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Séquençage génomique de la COVID-19 pour les enquêtes sur les épidémies nosocomiales (NOSO-COVID)

29 juin 2023 mis à jour par: Centre hospitalier de l'Université de Montréal (CHUM)

Séquençage génomique du SRAS-CoV-2 à la demande au point de service pour soutenir les enquêtes sur les épidémies nosocomiales : une étude prospective d'épidémiologie moléculaire à Montréal

Il s'agit d'une étude d'épidémiologie moléculaire prospective en milieu hospitalier de soins tertiaires à Montréal, au Canada. Lorsque la transmission nosocomiale a été suspectée par les enquêtes des équipes locales de contrôle des infections, le séquençage génomique viral du SRAS-CoV-2 a été effectué localement pour tous les cas d'éclosion putatifs et les témoins contemporains. Les données d'épidémiologie moléculaire et conventionnelle ont été confrontées en temps réel pour améliorer la compréhension de la transmission du COVID-19 et renforcer ou adapter les mesures de prévention.

Aperçu de l'étude

Statut

Recrutement

Les conditions

Intervention / Traitement

Description détaillée

Cette étude inclura des travailleurs de la santé (TS) infectés et des patients pour lesquels une infection nosocomiale au CHUM est suspectée. Le laboratoire du CHUM est responsable des tests diagnostiques de la COVID-19 chez tous les travailleurs de la santé et patients admissibles. Après le diagnostic initial sur les tests PCR standard, les échantillons sont maintenus à -80. L'ARN viral est extrait et le séquençage de nouvelle génération du génome viral est effectué à l'aide de la plateforme de séquençage à lecture longue Nanopore. Les données préliminaires suggèrent que le SRAS-CoV-2 a une "horloge moléculaire" de 2 polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) par mois. L'analyse et la comparaison inter-isolats de ces SNP parmi des cas épidémiologiquement apparentés permettront d'étayer ou d'infirmer l'hypothèse d'une transmission nosocomiale de personne à personne. Tous les patients infectés seront appariés 1:1 avec des cas communautaires contemporains pour fournir un rétrocatalogue du génome viral et mieux contextualiser les analyses d'épidémiologie moléculaire. Les grappes moléculaires seront signalées aux équipes de prévention et de contrôle des infections et les interventions qui en résulteront seront surveillées.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Estimé)

150

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Coordonnées de l'étude

Sauvegarde des contacts de l'étude

Lieux d'étude

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

16 ans à 98 ans (Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

Oui

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Patients et travailleurs de la santé dans l'établissement pendant la période d'étude.

La description

Critère d'intégration:

  • Hospitalisé dans l'établissement pendant la période d'études
  • Travailleurs de la santé dans l'établissement pendant la période d'études

Critère d'exclusion:

  • Aucun

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Modèles d'observation: Cohorte
  • Perspectives temporelles: Éventuel

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Amélioration des mesures de contrôle des épidémies
Délai: Jusqu'à la fin des études, une moyenne de 2 ans
Résolution collaborative (équipes de contrôle des infections et d'épidémiologie moléculaire) des épidémies putatives. La transmission est soit réfutée, soit étayée par des analyses moléculaires. Les efforts d'enquête supplémentaires sont interrompus ou les mesures correctives nécessaires sont mises en œuvre.
Jusqu'à la fin des études, une moyenne de 2 ans

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Centre hospitalier de l'Université de Montréal (CHUM)

Collaborateurs

Canadian Institutes of Health Research (CIHR)
Fonds de la Recherche en Santé du Québec

Les enquêteurs

  • Chercheur principal: Simon Grandjean Lapierre, MD MSc FRCPC, Centre Hospitalier de l'Universite de Montreal (CHUM)

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

9 novembre 2020

Achèvement primaire (Estimé)

31 décembre 2023

Achèvement de l'étude (Estimé)

31 décembre 2023

Dates d'inscription aux études

Première soumission

2 juin 2022

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

7 juin 2022

Première publication (Réel)

9 juin 2022

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

3 juillet 2023

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

29 juin 2023

Dernière vérification

1 juin 2023

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Termes MeSH pertinents supplémentaires

Autres numéros d'identification d'étude

  • 20.270

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

OUI

Description du régime IPD

Les séquences génomiques virales de tous les participants doivent être déposées sur GenBank.

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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