Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Trio-sequencing van het hele genoom als een standaard routinetest bij patiënten met zeldzame ziekten - "GENOME FIRST APPROACH"

17 oktober 2022 bijgewerkt door: University Hospital Tuebingen
Het GENOME FIRST APPROACH-project zal patiënten (n = 450) en hun gezonde ouders met onduidelijke moleculaire oorzaak van de ziekte, vermoedelijke genetische oorzaak van de ziekte en de gezonde ouders van de getroffenen inschrijven voor trio-analyse (N in totaal 1350).

Studie Overzicht

Toestand

Voltooid

Conditie

Interventie / Behandeling

Gedetailleerde beschrijving

In het GENOME FIRST APPROACH-project (monocentrisch, prospectief, open-label diagnostisch) zullen patiënten met moleculair niet-gediagnosticeerde ziekten diagnostisch worden geanalyseerd door middel van Whole Genome Sequencing (WGS)-trio-analyse. De volgende vragen zullen leidend zijn in het project:

Primair:

• Werkzaamheid van WGS-trioanalyse bij verschillende klinische indicaties

Ondergeschikt:

  • WGS-analyse systematisch benchmarken om genetische variaties te detecteren in vergelijking met WES en single nucleotide polymorphism (SNP) array-analyse,
  • Breid de analyse uit van coderende single-nucleotide varianten (SNV's) naar regulerende mutaties, structurele varianten (SV's) en regio's met een lage complexiteit,
  • Valideer de werkzaamheid van klinische genoomtrio-sequencing in een routinematige diagnostische setting,
  • Analyseer of 42x-dekking het potentieel heeft om mozaïekvorming als ziekteverwekkend mechanisme te ontdekken,
  • Verder ontwikkelen van algoritmen voor integratieve analyses van Trio-WGS data met Ribonucleic acid-sequencing (RNA-seq),
  • Identificeer de novo veranderingen en nieuwe ziektemechanismen,
  • Krijg fundamentele nieuwe inzichten in ziektemechanismen en celbiologie,
  • Combineer WGS met andere Omics-methoden om de genetische diagnostiek van toekomstige patiënten met een zeldzame ziekte te verbeteren, en
  • Verken de totale financiële kosten en tijd om overtuigende gegevens aan de patiënten van de Trio-WGS-benadering te rapporteren in vergelijking met traditionele meerstaps diagnostische benaderingen met behulp van single-gene, panel, whole-exome sequencing (WES) en chromosomale microarray (CMA) (SNP array, array -gebaseerde vergelijkende genomische hybridisatie (arrayCGH)) analyse.

Daarnaast zullen gezonde ouders van de proefpersonen worden betrokken bij het project om ouder-kind (trio)-analyses uit te voeren.

Studietype

Ingrijpend

Inschrijving (Werkelijk)

1350

Fase

  • Niet toepasbaar

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studie Locaties

  • Duitsland
      • Tübingen, Duitsland, 72076
        • University Hospital Tübingen

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

  • Kind
  • Volwassen
  • Oudere volwassene

Accepteert gezonde vrijwilligers

Nee

Geslachten die in aanmerking komen voor studie

Allemaal

Beschrijving

Inclusiecriteria:

  • Onduidelijke moleculaire oorzaak van de ziekte
  • Vermoedelijke genetische oorzaak van de ziekte
  • Gezonde ouders van getroffenen voor trio-analyse Cohort 1: IQ < 70 met en zonder misvormingen, syndromaal en niet-syndromaal Cohort 2: Retinitis pigmentosa, achromatopsie, syndroom van Bardet-Biedl, syndroom van Usher, congenitale stationaire nachtblindheid, LCA, maculadegeneratie, staaf-/kegeldystrofieën, opticus-atrofie Cohort 3: Zeldzame pediatrische solide kankers zoals melanoom, carcinoom van het maagdarmkanaal, tumoren van de speekselklier en pancreastumoren bij kinderen.

Uitsluitingscriteria:

Cohort 1: Toxische oorzaken (medicijnen, infecties) Cohort 2: patiënten met niet-genetische vormen van blindheid Cohort 3: kanker bij volwassenen, bloedkanker

  • Ontbrekende geïnformeerde toestemming van de patiënt/wettelijke voogd
  • Ontbrekende monsters van beide ouders
  • Vorige WES- of panelanalyse-

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

  • Primair doel: Fundamentele wetenschap
  • Toewijzing: Niet-gerandomiseerd
  • Interventioneel model: Parallelle opdracht
  • Masker: Geen (open label)

Wapens en interventies

Deelnemersgroep / Arm
Interventie / Behandeling
Ander: Cohort 1: verstandelijke beperking
Genetisch: WGS Diagnostic Bloedafname voor genetische diagnostiek.
Genetisch: WGS-Diagnostiek
Bloedafname, shot klinische karakterisering, WGS-gebaseerde trio-sequencing, NGS-analyse en andere omics-analyse (transcriptomics, proteomics, metabolomics), functionele celbiologische studies (bijvoorbeeld in fibroblastculturen), RNA-seq.
Ander: Cohort 2 Netvliesaandoeningen
Genetisch: WGS Diagnostic Bloedafname voor genetische diagnostiek.
Genetisch: WGS-Diagnostiek
Bloedafname, shot klinische karakterisering, WGS-gebaseerde trio-sequencing, NGS-analyse en andere omics-analyse (transcriptomics, proteomics, metabolomics), functionele celbiologische studies (bijvoorbeeld in fibroblastculturen), RNA-seq.
Ander: Cohort 3: Zeldzame tumoren in de kindertijd
Genetisch: WGS Diagnostic Bloedafname voor genetische diagnostiek.
Genetisch: WGS-Diagnostiek
Bloedafname, shot klinische karakterisering, WGS-gebaseerde trio-sequencing, NGS-analyse en andere omics-analyse (transcriptomics, proteomics, metabolomics), functionele celbiologische studies (bijvoorbeeld in fibroblastculturen), RNA-seq.

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Volledige genomische sequentieanalyse uitgevoerd door Whole Genome Sequencing (WGS)
Tijdsspanne: Dag 1
Aantal genomische varianten bij ouders met ziekte en gezondheid door WGS (a Next-Generation Sequencing Technology, NGS)
Dag 1

Secundaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Genoomsequencing
Tijdsspanne: Dag 1
Verificatie van de genetische oorzaken van onduidelijke genetische ziekten door klinische genoomsequencing
Dag 1
Nieuwe wijzigingen
Tijdsspanne: Dag 1
Aantal de novo wijzigingen in het genoom van de geregistreerde populatie
Dag 1

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Sponsor

University Hospital Tuebingen

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Werkelijk)

1 oktober 2019

Primaire voltooiing (Werkelijk)

1 oktober 2022

Studie voltooiing (Werkelijk)

1 oktober 2022

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

9 mei 2019

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

16 mei 2019

Eerst geplaatst (Werkelijk)

17 mei 2019

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Werkelijk)

18 oktober 2022

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

17 oktober 2022

Laatst geverifieerd

1 oktober 2022

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Trefwoorden

Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden

Andere studie-ID-nummers

  • WG-Trio01

Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)

Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?

Nee

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

Klinische onderzoeken op Zeldzame ziekten

Klinische onderzoeken op WGS-Diagnostiek

Zoek naar vergelijkbare onderzoeken

Sponsors en medewerkers

Medische omstandigheden

Geneesmiddelinterventies

CROs by country

CROs in Kyrgyzstan

Voorwaarden

Zeldzame ziekten

Geneesmiddelinterventies

Voedingssupplementen

Sponsor / medewerkers

Locaties

3
Abonneren