Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Whole Genome Trio Sequencing som en standard rutinetest hos patienter med sjældne sygdomme - "GENOME FIRST APPROACH"

17. oktober 2022 opdateret af: University Hospital Tuebingen
GENOME FIRST APPROACH-projektet vil indskrive patienter (n = 450) og deres raske forældre med uklar molekylær årsag til sygdommen, formodet genetisk årsag til sygdommen og de raske forældre til de ramte til trioanalyse (N i alt 1350).

Studieoversigt

Status

Afsluttet

Betingelser

Intervention / Behandling

Detaljeret beskrivelse

I GENOME FIRST APPROACH-projektet (monocentric, prospective, open-label diagnostic) vil patienter med molekylært udiagnosticerede sygdomme blive analyseret diagnostisk ved Whole Genome Sequencing (WGS)-trio-analyse. Følgende spørgsmål vil lede projektet:

Primær:

• Effektivitet af WGS trio-analyse i forskellige kliniske indikationer

Sekundær:

  • Systematisk benchmark WGS-analyse for at detektere genetiske variationer sammenlignet med WES og single nucleotide polymorphism (SNP) array-analyse,
  • Udvid analysen fra kodende enkeltnukleotidvarianter (SNV'er) til regulatoriske mutationer, strukturelle varianter (SV'er) og regioner med lav kompleksitet,
  • Validere effektiviteten af ​​klinisk genomtrio-sekventering i en rutinemæssig diagnostisk indstilling,
  • Analyser om 42x dækning har potentialet til at opdage mosaicisme som sygdomsfremkaldende mekanisme,
  • Videreudvikle algoritmer til integrative analyser af Trio-WGS data med Ribonukleinsyre-sekventering (RNA-seq),
  • Identificer de novo ændringer og nye sygdomsmekanismer,
  • Få grundlæggende ny indsigt i sygdomsmekanismer og cellulær biologi,
  • Kombiner WGS med yderligere Omics-metoder for at forbedre genetisk diagnostik af fremtidige patienter med sjældne sygdomme, og
  • Udforsk overordnede økonomiske omkostninger og tid til at rapportere afgørende data til patienterne i Trio-WGS-tilgangen sammenlignet med traditionelle flertrinsdiagnostiske tilgange ved hjælp af enkelt-gen, panel, hel-eksom-sekventering (WES) og kromosomalt mikroarray (CMA) (SNP-array, array) -baseret komparativ genomisk hybridisering (arrayCGH)) analyse.

Derudover vil raske forældre til forsøgspersonerne indgå i projektet for at udføre forældre-barn (trio) analyser.

Undersøgelsestype

Interventionel

Tilmelding (Faktiske)

1350

Fase

  • Ikke anvendelig

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiesteder

  • Tyskland
      • Tübingen, Tyskland, 72076
        • University Hospital Tübingen

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

  • Barn
  • Voksen
  • Ældre voksen

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Køn, der er berettiget til at studere

Alle

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • Uklar molekylær årsag til sygdommen
  • Mistænkt genetisk årsag til sygdommen
  • Raske forældre til de ramte til trioanalyse Kohorte 1: IQ < 70 med og uden misdannelser, syndromisk og ikke-syndromisk Kohorte 2: Retinitis pigmentosa, achromatopsy, Bardet-Biedl syndrom, Usher syndrom, medfødt stationær natteblindhed, LCA, macula degeneration, stav/kegledystrofier, opticusatrofi Kohorte 3: Sjældne pædiatriske solide kræftformer som melanom, karcinom i mave-tarmkanalen, tumorer i spytkirtlen og bugspytkirteltumorer hos børn.

Ekskluderingskriterier:

Kohorte 1: Giftige årsager (stoffer, infektioner) Kohorte 2: patienter med ikke-genetiske former for blindhed Kohorte 3: kræft hos voksne, blodkræft

  • Manglende informeret samtykke fra patient/værge
  • Manglende prøver af begge forældre
  • Tidligere WES eller panelanalyse-

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

  • Primært formål: Grundvidenskab
  • Tildeling: Ikke-randomiseret
  • Interventionel model: Parallel tildeling
  • Maskning: Ingen (Åben etiket)

Våben og indgreb

Deltagergruppe / Arm
Intervention / Behandling
Andet: Kohorte 1: Intellektuel funktionsnedsættelse
Genetisk: WGS Diagnostisk Blodtagning til genetisk diagnostik.
Genetisk: WGS-Diagnostic
Blodprøvetagning, klinisk karakterisering af skud, WGS-baseret trio-sekventering, NGS-analyse og anden omics-analyse (transcriptomics, proteomics, metabolomics), funktionelle cellebiologiske undersøgelser (f.eks. i fibroblastkulturer), RNA-seq.
Andet: Kohorte 2 Nethindesygdomme
Genetisk: WGS Diagnostisk Blodtagning til genetisk diagnostik.
Genetisk: WGS-Diagnostic
Blodprøvetagning, klinisk karakterisering af skud, WGS-baseret trio-sekventering, NGS-analyse og anden omics-analyse (transcriptomics, proteomics, metabolomics), funktionelle cellebiologiske undersøgelser (f.eks. i fibroblastkulturer), RNA-seq.
Andet: Kohorte 3: Sjældne tumorer i barndommen
Genetisk: WGS Diagnostisk Blodtagning til genetisk diagnostik.
Genetisk: WGS-Diagnostic
Blodprøvetagning, klinisk karakterisering af skud, WGS-baseret trio-sekventering, NGS-analyse og anden omics-analyse (transcriptomics, proteomics, metabolomics), funktionelle cellebiologiske undersøgelser (f.eks. i fibroblastkulturer), RNA-seq.

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Fuld genomisk sekvensanalyse udført af Whole Genome Sequencing (WGS)
Tidsramme: Dag 1
Antal genomiske varianter hos sygdoms- og sundhedsforældre af WGS (a Next-Generation Sequencing Technology, NGS)
Dag 1

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Genom sekventering
Tidsramme: Dag 1
Verifikation af de genetiske årsager til uklare genetiske sygdomme ved klinisk genomsekventering
Dag 1
De nye ændringer
Tidsramme: Dag 1
Antal de novo ændringer i genomet af den indskrevne befolkning
Dag 1

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Sponsor

University Hospital Tuebingen

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

1. oktober 2019

Primær færdiggørelse (Faktiske)

1. oktober 2022

Studieafslutning (Faktiske)

1. oktober 2022

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

9. maj 2019

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

16. maj 2019

Først opslået (Faktiske)

17. maj 2019

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

18. oktober 2022

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

17. oktober 2022

Sidst verificeret

1. oktober 2022

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Nøgleord

Yderligere relevante MeSH-vilkår

Andre undersøgelses-id-numre

  • WG-Trio01

Plan for individuelle deltagerdata (IPD)

Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?

Ingen

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Sjældne sygdomme

Kliniske forsøg med WGS-Diagnostic

Søg i lignende forsøg

Sponsorer og samarbejdspartnere

Medicinske tilstande

Narkotikainterventioner

CROs by country

CROs in Montenegro

Betingelser

Sjældne sygdomme

Narkotikainterventioner

Kosttilskud

Sponsor / samarbejdspartnere

Placeringer

Abonner