Pronostic non invasif des patients COVID-19 par l'utilisation de biomarqueurs dans le condensat d'haleine expirée (VTE-COVID-19)

Deux échantillons d'EBC seront prélevés sur chaque participant à l'étude ; un échantillon de base (à l'admission) et un échantillon à la sortie de l'hôpital ou au transfert à l'USI. De plus, des échantillons de sang seront prélevés afin d'étudier la physiopathologie du COVID-19 à l'aide d'une analyse métabolomique, ainsi que pour la normalisation et la validation des marqueurs putatifs de l'EBC.

Les enquêteurs recueilleront l'EBC des patients positifs au COVID-19 admis de manière aiguë à l'hôpital universitaire d'Aalborg en raison de symptômes du COVID-19 et compareront les profils de protéines et de métabolites chez les patients traités dans le service avec des patients transférés à l'USI pour mécanique ventilation. Le résultat principal (c'est-à-dire moyennes des quantités relatives de protéines spécifiques dans les échantillons d'EBC) seront comparées par des tests t non appariés après évaluation de la normalité et des écarts-types au sein des deux groupes dans la comparaison suivante : EBC collecté à l'admission (baseline) auprès de patients qui n'ont pas eu besoin ventilation mécanique vs EBC à l'admission chez les patients qui avaient besoin d'une ventilation mécanique. Des tests t appariés compareront les protéines dans les échantillons EBC de base et les échantillons lors du transfert à l'intubation en USI ou de la sortie à domicile afin de décrire la physiopathologie dans les deux groupes (pas de besoin en USI versus besoin d'admission en USI). Les enquêteurs ne recueilleront pas l'EBC des patients admis aux soins intensifs pour une assistance respiratoire en circuit ouvert, par ex. oxygénation à haut débit; ces patients seront invités à donner un échantillon d'EBC avant leur sortie, comme les patients qui n'ont pas eu besoin de soins aux soins intensifs.

Un échantillon de sang sera prélevé au cours des deux jours de collecte EBC (c'est-à-dire un tube de 9 ml prélevé avec des échantillons de sang de routine) des participants à l'étude à deux fins : 1) Standardisation des marqueurs putatifs et vérification et analyse complémentaire des les marqueurs EBC. Afin de qualifier les marqueurs et les substrats les plus appropriés pour la standardisation, l'analyse des échantillons EBC doit être terminée avant que les échantillons de sang puissent être analysés. L'analyse biochimique conventionnelle sera utilisée à cette fin. 2) Description physiopathologique des patients hospitalisés avec COVID-19 à l'aide d'analyses métabolomiques et protéomiques. Aucune analyse génétique ne sera effectuée sur les échantillons de sang conservés.

Après la collecte de l'EBC, les échantillons seront stockés directement dans le tube de collecte marqué avec l'identifiant du sujet de l'étude à -80⁰C. Les échantillons EBC seront utilisés uniquement pour l'analyse ultérieure de la composition protéique (c'est-à-dire protéomique) et des métabolites (c.-à-d. métabolomique).

La collecte d'EBC n'entraînera pas d'écarts par rapport aux procédures de diagnostic ou aux traitements standard. Les patients subiront des prélèvements sanguins de routine dans le cadre du bilan diagnostique et du suivi quotidien de la maladie. Les enquêteurs demanderont le consentement pour prélever un échantillon de sang supplémentaire de 9 ml avec les échantillons de sang de routine lors des deux jours de collecte EBC.