- ICH GCP
- 미국 임상 시험 레지스트리
- 임상시험 NCT01192048
선천성 심장병의 유전학
선천성 심장병을 가진 개인 및 가족의 유전학 검사
연구 개요
상세 설명
선천성 심장병(CHD)은 선천적 결함의 가장 흔한 유형이지만 CHD의 병인은 거의 알려지지 않았습니다. 여러 유전적 접근법을 활용하여 증후군성 및 비증후군성 CHD 모두에 대한 유전적 원인이 발견되었습니다(Yasuhara and Garg, 2021). 이러한 유전적 원인의 대부분은 상염색체 우성 선천성 심장병이 있는 대가족을 연구하여 발견되었으며 제 연구실은 과거에 이 방법론을 성공적으로 사용했습니다(Garg, 2003; Garg 2005; Pan, 2009; Bennett, 2022). 이러한 위치 복제 접근 방식은 매우 강력하지만 다세대 혈통의 희귀한 특성으로 인해 제한되며 대규모 혈통의 생성을 허용하는 가벼운 형태의 CHD로 제한됩니다.
전통적으로 CHD의 유전적 원인을 확인하기 위해 사용되어 온 다른 방법은 유전적 이상(CHD 후보 유전자의 뉴클레오티드 서열 변이 또는 염색체 사본 수 변화에 대한) 산발적(비가족성) CHD 사례가 있는 많은 어린이 집단을 선별하는 것입니다. CHD-후보 유전자를 포함). 많은 수의 후보 유전자가 인간의 CHD에 잠재적으로 책임이 있는 것으로 연루되었기 때문에 이 작업은 지루했습니다(Choudhury and Garg, 2022). 이 접근법은 성공적이었지만(Schluterman, 2007; Maitra, 2010; Chang, 2013; Bonachea, 2014) 후보 유전자 목록에 국한되어 있습니다.
전체 엑솜 시퀀싱(WES)은 발현된 모든 유전자의 시퀀싱을 허용하는 차세대 시퀀싱 기술입니다. 우리 그룹은 다른 여러 그룹과 함께(LaHaye, 2016; Gordon, 2022) CHD 유전자 발견을 위해 WES 기술을 활용하고 있습니다. 우리 그룹은 CHD 유전자 발견을 위한 분석에서 모든 유전 물질(WES에서 시퀀싱되지 않은 게놈 영역 포함)의 시퀀싱을 허용하는 차세대 시퀀싱 기술인 전체 게놈 시퀀싱(WGS)을 활용하는 것으로 발전했습니다. 따라서 이러한 시퀀싱 방법은 편향되지 않은 방식으로 CHD의 유전적 원인을 식별하기 위해 다중 가족 및 산발적 사례의 코호트에 적용될 수 있습니다. 게놈 시퀀싱은 시퀀싱을 실행하고 데이터 파이프라인을 제어하는 직원의 기술 및 생물 정보학 능력에 따라 달라집니다. NCH(Nationwide Children's Hospital)의 유전체 의학 연구소는 기술적으로 숙련되어 있으며 자체적으로 강력한 데이터 파이프라인을 개발했습니다(Kelly, 2015). WGS는 단독으로 또는 다른 유형의 유전 분석과 함께 사용하여 이러한 조사의 수율을 높일 수 있는 강력한 유전 도구입니다.
연구 유형
등록 (추정된)
연락처 및 위치
연구 연락처
- 이름: Katherine M Spayde, MS, CGC
- 전화번호: 614-355-6388
- 이메일: katherine.spayde@nationwidechildrens.org
연구 장소
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Ohio
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Columbus, Ohio, 미국, 43205
- 모병
- Nationwide Children's Hospital
-
수석 연구원:
- Vidu Garg, MD
-
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
- 어린이
- 성인
- 고령자
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
- 피험자는 선천성 심장병 진단을 받았거나 선천성 심장병을 가진 개인과 관련이 있어야 합니다.
제외 기준:
- 선천성 심장병 환자와 관련이 없는 건강한 개인
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
|---|---|
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연구 주제
선천성 심장병이 있는 개인 및 선천성 심장병이 있거나 없는 가족 구성원.
모든 연구 참여자는 혈액 샘플 수집이 필요합니다.
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직접 시퀀싱, 마이크로어레이, 단일 뉴클레오티드 다형성, 전체 게놈 어레이 비교 게놈 하이브리드화 DNA 분석 및/또는 전체 엑솜 또는 게놈 시퀀싱을 위한 혈액 샘플 수집.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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선천성 심장 결함에 대한 새로운 유전 기여자의 식별
기간: 최대 3년, 유전자 분석 날짜부터 유전자 데이터 분석 완료 또는 새로운 유전 기여자의 식별 중 먼저 도래하는 날짜까지
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인간의 선천성 심장 결함과 관련이 있는 것으로 밝혀진 새로운 유전적 이상
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최대 3년, 유전자 분석 날짜부터 유전자 데이터 분석 완료 또는 새로운 유전 기여자의 식별 중 먼저 도래하는 날짜까지
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공동 작업자 및 조사자
수사관
- 수석 연구원: Vidu Garg, MD, Nationwide Children's Hospital
간행물 및 유용한 링크
일반 간행물
- Yasuhara J, Garg V. Genetics of congenital heart disease: a narrative review of recent advances and clinical implications. Transl Pediatr. 2021 Sep;10(9):2366-2386. doi: 10.21037/tp-21-297.
- Choudhury TZ, Garg V. Molecular genetic mechanisms of congenital heart disease. Curr Opin Genet Dev. 2022 Aug;75:101949. doi: 10.1016/j.gde.2022.101949. Epub 2022 Jul 8.
- Pan H, Richards AA, Zhu X, Joglar JA, Yin HL, Garg V. A novel mutation in LAMIN A/C is associated with isolated early-onset atrial fibrillation and progressive atrioventricular block followed by cardiomyopathy and sudden cardiac death. Heart Rhythm. 2009 May;6(5):707-10. doi: 10.1016/j.hrthm.2009.01.037. Epub 2009 Feb 4. No abstract available.
- Maitra M, Koenig SN, Srivastava D, Garg V. Identification of GATA6 sequence variants in patients with congenital heart defects. Pediatr Res. 2010 Oct;68(4):281-5. doi: 10.1203/PDR.0b013e3181ed17e4.
- Schluterman MK, Krysiak AE, Kathiriya IS, Abate N, Chandalia M, Srivastava D, Garg V. Screening and biochemical analysis of GATA4 sequence variations identified in patients with congenital heart disease. Am J Med Genet A. 2007 Apr 15;143A(8):817-23. doi: 10.1002/ajmg.a.31652.
- Garg V, Muth AN, Ransom JF, Schluterman MK, Barnes R, King IN, Grossfeld PD, Srivastava D. Mutations in NOTCH1 cause aortic valve disease. Nature. 2005 Sep 8;437(7056):270-4. doi: 10.1038/nature03940. Epub 2005 Jul 17.
- Garg V, Kathiriya IS, Barnes R, Schluterman MK, King IN, Butler CA, Rothrock CR, Eapen RS, Hirayama-Yamada K, Joo K, Matsuoka R, Cohen JC, Srivastava D. GATA4 mutations cause human congenital heart defects and reveal an interaction with TBX5. Nature. 2003 Jul 24;424(6947):443-7. doi: 10.1038/nature01827. Epub 2003 Jul 6.
- Bonachea EM, Chang SW, Zender G, LaHaye S, Fitzgerald-Butt S, McBride KL, Garg V. Rare GATA5 sequence variants identified in individuals with bicuspid aortic valve. Pediatr Res. 2014 Aug;76(2):211-6. doi: 10.1038/pr.2014.67. Epub 2014 May 5.
- Bonachea EM, Zender G, White P, Corsmeier D, Newsom D, Fitzgerald-Butt S, Garg V, McBride KL. Use of a targeted, combinatorial next-generation sequencing approach for the study of bicuspid aortic valve. BMC Med Genomics. 2014 Sep 26;7:56. doi: 10.1186/1755-8794-7-56.
- LaHaye S, Corsmeier D, Basu M, Bowman JL, Fitzgerald-Butt S, Zender G, Bosse K, McBride KL, White P, Garg V. Utilization of Whole Exome Sequencing to Identify Causative Mutations in Familial Congenital Heart Disease. Circ Cardiovasc Genet. 2016 Aug;9(4):320-9. doi: 10.1161/CIRCGENETICS.115.001324. Epub 2016 Jul 14.
- Bennett JS, Gordon DM, Majumdar U, Lawrence PJ, Matos-Nieves A, Myers K, Kamp AN, Leonard JC, McBride KL, White P, Garg V. Use of machine learning to classify high-risk variants of uncertain significance in lamin A/C cardiac disease. Heart Rhythm. 2022 Apr;19(4):676-685. doi: 10.1016/j.hrthm.2021.12.019. Epub 2021 Dec 24.
- Chang SW, Mislankar M, Misra C, Huang N, Dajusta DG, Harrison SM, McBride KL, Baker LA, Garg V. Genetic abnormalities in FOXP1 are associated with congenital heart defects. Hum Mutat. 2013 Sep;34(9):1226-30. doi: 10.1002/humu.22366. Epub 2013 Jul 11.
- Gordon DM, Cunningham D, Zender G, Lawrence PJ, Penaloza JS, Lin H, Fitzgerald-Butt SM, Myers K, Duong T, Corsmeier DJ, Gaither JB, Kuck HC, Wijeratne S, Moreland B, Kelly BJ; Baylor-Johns Hopkins Center for Mendelian Genomics; Garg V, White P, McBride KL. Exome sequencing in multiplex families with left-sided cardiac defects has high yield for disease gene discovery. PLoS Genet. 2022 Jun 23;18(6):e1010236. doi: 10.1371/journal.pgen.1010236. eCollection 2022 Jun.
- Manivannan SN, Darouich S, Masmoudi A, Gordon D, Zender G, Han Z, Fitzgerald-Butt S, White P, McBride KL, Kharrat M, Garg V. Novel frameshift variant in MYL2 reveals molecular differences between dominant and recessive forms of hypertrophic cardiomyopathy. PLoS Genet. 2020 May 26;16(5):e1008639. doi: 10.1371/journal.pgen.1008639. eCollection 2020 May.
- Yasuhara J, Bigelow AM, Garg V. Genetics of Congenital Heart Disease. Clin Perinatol. 2025 Sep;52(3):589-608. doi: 10.1016/j.clp.2025.06.010. Epub 2025 Jul 15.
- Yasuhara J, Manivannan SN, Majumdar U, Gordon DM, Lawrence PJ, Aljuhani M, Myers K, Stiver C, Bigelow AM, Galantowicz M, Yamagishi H, McBride KL, White P, Garg V. Novel pathogenic GATA6 variant associated with congenital heart disease, diabetes mellitus and necrotizing enterocolitis. Pediatr Res. 2024 Jan;95(1):146-155. doi: 10.1038/s41390-023-02811-y. Epub 2023 Sep 12.
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기타 연구 ID 번호
- IRB09-00339
- R01HL109758 (미국 NIH 보조금/계약)
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