- ICH GCP
- Register voor klinische proeven in de VS.
- Klinische proef NCT01192048
Genetica van aangeboren hartaandoeningen
Genetisch testen van individuen en gezinnen met aangeboren hartaandoeningen
Studie Overzicht
Toestand
Conditie
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
Congenitale hartziekte (CHD) is het meest voorkomende type aangeboren afwijking, maar de etiologie van CHD is nog grotendeels onbekend. Genetische oorzaken zijn ontdekt voor zowel syndromale als niet-syndromale CHZ met behulp van verschillende genetische benaderingen (Yasuhara en Garg, 2021). De meeste van deze genetische oorzaken zijn gevonden door het bestuderen van grote families met autosomaal dominante aangeboren hartaandoeningen en mijn laboratorium heeft deze methodologie in het verleden met succes toegepast (Garg, 2003; Garg 2005; Pan, 2009; Bennett, 2022). Hoewel deze positionele kloneringsbenaderingen zeer krachtig zijn, worden ze beperkt door de zeldzame aard van stambomen van meerdere generaties en zijn ze beperkt tot mildere vormen van CHD die het mogelijk hebben gemaakt om grote verwanten te genereren.
De andere methode die van oudsher wordt gebruikt om genetische oorzaken van CHZ te identificeren, is het screenen van grote populaties kinderen met sporadische (niet-familiale) gevallen van CHZ op genetische afwijkingen (variaties in nucleotidesequenties in kandidaatgenen voor CHD of op veranderingen in het aantal chromosomale kopieën). waarbij CHD-kandidaatgenen betrokken zijn). Dit werk was vervelend omdat een groot aantal kandidaat-genen is betrokken als mogelijk verantwoordelijk voor CHD bij mensen (Choudhury en Garg, 2022). Hoewel deze benadering succesvol is geweest (Schluterman, 2007; Maitra, 2010; Chang, 2013; Bonachea, 2014), is deze ook beperkt tot de lijsten met kandidaat-genen.
Whole exome sequencing (WES) is een sequencingtechnologie van de volgende generatie die de sequentiebepaling van alle tot expressie gebrachte genen mogelijk maakt. Onze groep heeft, naast verschillende anderen (LaHaye, 2016; Gordon, 2022), WES-technologie gebruikt voor het ontdekken van CHD-genen. Onze groep is overgegaan tot het gebruik van hele genoomsequencing (WGS), een sequentiëringstechnologie van de volgende generatie die de sequentiebepaling van al het genetische materiaal mogelijk maakt (inclusief genomische regio's waarvan de sequentie niet in WES is bepaald), in onze analyse voor CHD-genontdekking. Daarom kunnen deze sequencingmethoden worden toegepast op multiplexfamilies en cohorten van sporadische gevallen om genetische oorzaken van CHD op een onbevooroordeelde manier te identificeren. Genomische sequencing is afhankelijk van de technische en bio-informatica-bekwaamheid van het personeel dat de sequencing uitvoert en de datapijplijn controleert. Het Institute of Genomic Medicine van het Nationwide Children's Hospital (NCH) is technisch onderlegd en heeft een eigen krachtige datapijplijn ontwikkeld (Kelly, 2015). WGS is een krachtige genetische tool die geïsoleerd of in combinatie met andere soorten genetische analyse kan worden gebruikt om de opbrengst van deze onderzoeken te vergroten.
Studietype
Inschrijving (Geschat)
Contacten en locaties
Studiecontact
- Naam: Katherine M Spayde, MS, CGC
- Telefoonnummer: 614-355-6388
- E-mail: katherine.spayde@nationwidechildrens.org
Studie Locaties
-
-
Ohio
-
Columbus, Ohio, Verenigde Staten, 43205
- Werving
- Nationwide Children's Hospital
-
Hoofdonderzoeker:
- Vidu Garg, MD
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
- Kind
- Volwassen
- Oudere volwassene
Accepteert gezonde vrijwilligers
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Onderwerpen moeten een diagnose van aangeboren hartaandoening hebben of gerelateerd zijn aan personen met aangeboren hartaandoening.
Uitsluitingscriteria:
- Gezonde personen die geen verband houden met mensen met een aangeboren hartaandoening
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
---|---|
Bestudeer onderwerpen
Personen met een aangeboren hartaandoening en familieleden met of zonder aangeboren hartaandoening.
Voor alle deelnemers aan de studie is een bloedafname vereist.
|
Bloedafname voor directe sequentiëring, microarray, single-nucleotide polymorfisme, vergelijkende genomische hybridisatie-DNA-analyses van hele genoomarrays en/of volledige exoom- of genoomsequencing.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
---|---|---|
Identificatie van nieuwe genetische bijdragers aan aangeboren hartafwijkingen
Tijdsspanne: tot 3 jaar, vanaf de datum van de genetische analyse tot de voltooiing van de analyse van de genetische gegevens of de identificatie van nieuwe genetische bijdragers, afhankelijk van wat zich het eerst voordoet
|
Nieuwe genetische afwijkingen waarvan is vastgesteld dat ze verband houden met aangeboren hartafwijkingen bij mensen
|
tot 3 jaar, vanaf de datum van de genetische analyse tot de voltooiing van de analyse van de genetische gegevens of de identificatie van nieuwe genetische bijdragers, afhankelijk van wat zich het eerst voordoet
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Vidu Garg, MD, The Research Institute at Nationwide Children's Hospital
Publicaties en nuttige links
Algemene publicaties
- Yasuhara J, Garg V. Genetics of congenital heart disease: a narrative review of recent advances and clinical implications. Transl Pediatr. 2021 Sep;10(9):2366-2386. doi: 10.21037/tp-21-297.
- Choudhury TZ, Garg V. Molecular genetic mechanisms of congenital heart disease. Curr Opin Genet Dev. 2022 Aug;75:101949. doi: 10.1016/j.gde.2022.101949. Epub 2022 Jul 8.
- Pan H, Richards AA, Zhu X, Joglar JA, Yin HL, Garg V. A novel mutation in LAMIN A/C is associated with isolated early-onset atrial fibrillation and progressive atrioventricular block followed by cardiomyopathy and sudden cardiac death. Heart Rhythm. 2009 May;6(5):707-10. doi: 10.1016/j.hrthm.2009.01.037. Epub 2009 Feb 4. No abstract available.
- Maitra M, Koenig SN, Srivastava D, Garg V. Identification of GATA6 sequence variants in patients with congenital heart defects. Pediatr Res. 2010 Oct;68(4):281-5. doi: 10.1203/PDR.0b013e3181ed17e4.
- Schluterman MK, Krysiak AE, Kathiriya IS, Abate N, Chandalia M, Srivastava D, Garg V. Screening and biochemical analysis of GATA4 sequence variations identified in patients with congenital heart disease. Am J Med Genet A. 2007 Apr 15;143A(8):817-23. doi: 10.1002/ajmg.a.31652.
- Garg V, Muth AN, Ransom JF, Schluterman MK, Barnes R, King IN, Grossfeld PD, Srivastava D. Mutations in NOTCH1 cause aortic valve disease. Nature. 2005 Sep 8;437(7056):270-4. doi: 10.1038/nature03940. Epub 2005 Jul 17.
- Garg V, Kathiriya IS, Barnes R, Schluterman MK, King IN, Butler CA, Rothrock CR, Eapen RS, Hirayama-Yamada K, Joo K, Matsuoka R, Cohen JC, Srivastava D. GATA4 mutations cause human congenital heart defects and reveal an interaction with TBX5. Nature. 2003 Jul 24;424(6947):443-7. doi: 10.1038/nature01827. Epub 2003 Jul 6.
- Bonachea EM, Chang SW, Zender G, LaHaye S, Fitzgerald-Butt S, McBride KL, Garg V. Rare GATA5 sequence variants identified in individuals with bicuspid aortic valve. Pediatr Res. 2014 Aug;76(2):211-6. doi: 10.1038/pr.2014.67. Epub 2014 May 5.
- Bonachea EM, Zender G, White P, Corsmeier D, Newsom D, Fitzgerald-Butt S, Garg V, McBride KL. Use of a targeted, combinatorial next-generation sequencing approach for the study of bicuspid aortic valve. BMC Med Genomics. 2014 Sep 26;7:56. doi: 10.1186/1755-8794-7-56.
- LaHaye S, Corsmeier D, Basu M, Bowman JL, Fitzgerald-Butt S, Zender G, Bosse K, McBride KL, White P, Garg V. Utilization of Whole Exome Sequencing to Identify Causative Mutations in Familial Congenital Heart Disease. Circ Cardiovasc Genet. 2016 Aug;9(4):320-9. doi: 10.1161/CIRCGENETICS.115.001324. Epub 2016 Jul 14.
- Bennett JS, Gordon DM, Majumdar U, Lawrence PJ, Matos-Nieves A, Myers K, Kamp AN, Leonard JC, McBride KL, White P, Garg V. Use of machine learning to classify high-risk variants of uncertain significance in lamin A/C cardiac disease. Heart Rhythm. 2022 Apr;19(4):676-685. doi: 10.1016/j.hrthm.2021.12.019. Epub 2021 Dec 24.
- Chang SW, Mislankar M, Misra C, Huang N, Dajusta DG, Harrison SM, McBride KL, Baker LA, Garg V. Genetic abnormalities in FOXP1 are associated with congenital heart defects. Hum Mutat. 2013 Sep;34(9):1226-30. doi: 10.1002/humu.22366. Epub 2013 Jul 11.
- Gordon DM, Cunningham D, Zender G, Lawrence PJ, Penaloza JS, Lin H, Fitzgerald-Butt SM, Myers K, Duong T, Corsmeier DJ, Gaither JB, Kuck HC, Wijeratne S, Moreland B, Kelly BJ; Baylor-Johns Hopkins Center for Mendelian Genomics; Garg V, White P, McBride KL. Exome sequencing in multiplex families with left-sided cardiac defects has high yield for disease gene discovery. PLoS Genet. 2022 Jun 23;18(6):e1010236. doi: 10.1371/journal.pgen.1010236. eCollection 2022 Jun.
- Yasuhara J, Manivannan SN, Majumdar U, Gordon DM, Lawrence PJ, Aljuhani M, Myers K, Stiver C, Bigelow AM, Galantowicz M, Yamagishi H, McBride KL, White P, Garg V. Novel pathogenic GATA6 variant associated with congenital heart disease, diabetes mellitus and necrotizing enterocolitis. Pediatr Res. 2023 Sep 12. doi: 10.1038/s41390-023-02811-y. Online ahead of print.
- Manivannan SN, Darouich S, Masmoudi A, Gordon D, Zender G, Han Z, Fitzgerald-Butt S, White P, McBride KL, Kharrat M, Garg V. Novel frameshift variant in MYL2 reveals molecular differences between dominant and recessive forms of hypertrophic cardiomyopathy. PLoS Genet. 2020 May 26;16(5):e1008639. doi: 10.1371/journal.pgen.1008639. eCollection 2020 May.
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start
Primaire voltooiing (Geschat)
Studie voltooiing (Geschat)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Geschat)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
- genetica
- DNA
- Aangeboren hartafwijkingen
- enkelvoudig nucleotide polymorfisme
- gen
- volledige exome-sequencing
- sequentiebepaling van het hele genoom
- geboorteafwijking
- microarray
- exome-sequencing
- directe volgorde
- hele genoomarray vergelijkende genomische hybridisatie
- wijziging van het aantal chromosomale kopieën
- nucleotide sequentie variatie
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- IRB09-00339
- R01HL109758-03 (Subsidie/contract van de Amerikaanse NIH)
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .
Klinische onderzoeken op Aangeboren hartafwijkingen
-
University Hospital TuebingenVoltooidHeart Assist-apparaatDuitsland
-
University of ChicagoVoltooidHartfalen | Heart Assist-apparaat | HyponatremischVerenigde Staten
-
Carmel Medical CenterOnbekendPneumoperitoneum | Heart Output StoornisIsraël
-
Region SkaneAanmelden op uitnodigingHartfalen New York Heart Association (NYHA) Klasse II | Hartfalen New York Heart Association (NYHA) Klasse IIIZweden
-
Medical University of BialystokInstitute of Cardiology, Warsaw, Poland; Medical University of Lodz; Poznan University... en andere medewerkersNog niet aan het wervenHartfalen, systolisch | Hartfalen met verminderde ejectiefractie | Hartfalen New York Heart Association Klasse IV | Hartfalen New York Heart Association Klasse IIIPolen
-
Triple-Gene, LLCIntrexon Corporation; Precigen, IncVoltooidHart-en vaatziekten | Hartfalen | Heart-Assist-apparaatVerenigde Staten
-
University of WashingtonAmerican Heart AssociationVoltooidHartfalen, congestief | Mitochondriale verandering | Hartfalen New York Heart Association Klasse IVVerenigde Staten
-
Novartis PharmaceuticalsVoltooidPatiënten die de behandelingsperiode van 12 maanden van de kernstudie met succes hebben afgerond (de Novo Heart-ontvangers) die geïnteresseerd waren om behandeld te worden met EC-MPS
Klinische onderzoeken op Verzameling van bloedmonsters
-
Hillel Yaffe Medical CenterOnbekend
-
Teal Health, Inc.Actief, niet wervendHumaan papillomavirus | Infectie met humaan papillomavirus type 16 | Infectie met humaan papillomavirus type 18Verenigde Staten
-
Acorai ABWerving
-
Cliniques universitaires Saint-Luc- Université...Université de LiègeWervingTaaislijmziekte | BiomarkersBelgië
-
Rutgers, The State University of New JerseyNational Cancer Institute (NCI)WervingPeritoneale carcinomatose | Neoplasmata van het spijsverteringsstelsel | Lever en intrahepatisch galwegcarcinoom | Bijlage Carcinoom door AJCC V8 Stage | Colorectaal carcinoom door AJCC V8 Stage | Slokdarmcarcinoom door AJCC V8 Stage | Maagcarcinoom door AJCC V8 StageVerenigde Staten
-
Memorial Sloan Kettering Cancer CenterVoltooidProstaatkankerVerenigde Staten
-
Marmara UniversityVoltooid
-
University of MinnesotaNational Institute on Drug Abuse (NIDA)VoltooidStoornis in het gebruik van middelenVerenigde Staten