- ICH GCP
- Registr klinických studií v USA
- Klinická studie NCT01192048
Genetika vrozených srdečních chorob
Genetické testování jedinců a rodin s vrozenou srdeční chorobou
Přehled studie
Detailní popis
Vrozená srdeční vada (CHD) je nejčastějším typem vrozené vady, ale etiologie ICHS zůstává do značné míry neznámá. Genetické příčiny byly objeveny pro syndromickou i nesyndromovou ICHS pomocí několika genetických přístupů (Yasuhara a Garg, 2021). Většina těchto genetických příčin byla zjištěna studiem velkých rodin s autozomálně dominantním vrozeným srdečním onemocněním a moje laboratoř tuto metodologii v minulosti úspěšně používala (Garg, 2003; Garg 2005; Pan, 2009; Bennett, 2022). Ačkoli jsou tyto přístupy pozičního klonování velmi účinné, jsou omezeny vzácnou povahou vícegeneračních rodokmenů a jsou omezeny na mírnější formy CHD, které umožnily generování velkých příbuzných.
Další metodou, která se tradičně používá k identifikaci genetických příčin ICHS, je screening velkých populací dětí se sporadickými (nefamiliárními) případy ICHS na genetické abnormality (variace nukleotidové sekvence v kandidátských genech pro ICHS nebo změny počtu chromozomálních kopií které zahrnují CHD-kandidátské geny). Tato práce byla únavná, protože velký počet kandidátních genů byl implikován jako potenciálně odpovědné za CHD u lidí (Choudhury a Garg, 2022). Ačkoli byl tento přístup úspěšný (Schluterman, 2007; Maitra, 2010; Chang, 2013; Bonachea, 2014), je také omezen na seznamy kandidátních genů.
Celé exomové sekvenování (WES) je sekvenační technologie nové generace, která umožňuje sekvenování všech exprimovaných genů. Naše skupina, kromě několika dalších (LaHaye, 2016; Gordon, 2022), využívá technologii WES pro objev genu CHD. Naše skupina pokročila k využití sekvenování celého genomu (WGS), sekvenační technologii nové generace, která umožňuje sekvenování veškerého genetického materiálu (včetně genomových oblastí, které nejsou sekvenovány ve WES), v naší analýze pro objev CHD genu. Proto mohou být tyto sekvenační metody aplikovány na multiplexní rodiny a kohorty sporadických případů k identifikaci genetických příčin CHD nezaujatým způsobem. Genomické sekvenování je závislé na technické a bioinformatické zdatnosti personálu provádějícího sekvenování a řízení datového potrubí. Institut genomické medicíny v Nationwide Children's Hospital (NCH) je technicky zdatný a vyvinul vlastní výkonný datový kanál (Kelly, 2015). WGS je mocný genetický nástroj, který lze použít samostatně nebo ve spojení s jinými typy genetické analýzy ke zvýšení výtěžnosti těchto výzkumů.
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
- Jméno: Katherine M Spayde, MS, CGC
- Telefonní číslo: 614-355-6388
- E-mail: katherine.spayde@nationwidechildrens.org
Studijní místa
-
-
Ohio
-
Columbus, Ohio, Spojené státy, 43205
- Nábor
- Nationwide Children's Hospital
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Vidu Garg, MD
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dítě
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Subjekty musí mít diagnózu vrozené srdeční choroby nebo být ve spojení s jedinci s vrozenou srdeční chorobou.
Kritéria vyloučení:
- Zdraví jedinci nesouvisející s těmi s vrozenou srdeční chorobou
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Studijní předměty
Jedinci s vrozenou srdeční chorobou a rodinní příslušníci s nebo bez vrozené srdeční choroby.
Odběr vzorku krve bude vyžadován pro všechny účastníky studie.
|
Odběr vzorků krve pro přímé sekvenování, microarray, jednonukleotidový polymorfismus, srovnávací genomové hybridizační analýzy DNA s celogenomovým polem a/nebo sekvenování celého exomu nebo genomu.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Identifikace nových genetických přispěvatelů k vrozeným srdečním vadám
Časové okno: až 3 roky, od data genetické analýzy do dokončení analýzy genetických dat nebo identifikace nových genetických přispěvatelů, podle toho, co nastane dříve
|
Nové genetické abnormality, u kterých bylo zjištěno, že jsou spojeny s vrozenými srdečními vadami u lidí
|
až 3 roky, od data genetické analýzy do dokončení analýzy genetických dat nebo identifikace nových genetických přispěvatelů, podle toho, co nastane dříve
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Spolupracovníci
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Vidu Garg, MD, Nationwide Children's Hospital
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- Yasuhara J, Garg V. Genetics of congenital heart disease: a narrative review of recent advances and clinical implications. Transl Pediatr. 2021 Sep;10(9):2366-2386. doi: 10.21037/tp-21-297.
- Choudhury TZ, Garg V. Molecular genetic mechanisms of congenital heart disease. Curr Opin Genet Dev. 2022 Aug;75:101949. doi: 10.1016/j.gde.2022.101949. Epub 2022 Jul 8.
- Pan H, Richards AA, Zhu X, Joglar JA, Yin HL, Garg V. A novel mutation in LAMIN A/C is associated with isolated early-onset atrial fibrillation and progressive atrioventricular block followed by cardiomyopathy and sudden cardiac death. Heart Rhythm. 2009 May;6(5):707-10. doi: 10.1016/j.hrthm.2009.01.037. Epub 2009 Feb 4. No abstract available.
- Maitra M, Koenig SN, Srivastava D, Garg V. Identification of GATA6 sequence variants in patients with congenital heart defects. Pediatr Res. 2010 Oct;68(4):281-5. doi: 10.1203/PDR.0b013e3181ed17e4.
- Schluterman MK, Krysiak AE, Kathiriya IS, Abate N, Chandalia M, Srivastava D, Garg V. Screening and biochemical analysis of GATA4 sequence variations identified in patients with congenital heart disease. Am J Med Genet A. 2007 Apr 15;143A(8):817-23. doi: 10.1002/ajmg.a.31652.
- Garg V, Muth AN, Ransom JF, Schluterman MK, Barnes R, King IN, Grossfeld PD, Srivastava D. Mutations in NOTCH1 cause aortic valve disease. Nature. 2005 Sep 8;437(7056):270-4. doi: 10.1038/nature03940. Epub 2005 Jul 17.
- Garg V, Kathiriya IS, Barnes R, Schluterman MK, King IN, Butler CA, Rothrock CR, Eapen RS, Hirayama-Yamada K, Joo K, Matsuoka R, Cohen JC, Srivastava D. GATA4 mutations cause human congenital heart defects and reveal an interaction with TBX5. Nature. 2003 Jul 24;424(6947):443-7. doi: 10.1038/nature01827. Epub 2003 Jul 6.
- Bonachea EM, Chang SW, Zender G, LaHaye S, Fitzgerald-Butt S, McBride KL, Garg V. Rare GATA5 sequence variants identified in individuals with bicuspid aortic valve. Pediatr Res. 2014 Aug;76(2):211-6. doi: 10.1038/pr.2014.67. Epub 2014 May 5.
- Bonachea EM, Zender G, White P, Corsmeier D, Newsom D, Fitzgerald-Butt S, Garg V, McBride KL. Use of a targeted, combinatorial next-generation sequencing approach for the study of bicuspid aortic valve. BMC Med Genomics. 2014 Sep 26;7:56. doi: 10.1186/1755-8794-7-56.
- LaHaye S, Corsmeier D, Basu M, Bowman JL, Fitzgerald-Butt S, Zender G, Bosse K, McBride KL, White P, Garg V. Utilization of Whole Exome Sequencing to Identify Causative Mutations in Familial Congenital Heart Disease. Circ Cardiovasc Genet. 2016 Aug;9(4):320-9. doi: 10.1161/CIRCGENETICS.115.001324. Epub 2016 Jul 14.
- Bennett JS, Gordon DM, Majumdar U, Lawrence PJ, Matos-Nieves A, Myers K, Kamp AN, Leonard JC, McBride KL, White P, Garg V. Use of machine learning to classify high-risk variants of uncertain significance in lamin A/C cardiac disease. Heart Rhythm. 2022 Apr;19(4):676-685. doi: 10.1016/j.hrthm.2021.12.019. Epub 2021 Dec 24.
- Chang SW, Mislankar M, Misra C, Huang N, Dajusta DG, Harrison SM, McBride KL, Baker LA, Garg V. Genetic abnormalities in FOXP1 are associated with congenital heart defects. Hum Mutat. 2013 Sep;34(9):1226-30. doi: 10.1002/humu.22366. Epub 2013 Jul 11.
- Gordon DM, Cunningham D, Zender G, Lawrence PJ, Penaloza JS, Lin H, Fitzgerald-Butt SM, Myers K, Duong T, Corsmeier DJ, Gaither JB, Kuck HC, Wijeratne S, Moreland B, Kelly BJ; Baylor-Johns Hopkins Center for Mendelian Genomics; Garg V, White P, McBride KL. Exome sequencing in multiplex families with left-sided cardiac defects has high yield for disease gene discovery. PLoS Genet. 2022 Jun 23;18(6):e1010236. doi: 10.1371/journal.pgen.1010236. eCollection 2022 Jun.
- Manivannan SN, Darouich S, Masmoudi A, Gordon D, Zender G, Han Z, Fitzgerald-Butt S, White P, McBride KL, Kharrat M, Garg V. Novel frameshift variant in MYL2 reveals molecular differences between dominant and recessive forms of hypertrophic cardiomyopathy. PLoS Genet. 2020 May 26;16(5):e1008639. doi: 10.1371/journal.pgen.1008639. eCollection 2020 May.
- Yasuhara J, Bigelow AM, Garg V. Genetics of Congenital Heart Disease. Clin Perinatol. 2025 Sep;52(3):589-608. doi: 10.1016/j.clp.2025.06.010. Epub 2025 Jul 15.
- Yasuhara J, Manivannan SN, Majumdar U, Gordon DM, Lawrence PJ, Aljuhani M, Myers K, Stiver C, Bigelow AM, Galantowicz M, Yamagishi H, McBride KL, White P, Garg V. Novel pathogenic GATA6 variant associated with congenital heart disease, diabetes mellitus and necrotizing enterocolitis. Pediatr Res. 2024 Jan;95(1):146-155. doi: 10.1038/s41390-023-02811-y. Epub 2023 Sep 12.
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia
Primární dokončení (Odhadovaný)
Dokončení studie (Odhadovaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Odhadovaný)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- IRB09-00339
- R01HL109758 (Grant/smlouva NIH USA)
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Vrozená srdeční choroba
-
Region SkaneZápis na pozvánkuSrdeční selhání New York Heart Association (NYHA) třída II | Srdeční selhání New York Heart Association (NYHA) třída IIIŠvédsko
-
Medical University of BialystokMedical University of Lodz; Poznan University of Medical Sciences; Nicolaus Copernicus... a další spolupracovníciUkončenoSrdeční selhání, systolické | Srdeční Selhání Se Sníženou Ejekční frakcí | Srdeční selhání New York Heart Association Třída IV | Srdeční selhání New York Heart Association Třída IIIPolsko
-
Novartis PharmaceuticalsDokončenoPacienti, kteří úspěšně dokončili 12měsíční léčebné období základní studie (de Novo Heart Recipients), kteří měli zájem o léčbu EC-MPS
-
University of WashingtonAmerican Heart AssociationDokončenoSrdeční selhání, městnavé | Mitochondriální alterace | Srdeční selhání New York Heart Association Třída IVSpojené státy
-
Portuguese Association of Interventional CardiologyMedtronicNáborTěžká symptomatická aortální stenóza (definována jako třída New York Heart Association (NYHA) ≥ II)Portugalsko
-
QLT Inc.DokončenoLCA (Leber Congenital Amaurosis) | RP (Retinitis Pigmentosa)Spojené státy, Kanada, Německo, Holandsko, Spojené království
-
QLT Inc.DokončenoLCA (Leber Congenital Amaurosis) | RP (Retinitis Pigmentosa)Kanada, Spojené státy, Německo, Holandsko, Spojené království
Klinické studie na Odběr vzorku krve
-
Hillel Yaffe Medical CenterNeznámý
-
Assistance Publique - Hôpitaux de ParisZatím nenabíráme
-
Acorai ABDokončenoSrdeční selháníSpojené státy, Švédsko, Spojené království, Kanada, Dánsko, Belgie
-
Northwell HealthBecton, Dickinson and CompanyNábor
-
National Marrow Donor ProgramDokončenoLymfom | Myelodysplastické syndromy | LeukémieSpojené státy
-
Cliniques universitaires Saint-Luc- Université...Université de LiègeNáborCystická fibróza | BiomarkeryBelgie
-
Indiana UniversityUkončenoDiabetes Mellitus | Bakteriální infekce | Rána | Infikovaný vřed kůžeSpojené státy
-
IdentigeneCRI Lifetree Clinical ResearchNeznámý
-
University of MinnesotaNational Institute on Drug Abuse (NIDA)DokončenoPorucha užívání látkySpojené státy
-
M.D. Anderson Cancer CenterDokončenoRakovina prsuSpojené státy