení. Vzorky budou analyzovány na SSI na Odd. bakterií, parazitů a hub pod vedením PhD Henrika Vedela Nielsena a vedoucího oddělení mikrobiální bioinformatiky, oddělení bakterií, parazitů a hub, PhD Marca Steggera.

Design studie Případová-kontrolní studie srovnávající výskyt kvasinkové kolonizace nebo infekce v kůži a sliznici dutiny ústní u pacientů s různými kožními onemocněními a zdravých dobrovolníků. Pacienti s vybranými kožními chorobami, zaměstnanci zélandské univerzitní nemocnice v Roskilde, příbuzní zaměstnanců a studenti se vztahem k dermatologickému oddělení budou požádáni, aby vyplnili krátký dotazník a nechali si odebrat swapy z ústní sliznice, stejně jako kožní seškraby a pásky. z kůže lézí (pouze pacienti) a kůže bez lézí (všichni).

Swapy budou vyšetřeny na Oddělení mikrobiální bioinformatiky, Oddělení bakterií, parazitů a hub, Statens Serum Institut. Podskupina pacientů, kteří zahajují systémovou léčbu kožního onemocnění při prvním vyšetření, bude požádána, aby po přibližně třech měsících zopakovala dotazník, výměny, kožní seškraby a pásky.

Klinické snímky kůže nebo sliznice lézí budou pořízeny a uloženy na zabezpečeném IT místě (Sharepoint a v klinické zprávě SP) po písemném souhlasu.

Budou stanoveny statistiky Prevalence a Odds Ratios (OR). S hladinou oboustranné významnosti 95 %, mocninou 80 %, očekávaným poměrem zdravých kontrol vs. pacientů s kožním onemocněním 0,5 a očekávaným OR 2,73, minimální velikost vzorku 127 pacientů na kožní onemocnění a 64 zdravých kontroly jsou potřeba. Naším cílem je zahrnout přibližně 130 pacientů na jedno kožní onemocnění. Celkem bude zařazeno maximálně 700 jedinců, z toho 70 zdravých kontrol. Zahrnutí pacientů se vzácnými kožními chorobami může v některých skupinách vyžadovat méně pacientů.

Rizika, vedlejší účinky a nevýhody Všechny vzorky se skládají z neinvazivních slizničních swapů, kožních seškrabů nebo povrchových pásků, u kterých není žádné riziko známých nežádoucích účinků. Může to být spojeno s minimálním nepohodlím během odběru vzorků a účastníci mohou využít dalších 15 minut svého času k získání informací o projektu. Kromě toho tento projekt nezpůsobuje žádná známá rizika, vedlejší účinky nebo nevýhody.

Biologický materiál Výměny ze sliznic a kůže. Do tohoto projektu není zapojena žádná biobanka.

Ekonomika Dermatologické oddělení, Roskilde University Hospital poskytuje vzorky materiálů a oddělení bakterií, parazitů a hub, Statens Serum Institute, Kodaň vzorky analyzuje. Obě oddělení si hradí náklady samy. Projekt je zcela nezávislý a nezískává finanční podporu od třetích stran. Žádný ze zapojených výzkumných pracovníků nedostává platbu za účast nebo není ve střetu zájmů v souvislosti s projektem.

Odměna pro účastníky studie Účastníci neobdrží žádnou odměnu ani kompenzaci související s účastí ve studii.

Nábor účastníků studie a informovaný souhlas Pacienti, příbuzní a zaměstnanci kožního oddělení v Roskilde budou požádáni o účast. Pacienti a příbuzní budou náborováni během rutinní návštěvy kliniky, zatímco personálu bude nabídnuta účast na pravidelné poradě personálu. Proběhne soukromá konzultace, kde každý účastník obdrží v klidné atmosféře individuální ústní i písemné informace o projektu. Účastník může přivést kolemjdoucího a bude mu nabídnut čas na zvážení. Na požádání bude poskytnut extra rozhovor s opakovanou možností přivést přihlížejícího. Pokud se osoba chce projektu zúčastnit a splní kritéria pro zařazení, bude podepsán informovaný souhlas, vyplněn krátký dotazník a odebrány vzorky při pravidelné ambulantní návštěvě nebo po individuální domluvě.

Publikování výsledků Pozitivní i negativní výsledky budou publikovány v příslušných mezinárodních vědeckých časopisech a prezentovány na vědeckých setkáních a kongresech.

Etika výzkumu Mnoho pacientů, personálu a příbuzných bude požádáno, aby se účastnili této případové-kontrolní studie, strávili krátký čas navíc během schůzky na klinice a mohou pociťovat minimální nepohodlí během odběru vzorků. Naproti tomu informace o mikrobiomu u různých kožních onemocnění mohou poskytnout zcela nový pohled a vytvořit základ pro další studie k odhalení možné kauzality mezi mikrobiomem a zánětlivými kožními onemocněními. Případné malé nevýhody pro účastníky projektu lze tedy zdaleka ospravedlnit velkým množstvím získaných nových poznatků.