- ICH GCP
- Registro degli studi clinici negli Stati Uniti
- Sperimentazione clinica NCT01192048
Genetica delle cardiopatie congenite
Test genetici di individui e famiglie con cardiopatia congenita
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
La cardiopatia congenita (CHD) è il tipo più comune di difetto congenito, ma l'eziologia della CHD rimane in gran parte sconosciuta. Sono state scoperte cause genetiche per la CHD sia sindromica che non sindromica utilizzando diversi approcci genetici (Yasuhara e Garg, 2021). La maggior parte di queste cause genetiche è stata trovata studiando famiglie numerose con cardiopatia congenita autosomica dominante e il mio laboratorio ha utilizzato con successo questa metodologia in passato (Garg, 2003; Garg 2005; Pan, 2009; Bennett, 2022). Sebbene questi approcci di clonazione posizionale siano molto potenti, sono limitati dalla natura rara dei pedigree multigenerazionali e sono limitati a forme più lievi di CHD che hanno consentito la generazione di grandi parenti.
L'altro metodo che è stato tradizionalmente utilizzato per identificare le cause genetiche di CHD è lo screening di grandi popolazioni di bambini con casi sporadici (non familiari) di CHD per anomalie genetiche (variazioni della sequenza nucleotidica nei geni candidati per CHD o per variazioni del numero di copie cromosomiche che coinvolgono i geni candidati CHD). Questo lavoro è stato noioso poiché un gran numero di geni candidati è stato implicato come potenzialmente responsabile della CHD negli esseri umani (Choudhury e Garg, 2022). Sebbene questo approccio abbia avuto successo (Schluterman, 2007; Maitra, 2010; Chang, 2013; Bonachea, 2014), è anche limitato agli elenchi di geni candidati.
Il sequenziamento dell'intero esoma (WES) è una tecnologia di sequenziamento di nuova generazione che consente il sequenziamento di tutti i geni espressi. Il nostro gruppo, oltre a molti altri (LaHaye, 2016; Gordon, 2022), ha utilizzato la tecnologia WES per la scoperta del gene CHD. Il nostro gruppo è passato all'utilizzo del sequenziamento dell'intero genoma (WGS), una tecnologia di sequenziamento di nuova generazione che consente il sequenziamento di tutto il materiale genetico (comprese le regioni genomiche che non sono sequenziate in WES), nella nostra analisi per la scoperta del gene CHD. Pertanto, questi metodi di sequenziamento possono essere applicati a famiglie multiplex e coorti di casi sporadici per identificare le cause genetiche di CHD in modo imparziale. Il sequenziamento genomico dipende dall'abilità tecnica e bioinformatica del personale che esegue il sequenziamento e controlla la pipeline dei dati. L'Institute of Genomic Medicine presso il Nationwide Children's Hospital (NCH) è tecnicamente qualificato e ha sviluppato la propria potente pipeline di dati (Kelly, 2015). WGS è un potente strumento genetico che può essere utilizzato in isolamento o in combinazione con altri tipi di analisi genetica per aumentare la resa di queste indagini.
Tipo di studio
Iscrizione (Stimato)
Contatti e Sedi
Contatto studio
- Nome: Katherine M Spayde, MS, CGC
- Numero di telefono: 614-355-6388
- Email: katherine.spayde@nationwidechildrens.org
Luoghi di studio
-
-
Ohio
-
Columbus, Ohio, Stati Uniti, 43205
- Reclutamento
- Nationwide Children's Hospital
-
Investigatore principale:
- Vidu Garg, MD
-
-
Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
- Bambino
- Adulto
- Adulto più anziano
Accetta volontari sani
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- I soggetti devono avere una diagnosi di cardiopatia congenita o essere imparentati con individui con cardiopatia congenita.
Criteri di esclusione:
- Individui sani non imparentati con quelli con cardiopatia congenita
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
|---|---|
|
Materie di studio
Individui con cardiopatia congenita e familiari con o senza cardiopatia congenita.
Sarà richiesta una raccolta di campioni di sangue per tutti i partecipanti allo studio.
|
Raccolta di campioni di sangue per sequenziamento diretto, microarray, polimorfismo a singolo nucleotide, analisi del DNA di ibridazione genomica comparativa dell'array dell'intero genoma e/o sequenziamento dell'intero esoma o del genoma.
|
Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
|
Identificazione di nuovi contributori genetici ai difetti cardiaci congeniti
Lasso di tempo: fino a 3 anni, dalla data dell'analisi genetica al completamento dell'analisi dei dati genetici o all'identificazione di nuovi contributori genetici, a seconda dell'evento che si verifica per primo
|
Nuove anomalie genetiche che risultano essere associate a difetti cardiaci congeniti nell'uomo
|
fino a 3 anni, dalla data dell'analisi genetica al completamento dell'analisi dei dati genetici o all'identificazione di nuovi contributori genetici, a seconda dell'evento che si verifica per primo
|
Collaboratori e investigatori
Sponsor
Collaboratori
Investigatori
- Investigatore principale: Vidu Garg, MD, Nationwide Children's Hospital
Pubblicazioni e link utili
Pubblicazioni generali
- Yasuhara J, Garg V. Genetics of congenital heart disease: a narrative review of recent advances and clinical implications. Transl Pediatr. 2021 Sep;10(9):2366-2386. doi: 10.21037/tp-21-297.
- Choudhury TZ, Garg V. Molecular genetic mechanisms of congenital heart disease. Curr Opin Genet Dev. 2022 Aug;75:101949. doi: 10.1016/j.gde.2022.101949. Epub 2022 Jul 8.
- Pan H, Richards AA, Zhu X, Joglar JA, Yin HL, Garg V. A novel mutation in LAMIN A/C is associated with isolated early-onset atrial fibrillation and progressive atrioventricular block followed by cardiomyopathy and sudden cardiac death. Heart Rhythm. 2009 May;6(5):707-10. doi: 10.1016/j.hrthm.2009.01.037. Epub 2009 Feb 4. No abstract available.
- Maitra M, Koenig SN, Srivastava D, Garg V. Identification of GATA6 sequence variants in patients with congenital heart defects. Pediatr Res. 2010 Oct;68(4):281-5. doi: 10.1203/PDR.0b013e3181ed17e4.
- Schluterman MK, Krysiak AE, Kathiriya IS, Abate N, Chandalia M, Srivastava D, Garg V. Screening and biochemical analysis of GATA4 sequence variations identified in patients with congenital heart disease. Am J Med Genet A. 2007 Apr 15;143A(8):817-23. doi: 10.1002/ajmg.a.31652.
- Garg V, Muth AN, Ransom JF, Schluterman MK, Barnes R, King IN, Grossfeld PD, Srivastava D. Mutations in NOTCH1 cause aortic valve disease. Nature. 2005 Sep 8;437(7056):270-4. doi: 10.1038/nature03940. Epub 2005 Jul 17.
- Garg V, Kathiriya IS, Barnes R, Schluterman MK, King IN, Butler CA, Rothrock CR, Eapen RS, Hirayama-Yamada K, Joo K, Matsuoka R, Cohen JC, Srivastava D. GATA4 mutations cause human congenital heart defects and reveal an interaction with TBX5. Nature. 2003 Jul 24;424(6947):443-7. doi: 10.1038/nature01827. Epub 2003 Jul 6.
- Bonachea EM, Chang SW, Zender G, LaHaye S, Fitzgerald-Butt S, McBride KL, Garg V. Rare GATA5 sequence variants identified in individuals with bicuspid aortic valve. Pediatr Res. 2014 Aug;76(2):211-6. doi: 10.1038/pr.2014.67. Epub 2014 May 5.
- Bonachea EM, Zender G, White P, Corsmeier D, Newsom D, Fitzgerald-Butt S, Garg V, McBride KL. Use of a targeted, combinatorial next-generation sequencing approach for the study of bicuspid aortic valve. BMC Med Genomics. 2014 Sep 26;7:56. doi: 10.1186/1755-8794-7-56.
- LaHaye S, Corsmeier D, Basu M, Bowman JL, Fitzgerald-Butt S, Zender G, Bosse K, McBride KL, White P, Garg V. Utilization of Whole Exome Sequencing to Identify Causative Mutations in Familial Congenital Heart Disease. Circ Cardiovasc Genet. 2016 Aug;9(4):320-9. doi: 10.1161/CIRCGENETICS.115.001324. Epub 2016 Jul 14.
- Bennett JS, Gordon DM, Majumdar U, Lawrence PJ, Matos-Nieves A, Myers K, Kamp AN, Leonard JC, McBride KL, White P, Garg V. Use of machine learning to classify high-risk variants of uncertain significance in lamin A/C cardiac disease. Heart Rhythm. 2022 Apr;19(4):676-685. doi: 10.1016/j.hrthm.2021.12.019. Epub 2021 Dec 24.
- Chang SW, Mislankar M, Misra C, Huang N, Dajusta DG, Harrison SM, McBride KL, Baker LA, Garg V. Genetic abnormalities in FOXP1 are associated with congenital heart defects. Hum Mutat. 2013 Sep;34(9):1226-30. doi: 10.1002/humu.22366. Epub 2013 Jul 11.
- Gordon DM, Cunningham D, Zender G, Lawrence PJ, Penaloza JS, Lin H, Fitzgerald-Butt SM, Myers K, Duong T, Corsmeier DJ, Gaither JB, Kuck HC, Wijeratne S, Moreland B, Kelly BJ; Baylor-Johns Hopkins Center for Mendelian Genomics; Garg V, White P, McBride KL. Exome sequencing in multiplex families with left-sided cardiac defects has high yield for disease gene discovery. PLoS Genet. 2022 Jun 23;18(6):e1010236. doi: 10.1371/journal.pgen.1010236. eCollection 2022 Jun.
- Manivannan SN, Darouich S, Masmoudi A, Gordon D, Zender G, Han Z, Fitzgerald-Butt S, White P, McBride KL, Kharrat M, Garg V. Novel frameshift variant in MYL2 reveals molecular differences between dominant and recessive forms of hypertrophic cardiomyopathy. PLoS Genet. 2020 May 26;16(5):e1008639. doi: 10.1371/journal.pgen.1008639. eCollection 2020 May.
- Yasuhara J, Bigelow AM, Garg V. Genetics of Congenital Heart Disease. Clin Perinatol. 2025 Sep;52(3):589-608. doi: 10.1016/j.clp.2025.06.010. Epub 2025 Jul 15.
- Yasuhara J, Manivannan SN, Majumdar U, Gordon DM, Lawrence PJ, Aljuhani M, Myers K, Stiver C, Bigelow AM, Galantowicz M, Yamagishi H, McBride KL, White P, Garg V. Novel pathogenic GATA6 variant associated with congenital heart disease, diabetes mellitus and necrotizing enterocolitis. Pediatr Res. 2024 Jan;95(1):146-155. doi: 10.1038/s41390-023-02811-y. Epub 2023 Sep 12.
Studiare le date dei record
Studia le date principali
Inizio studio
Completamento primario (Stimato)
Completamento dello studio (Stimato)
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Stimato)
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
- genetica
- DNA
- Cardiopatia congenita
- polimorfismo a singolo nucleotide
- gene
- sequenziamento dell'intero esoma
- sequenziamento dell'intero genoma
- difetto di nascita
- microarray
- sequenziamento dell'esoma
- sequenza diretta
- ibridazione genomica comparativa dell'array dell'intero genoma
- cambiamento del numero di copie cromosomiche
- variazione della sequenza nucleotidica
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
- IRB09-00339
- R01HL109758 (Sovvenzione/contratto NIH degli Stati Uniti)
Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .
Prove cliniche su Cardiopatia congenita
-
Region SkaneIscrizione su invitoInsufficienza cardiaca Classe II della New York Heart Association (NYHA). | Insufficienza cardiaca Classe III della New York Heart Association (NYHA).Svezia
-
Yonsei UniversityReclutamentoIschemic Heart Disease | Cardiopatia Non IschemicaCorea del Sud
-
Medical University of BialystokMedical University of Lodz; Poznan University of Medical Sciences; Nicolaus Copernicus... e altri collaboratoriTerminatoInsufficienza cardiaca, sistolica | Insufficienza cardiaca con frazione di eiezione ridotta | Scompenso cardiaco Classe IV della New York Heart Association | Scompenso cardiaco Classe III della New York Heart AssociationPolonia
-
University of WashingtonAmerican Heart AssociationCompletatoInsufficienza cardiaca, congestizia | Alterazione mitocondriale | Scompenso cardiaco Classe IV della New York Heart AssociationStati Uniti
-
Portuguese Association of Interventional CardiologyMedtronicReclutamentoStenosi Aortica Sintomatica Grave (Definita come Classe New York Heart Association (NYHA) ≥ II)Portogallo
Prove cliniche su Raccolta di campioni di sangue
-
Hillel Yaffe Medical CenterSconosciuto
-
Acorai ABCompletatoArresto cardiacoStati Uniti, Svezia, Regno Unito, Canada, Danimarca, Belgio
-
CHU de ReimsReclutamentoSindrome da antifosfolipidiFrancia
-
The Hong Kong Polytechnic UniversityLogistics and Supply Chain MultiTech R&D Centre, Hong KongReclutamentoSoggetti maschi e femmine saniHong Kong
-
Centre Hospitalier Universitaire de NiceReclutamentoMalattia di AlzheimerFrancia
-
IgenomixNon ancora reclutamento
-
Haydarpasa Numune Training and Research HospitalCompletatoDisturbo della coagulazioneTacchino
-
University Hospital, RouenReclutamentoEpatite B | Epatite C | AIDSFrancia
-
Memorial Sloan Kettering Cancer CenterCompletatoCancro alla prostataStati Uniti
-
Cliniques universitaires Saint-Luc- Université...Université de LiègeReclutamentoFibrosi cistica | BiomarcatoriBelgio