Munuaisensiirtotuloksen ennuste- ja validointitutkimus (TOPVAS)

Loppuvaiheen munuaissairauspotilaiden määrä kasvaa jatkuvasti ja munuaisensiirto on suositeltu hoitomuoto. Nykyaikainen immuunivastetta heikentävä hoito on vähentänyt akuuttien hylkimisjaksojen määrää ja lisännyt yhden vuoden allograftin eloonjäämisaikaa dramaattisesti. Siitä huolimatta 4 % allografteista katoaa ensimmäisen vuoden jälkeen vuosittain monitekijäisen prosessin vuoksi, ja jälkimmäinen määrä ei ole muuttunut vuosikymmeniin. Yksi tärkeimmistä tekijöistä pitkän aikavälin menestyksen määrittämisessä munuaisensiirron jälkeen on luovuttajaelimen laatu. Esimerkiksi iäkkäiden tai pidennettyjen luovuttajien elinten siirto johtaa allograftin ja potilaan eloonjäämisen vähenemiseen.

Aiemmassa työssään tutkijat keskittyivät erityisesti ikään liittyviin molekyylikirjoihin, mukaan lukien solusyklin estäjien CDKN2A (p16INK4a) ja CDKN1A (p21WAF1) telomeerien pituuteen ja mRNA:n ilmentymistasoihin, ja arvioivat nämä parametrit 54 potilaan implantaatiota edeltävissä biopsioissa. Lineaarisessa regressioanalyysissä CDKN2A osoittautui parhaaksi yksittäiseksi ennustajaksi seerumin kreatiniinille vuoden kuluttua, jota seurasi luovuttajan ikä ja telomeerien pituus. Usein lineaarinen regressioanalyysi paljasti, että CDKN2A-arvojen ja luovuttajan iän yhdistelmä tuotti vielä korkeampia ennustusarvoja. Toisessa tutkimuksessa tutkijat pystyivät osoittamaan vuorovaikutuksen luovuttajan iän ja kalsineuriinin estäjien käytön välillä munuaisensiirron jälkeisen tuloksen suhteen.

Näiden aikaisempien toimintojen aikana on kerätty laaja joukko koko genomin transkriptomiikan profiilitietoja nollatunnin biopsioista ja kliinisistä seurantatiedoista. TOPVAS-tutkimuksessa olemassa olevat tiedot, jotka on johdettu 72:sta edellä mainituista biopsiasarjasta (elävien luovuttajien siirteiden poissulkeminen), analysoidaan nykyaikaisilla bioinformatiikan/systeemibiologian työkaluilla yleisen (ei pelkästään ikään liittyvän) prognostisen biomarkkeripaneelin muodostamiseksi. toiminnallisen siirtotuloksen osalta kahden vuoden kuluttua siirrosta. Tätä merkkipaneelia käytetään myös sellaisten elinten määrittämiseen, jotka sopivat ensisijaisesti MMF/takrolimuusipohjaiseen immunosuppressioon. Molemmat paneelit validoidaan sitten niiden prognostisten ja ennustavien tietojen suhteen pitkän aikavälin tuloksista transplantaation jälkeen uudessa riippumattomassa potilaspopulaatiossa, jota hoidetaan takrolimuusilla ja MMF:llä. Biomarkkeriarvioinnin lisäksi ja pyrittäessä tunnistamaan vaihtoehtoisia ja/tai täydentäviä parametreja, joilla on ennustearvo, suoritetaan edistynyt morfologinen kudosbiopsiavärjäytysten tutkimus käyttämällä innovatiivista solujen elinkelpoisuuden värjäystekniikkaa ("BIOPSYCHRONOLOGY").