GENESIS: biopsia genetica per la previsione degli intervalli di sorveglianza dopo la resezione endoscopica dei polipi del colon (GENESIS)

Il cancro del colon-retto è il secondo tumore più diffuso tra uomini e donne in Germania. La colonscopia di screening viene fornita a tutte le persone di età superiore ai 55 anni in Germania per rilevare e rimuovere lesioni precancerose (polipi) e quindi prevenire l'insorgenza di tumori del colon-retto. In base al risultato della colonscopia di screening e dell'esame istopatologico dei polipi rimossi, verrà pianificato il prossimo esame. Ma i cosiddetti carcinomi a intervalli sono stati osservati con un'incidenza crescente. Pertanto, sono fortemente necessari ulteriori strumenti e meccanismi, oltre ma oltre all'endoscopia e all'istopatologia, per ridurre tali carcinomi a intervalli e ottenere una migliore e più profonda comprensione delle alterazioni molecolari che si verificano nelle lesioni precancerose del colon e descrivere le popolazioni a rischio che potrebbero beneficiare di strategie di sorveglianza più brevi mediante colonscopia. Pertanto arruoleremo 100 pazienti, che sono stati sottoposti a colonscopia di screening con polipectomia. Ogni polipo, previsto per la rimozione endoscopica, può essere sottoposto a biopsia e conservato separatamente. In ogni caso, la diagnosi è assicurata. Per paziente sono previste un massimo di 6 biopsie (da 6 diversi polipi). Tutte le biopsie sono state conservate ed elaborate senza formalina in scatole speciali (PaxGene di Qiagen®). Dopo la microdissezione del tessuto del polipo e l'isolamento del DNA mirato al sequenziamento di nuova generazione di 38 geni (ACVR1B, DCC, MIER3, SLC9A9, AKT1, DMD, MLH1, SMAD2, APC, EP300, MSH2, SMAD4, ATM, ERBB2, MSH3, TCERG1, ATP6V0D2 , FBXW7, MSH6, TCF7L2, BAX, FZD3, MYO1B, TGFBR2, BRAF, GPC6, NRAS, TP53, CASP8, KRAS, PIK3CA, WBSCR17, CDC27, MAP2K4, PIK3R1, CTNNB1, MAP7, PTPN12) seguita da analisi di bioinformatica e biologia dei sistemi . I risultati del sequenziamento sono stati correlati ai risultati endoscopici e istopatologici. Parallelamente stiamo raccogliendo campioni di sangue EDTA per l'analisi del DNA libero circolante (cfDNA). Il sequenziamento mirato NGS di questi 38 geni dovrebbe essere eseguito anche a livello di cfDNA per studiare il potenziale delle biopsie liquide nelle lesioni colorettali precancerose.