Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Полногеномное трио-секвенирование как стандартный рутинный тест у пациентов с редкими заболеваниями — «ПЕРВЫЙ ПОДХОД GENOME»

17 октября 2022 г. обновлено: University Hospital Tuebingen
В проект GENOME FIRST APPROACH будут включены пациенты (n = 450) и их здоровые родители с неясной молекулярной причиной заболевания, предполагаемой генетической причиной заболевания и здоровые родители пострадавших для анализа трио (всего N 1350).

Обзор исследования

Статус

Завершенный

Условия

Вмешательство/лечение

Подробное описание

В рамках проекта GENOME FIRST APPROACH (моноцентрическая, проспективная, открытая диагностика) пациенты с молекулярно недиагностированными заболеваниями будут подвергаться диагностическому анализу с помощью полногеномного секвенирования (WGS)-триоанализа. Ведущими проектами будут следующие вопросы:

Начальный:

• Эффективность трио-анализа WGS при различных клинических показаниях

Вторичный:

  • Систематически сравнивать анализ WGS для обнаружения генетических вариаций по сравнению с WES и матричным анализом полиморфизма одиночных нуклеотидов (SNP),
  • Расширить анализ от кодирования однонуклеотидных вариантов (SNV) до регуляторных мутаций, структурных вариантов (SV) и областей низкой сложности,
  • Подтвердить эффективность клинического трио-секвенирования генома в рутинных диагностических условиях,
  • Проанализируйте, может ли охват 42x обнаружить мозаицизм как механизм, вызывающий заболевание,
  • Дальнейшая разработка алгоритмов интегративного анализа данных Trio-WGS с секвенированием рибонуклеиновой кислоты (RNA-seq),
  • Выявить изменения de novo и новые механизмы заболевания,
  • Получите принципиально новое представление о механизмах заболеваний и клеточной биологии,
  • Объедините WGS с другими методами Omics для улучшения генетической диагностики будущих пациентов с редкими заболеваниями и
  • Изучите общие финансовые затраты и время, чтобы сообщить пациентам окончательные данные подхода Trio-WGS по сравнению с традиционными многоэтапными диагностическими подходами с использованием одногенного, панельного, полноэкзомного секвенирования (WES) и хромосомного микрочипа (CMA) (матрица SNP, массив анализ на основе сравнительной геномной гибридизации (arrayCGH).

Кроме того, здоровые родители субъектов будут включены в проект для проведения анализов родитель-ребенок (трио).

Тип исследования

Интервенционный

Регистрация (Действительный)

1350

Фаза

  • Непригодный

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Места учебы

  • Германия
      • Tübingen, Германия, 72076
        • University Hospital Tübingen

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

  • Ребенок
  • Взрослый
  • Пожилой взрослый

Принимает здоровых добровольцев

Нет

Полы, имеющие право на обучение

Все

Описание

Критерии включения:

  • Неясная молекулярная причина заболевания
  • Подозрение на генетическую причину заболевания
  • Здоровые родители пострадавших для анализа трио Когорта 1: IQ < 70 с пороками развития и без них, синдромальные и несиндромальные Когорта 2: пигментный ретинит, ахроматопсия, синдром Барде-Бидля, синдром Ашера, врожденная стационарная куриная слепота, LCA, дегенерация желтого пятна, палочко-колбочковая дистрофия, атрофия зрительного нерва Когорта 3: редкие педиатрические солидные раки, такие как меланома, карцинома желудочно-кишечного тракта, опухоли слюнных желез и опухоли поджелудочной железы у детей.

Критерий исключения:

Группа 1: Токсические причины (лекарства, инфекции) Группа 2: пациенты с негенетическими формами слепоты Группа 3: рак у взрослых, рак крови

  • Отсутствие информированного согласия пациента/законного опекуна
  • Отсутствуют образцы обоих родителей
  • Предыдущий WES или панельный анализ-

Учебный план

В этом разделе представлена ​​подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

  • Основная цель: Фундаментальная наука
  • Распределение: Нерандомизированный
  • Интервенционная модель: Параллельное назначение
  • Маскировка: Нет (открытая этикетка)

Оружие и интервенции

Группа участников / Армия
Вмешательство/лечение
Другой: Когорта 1: умственная отсталость
Генетика: WGS Diagnostic Кровь берут для генетической диагностики.
Генетический: WGS-Диагностика
Забор крови, клиническая характеристика снимков, трио-секвенирование на основе WGS, анализ NGS и другие омики-анализы (транскриптомика, протеомика, метаболомика), исследования функциональной клеточной биологии (например, в культурах фибробластов), секвенирование РНК.
Другой: Когорта 2 Заболевания сетчатки
Генетика: WGS Diagnostic Кровь берут для генетической диагностики.
Генетический: WGS-Диагностика
Забор крови, клиническая характеристика снимков, трио-секвенирование на основе WGS, анализ NGS и другие омики-анализы (транскриптомика, протеомика, метаболомика), исследования функциональной клеточной биологии (например, в культурах фибробластов), секвенирование РНК.
Другой: Когорта 3: редкие опухоли в детском возрасте
Генетика: WGS Diagnostic Кровь берут для генетической диагностики.
Генетический: WGS-Диагностика
Забор крови, клиническая характеристика снимков, трио-секвенирование на основе WGS, анализ NGS и другие омики-анализы (транскриптомика, протеомика, метаболомика), исследования функциональной клеточной биологии (например, в культурах фибробластов), секвенирование РНК.

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Полный анализ геномной последовательности, проведенный методом полногеномного секвенирования (WGS)
Временное ограничение: 1 день
Количество геномных вариантов у больных и здоровых родителей по WGS (технология секвенирования следующего поколения, NGS)
1 день

Вторичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Секвенирование генома
Временное ограничение: 1 день
Верификация генетических причин неясных генетических заболеваний с помощью клинического секвенирования генома
1 день
Изменения de novo
Временное ограничение: 1 день
Количество изменений de novo в геноме включенного населения
1 день

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Спонсор

University Hospital Tuebingen

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования (Действительный)

1 октября 2019 г.

Первичное завершение (Действительный)

1 октября 2022 г.

Завершение исследования (Действительный)

1 октября 2022 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

9 мая 2019 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

16 мая 2019 г.

Первый опубликованный (Действительный)

17 мая 2019 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (Действительный)

18 октября 2022 г.

Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества

17 октября 2022 г.

Последняя проверка

1 октября 2022 г.

Дополнительная информация

Термины, связанные с этим исследованием

Ключевые слова

Дополнительные соответствующие термины MeSH

Другие идентификационные номера исследования

  • WG-Trio01

Планирование данных отдельных участников (IPD)

Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?

Нет

Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы

Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.

Нет

Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.

Нет

Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .

Клинические исследования WGS-Диагностика

Искать похожие исследования

Спонсоры и соавторы

Заболевания

Медикаментозные вмешательства

CROs by country

CROs in Estonia

Заболевания

Редкие заболевания

Медикаментозные вмешательства

Пищевые добавки

Спонсор / Соавторы

Места

Подписаться