Secuenciación de tríos del genoma completo como prueba estándar de rutina en pacientes con enfermedades raras: "GENOMA PRIMERO ENFOQUE"

En el proyecto GENOME FIRST APPROACH (diagnóstico monocéntrico, prospectivo y abierto), los pacientes con enfermedades no diagnosticadas molecularmente serán analizados mediante análisis de trío de secuenciación del genoma completo (WGS). Las siguientes preguntas guiarán el proyecto:

Primario:

• Eficacia del análisis del trío WGS en diferentes indicaciones clínicas

Secundario:

• Comparar sistemáticamente el análisis WGS para detectar variaciones genéticas en comparación con WES y el análisis de matriz de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP),
• Amplíe el análisis de la codificación de variantes de un solo nucleótido (SNV) a mutaciones reguladoras, variantes estructurales (SV) y regiones de baja complejidad.
• Validar la eficacia de la secuenciación del trío del genoma clínico en un entorno de diagnóstico de rutina,
• Analizar si la cobertura 42x tiene el potencial de descubrir el mosaicismo como mecanismo causante de la enfermedad.
• Seguir desarrollando algoritmos para análisis integradores de datos Trio-WGS con secuenciación de ácido ribonucleico (RNA-seq),
• Identificar alteraciones de novo y nuevos mecanismos de enfermedad,
• Obtenga nuevos conocimientos fundamentales sobre los mecanismos de la enfermedad y la biología celular,
• Combine WGS con otros métodos Omics para mejorar el diagnóstico genético de futuros pacientes con enfermedades raras, y
• Explore los costos financieros generales y el tiempo para informar datos concluyentes a los pacientes del enfoque Trio-WGS en comparación con los enfoques de diagnóstico tradicionales de varios pasos que utilizan un solo gen, panel, secuenciación del exoma completo (WES) y micromatriz cromosómica (CMA) (matriz SNP, matriz análisis de hibridación genómica comparativa (arrayCGH)).

Además, los padres sanos de los sujetos se incluirán en el proyecto para realizar análisis de padres e hijos (trío).